Metagenomics Neste generasjons sekvenseringstilnærming for å oppdage mikrobiell DNA/RNA overtid hos individer som gjennomgår hematopoietisk stamcelletransplantasjon

Studiebeskrivelse:

Infeksjoner er en viktig årsak til sykelighet og dødelighet hos pasienter som gjennomgår hematopoietisk stamcelletransplantasjon (HSCT). Hensikten med denne studien er å evaluere om metagenomisk neste generasjons sekvensering (MNG) kan oppdage mikrobielle signaturer hos personer som gjennomgår HSCT, og om mikrobiell identifikasjon kan korreleres med kliniske trekk ved infeksjon (f.eks. Feber).

Deltakere som gjennomgår HSCT som en del av andre studier ved NIH Clinical Center (CC) vil gi blod før transplantasjonen og gjennom 6 måneder etter. Total nukleinsyre vil bli ekstrahert fra plasma og utsatt for MNG -er.

Mål:

Primær:

For å undersøke om ved å bruke plasma og en MNGS -tilnærming, kan vi oppdage bakteriell, sopp, protozoan eller viralt DNA/RNA over tid, hos immunkompromitterte pasienter som gjennomgår transplantasjon.

Sekundær:

1. Å korrelere mikrobiell identifikasjon med episoder med feber eller klinisk mistanke om infeksjon.
2. For å korrelere endring i mikrobielle signaturer hos pasienter med mistenkt inflammatorisk syndrom for immunrekonstitusjon.

Sluttpunkter:

Primær:

Sammenligning av MNG -resultater til rutinemessige kliniske testresultater (mikrobiologi og/eller patologi)

Sekundær:

1. Beregning av frekvenser av forskjellige mikrobielle identifikasjoner når det gjelder utvikling av feber eller mikrobiologisk/klinisk definert infeksjon.
2. Endringer i forskjellige mikrobielle signaturer over tid