Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Integracyjne profilowanie osobistej Omiki w celu monitorowania dynamicznych fenotypów molekularnych podczas suplementacji błonnikiem

9 stycznia 2021 zaktualizowane przez: Michael Snyder, Stanford University
Badacze proponują kompleksowe, multiomiczne badanie, które połączy dane podłużne związane ze zmianami w określonych bakteriach jelitowych i gospodarzu w odpowiedzi na suplementację błonnika prebiotycznego. Dane te poprowadzą rozwój zintegrowanej sygnatury biologicznej, łączącej metabolity pochodzenia bakteryjnego z wynikami biologicznymi u gospodarza.

Przegląd badań

Status

Zakończony

Warunki

Interwencja / Leczenie

Szczegółowy opis

W tym badaniu badacze proponują zebranie kohorty zdrowych osób, które otrzymają suplementację prebiotykami, podczas kompleksowej, podłużnej charakterystyki mikroflory i zmian gospodarza za pomocą markerów klinicznych i wielu testów omicznych. Te multiomiczne dane zostaną następnie zintegrowane, generując unikalne sygnatury biologiczne, które określają rolę, jaką metabolity drobnoustrojów z określonych bakterii odgrywają w aktywności biologicznej gospodarza. Dzięki tym badaniom badacze spodziewają się uzyskać szczegółowe i jasne zrozumienie zmian fizjologicznych na poziomie mechanistycznym, które zachodzą w mikrobiomie i gospodarzu w odpowiedzi na suplementację diety błonnikiem prebiotycznym.

Typ studiów

Interwencyjne

Zapisy (Rzeczywisty)

18

Faza

  • Nie dotyczy

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Lokalizacje studiów

  • Stany Zjednoczone
    • California
      • Stanford, California, Stany Zjednoczone, 94304
        • Stanford University

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

18 lat do 65 lat (Dorosły, Starszy dorosły)

Akceptuje zdrowych ochotników

Tak

Płeć kwalifikująca się do nauki

Wszystko

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • Dobry ogólny stan zdrowia

Kryteria wyłączenia:

  • Poziom cukru we krwi na czczo >126 mg/dl
  • Trójglicerydy >400 mg/dL
  • Niekontrolowane nadciśnienie
  • Choroba naczyniowa
  • Przewlekłe stany zapalne
  • Choroba głównych narządów
  • Intensywne używanie alkoholu
  • Ciąża/laktacja
  • Przebyta operacja bariatryczna
  • Aktywna choroba psychiczna
  • Stosowanie leków, o których wiadomo, że wpływają na metabolizm węglowodanów lub lipidów
  • Aktywne zaburzenie odżywiania

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

  • Główny cel: Podstawowa nauka
  • Przydział: Nie dotyczy
  • Model interwencyjny: Zadanie sekwencyjne
  • Maskowanie: Pojedynczy

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Mapowanie zmian mikroflory w odpowiedzi na interwencję prebiotyczną
Ramy czasowe: 3 lata

Zostanie opracowana szczegółowa mapa drobnoustrojów i zmian ekspresji genów drobnoustrojów podczas interwencji.

Złożoność mikroflory w próbkach kału zostanie określona za pomocą sekwencjonowania metagenomicznego strzelby. Nowe drobnoustroje i szlaki genowe zostaną zidentyfikowane przez składanie de novo całych metagenomów kału.
3 lata
Zmiany profilu lipidowego w odpowiedzi na interwencję prebiotyczną
Ramy czasowe: 3 lata
Analiza zmian profilu lipidowego uczestników interwencji prebiotycznej. Mierzone lipidy w mg/dl obejmują cholesterol całkowity, cholesterol LDL, cholesterol HDL i trójglicerydy.
3 lata

Miary wyników drugorzędnych

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Kompleksowy profil metagenomu podczas interwencji prebiotycznej
Ramy czasowe: 3 lata
Określone zostaną zmiany w profilu metagenomu gospodarza (człowieka) podczas interwencji prebiotycznej. Sekwencje DNA kału są analizowane przy użyciu potoków Humann2 i Metaphlan w celu wygenerowania wartości pokrycia szlaków, obfitości rodzin genów i obfitości taksonów {Franzosa, 2018}. Są one mapowane do bazy danych Human Microbiome Project w celu wyrównania.
3 lata
Kompleksowy profil transkryptomu podczas interwencji prebiotycznej
Ramy czasowe: 3 lata
Określone zostaną zmiany w profilu transkryptomu gospodarza (człowieka) podczas interwencji prebiotycznej. Odczyty RNA wyizolowanego z próbek PBMC dopasowuje się do hg38 przy użyciu programu Spliced ​​Transcripts Alignment to a Reference (STAR). Obfitość transkryptu oblicza się przy użyciu RNA-Seq przez maksymalizację oczekiwań (RSEM). Normalizacja częstotliwości transkrypcji i statystyki parami mierzące różnice w częstotliwości transkrypcji między punktami czasowymi są obliczane przy użyciu pakietu oprogramowania dla R firmy Bioconductor (DESeq2).
3 lata
Kompleksowy profil metabolomu podczas interwencji prebiotycznej
Ramy czasowe: 3 lata
Określone zostaną zmiany w profilu metabolomu gospodarza (człowieka) podczas interwencji prebiotycznej. Metabolity osocza są analizowane w kolumnach spektrometrów masowych (rozdzielanie HILIC i RPLC zarówno w trybie jonizacji dodatniej, jak i ujemnej). MetID i nasze dane MS/MS są wykorzystywane do identyfikacji 12740 metabolitów z poziomami ufności w zakresie od 1-3, gdzie 1 odpowiada MS/MS, czasowi retencji i m/z ze standardów na naszej platformie, 2 ma MS/MS i m/z pasuje z bazy danych, a 3 pasuje do m/z bazy danych.
3 lata
Kompleksowy profil cytokin podczas interwencji prebiotycznej
Ramy czasowe: 3 lata
Określone zostaną zmiany w profilu cytokin gospodarza (ludzkiego) podczas interwencji prebiotycznej. Cytokiny są profilowane przy użyciu systemu profilowania cytokin Luminex xMAP w Stanford Human Immune Monitoring Center. Obejmuje to przyłączanie przeciwciał specyficznych dla cytokin do kulek za pomocą cząsteczki wychwytującej. Cząsteczki fluorescencyjne są przyłączone do cytokin, a fluorescencja jest stosowana jako miara obfitości cytokin.
3 lata

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

Stanford University

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

15 października 2014

Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)

11 sierpnia 2017

Ukończenie studiów (Rzeczywisty)

11 sierpnia 2017

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

3 grudnia 2020

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

9 stycznia 2021

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

13 stycznia 2021

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

13 stycznia 2021

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

9 stycznia 2021

Ostatnia weryfikacja

1 stycznia 2021

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Inne numery identyfikacyjne badania

  • 1636

Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)

Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?

NIE

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Badania kliniczne na Suplementacja błonnika pokarmowego

Wyszukaj podobne próby

Sponsorzy i współpracownicy

Warunki medyczne

Interwencje lekowe

CROs by country

CROs in Kosovo

Warunki

Rzadkie choroby

Interwencje lekowe

Suplementy diety

Sponsor / Współpracownicy

Lokalizacje

3
Subskrybuj