Wirusowe biofilmy: przejmowanie macierzy pozakomórkowej komórek T w celu regulacji rozprzestrzeniania się wirusa HIV-1? (TRANSBioHIV)

Wstępne dane badaczy wskazują, że poza „wolnymi” zakaźnymi cząsteczkami wirusowymi, zakażone wirusem HIV-1 klastry różnicowania 4 (CD4+) wytwarzają również pozakomórkowe zespoły wirusowe owinięte w kokon macierzy pozakomórkowej i ściśle związane z powierzchnią komórki. Co ważne, struktury te są zakaźne, przenoszone do komórek docelowych w kontaktach międzykomórkowych i odgrywają kluczową rolę w rozprzestrzenianiu się wirusa HIV-1 między limfocytami T. Biofilm wirusowy HIV-1 może być ważny nie tylko dla bezpośredniego przenoszenia wirionów, ale także dla „transinfekcji”, procesu, który naszym celem jest:

• lepiej scharakteryzować skład molekularny i architekturę tego biofilmu (z wykorzystaniem metod proteomiki, obrazowania komórek w superrozdzielczości glikomicznej) pod kątem jego właściwości (infekcyjność, adhezyjność, ochrona wirionów) oraz określić, czy komórki zakażonych pacjentów wytwarzają takie struktury.
• określenie czynników wirusowych regulujących tworzenie tych nowych struktur zakaźnych (ze szczególnym uwzględnieniem Tat, Vpu i Nef HIV-1 kodowanych przy użyciu zmutowanych wirusów lub wektorów ekspresyjnych).
• zbadanie szlaków limfocytów regulujących tworzenie i skład wirusowych biofilmów w białkach macierzy pozakomórkowej (ECM) (z wykorzystaniem ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy (qPCR) i siRNA).
• w celu ustalenia, czy te biofilmy wirusowe biorą udział w przenoszeniu HIV-1 przez transfekcję
• zbadanie udziału tych zakaźnych struktur i dynamiki ich przenoszenia w węzłach chłonnych.

Projekt ten może przyczynić się do rozszyfrowania roli biofilmów wirusowych w przenoszeniu wirusa HIV-1. Ostatecznie zamierzamy ustalić, w jaki sposób ingerencja infekcji retrowirusowych w szlaki aktywacji komórek T moduluje wzór produkcji ECM przez komórki T, dostrajając skład biofilmu wirusowego i regulując rozprzestrzenianie się wirusa.