Viruksen biofilmit: T-solujen ekstrasellulaarisen matriisin kaappaaminen HIV-1:n leviämisen säätelemiseksi? (TRANSBioHIV)

Tutkijoiden alustavat tiedot osoittavat, että "vapaiden" tarttuvien viruspartikkelien lisäksi HIV-1-tartunnan saaneet 4-lymfosyyttien (CD4+) -lymfosyyttien klusterit tuottavat myös solunulkoisia viruskokoonpanoja, jotka on kääritty solunulkoisen matriisin koteloon ja jotka on tiukasti sidottu solun pintaan. Tärkeää on, että nämä rakenteet ovat tarttuvia, siirtyvät kohdesoluihin solujen välisissä kosketuksissa ja niillä on keskeinen rooli HIV-1:n leviämisessä T-lymfosyyttien välillä. HIV-1-viruksen biofilmi voi olla tärkeä virionien suoran leviämisen lisäksi myös "trans-infektiossa", jonka tavoitteemme ovat:

• karakterisoida paremmin tämän biofilmin molekyylikoostumusta ja arkkitehtuuria (käyttäen proteomiikkaa, glykomisen superresoluution solukuvausmenetelmiä) sen ominaisuuksien (tarttuvuus, tarttuvuus, virionien suojaus) suhteen ja määrittää, tuottavatko infektoituneiden potilaiden solut tällaisia ​​rakenteita.
• näiden uusien tarttuvien rakenteiden muodostumista säätelevien virustekijöiden rajaamiseksi (kiinnittäen erityistä huomiota Tat-, Vpu- ja Nef-HIV-1-koodaukseen käyttämällä mutanttiviruksia tai ekspressiovektoreita).
• tutkia lymfosyyttireittejä, jotka säätelevät viruksen biofilmien muodostumista ja koostumusta ekstrasellulaarisen matriisin (ECM) proteiineissa (käyttäen kvantitatiivista polymeraasiketjureaktiota (qPCR) ja siRNA:ta).
• sen määrittämiseksi, ovatko nämä virusbiofilmit mukana HIV-1-tartunnassa transinfektion kautta
• tutkia näiden tarttuvien rakenteiden vaikutusta ja niiden siirtymisen dynamiikkaa imusolmukkeissa.

Tämä projekti voi auttaa tulkitsemaan virusbiofilmien roolia HIV-1-tartunnassa. Viime kädessä aiomme määrittää, kuinka retrovirusinfektioiden häiriö T-solujen aktivaatioreitteihin moduloi T-solujen ECM-tuotannon mallia, virittäen viruksen biofilmin koostumusta ja säätelemällä viruksen leviämistä.