Metagenomics volgende generatie sequencing-benadering om microbiële DNA/RNA-overuren te detecteren bij personen die hematopoietische stamceltransplantatie ondergaan

Studiebeschrijving:

Infecties zijn een belangrijke oorzaak van morbiditeit en mortaliteit bij patiënten die hematopoietische stamceltransplantatie (HSCT) ondergaan. Het doel van deze studie is om te evalueren of metagenomische sequencing van de volgende generatie (MNGS) microbiële handtekeningen kan detecteren bij mensen die HSCT ondergaan, en als microbiële identificatie kan worden gecorreleerd met klinische kenmerken van infectie (bijv. Koorts).

Deelnemers die HSCT ondergaan als onderdeel van andere studies aan het NIH Clinical Center (CC), leveren bloed voor de transplantatie en gedurende 6 maanden daarna. Totaal nucleïnezuur zal worden geëxtraheerd uit plasma en worden onderworpen aan MNG's.

Doelstellingen:

Primair:

Om te onderzoeken of door het gebruik van plasma en een MNGS -benadering, kunnen we bacteriële, schimmel, protozoa of virale DNA/RNA in de loop van de tijd detecteren bij immuungecompromitteerde patiënten die transplantatie ondergaan.

Secundair:

1. Om microbiële identificatie te correleren met afleveringen van koorts of klinisch vermoeden van infectie.
2. Om verandering in microbiële handtekeningen te correleren bij patiënten met een vermoedelijk immuunreconstitution inflammatoire syndroom.

Eindpunten:

Primair:

Vergelijking van MNGS -resultaten met routinematige klinische testresultaten (microbiologie en/of pathologie)

Secundair:

1. Berekening van frequenties van verschillende microbiële identificaties met betrekking tot de ontwikkeling van koorts of microbiologisch/klinisch gedefinieerde infectie.
2. Veranderingen in verschillende microbiële handtekeningen in de loop van de tijd