Profilowanie proteomiczne w celu ujawnienia nowych markerów prognostycznych wyników neurologicznych po resuscytacji

Wstęp: Zatrzymanie krążenia jest zdarzeniem zagrażającym życiu. Intensywiści mają do czynienia z rosnącą liczbą pacjentów z niepewnym wynikiem neurologicznym po resuscytacji krążeniowo-oddechowej (CPR). Wartość prognostyczna obecnych biomarkerów dla długoterminowego wyniku neurofizjologicznego jest ograniczona. Dlatego identyfikacja nowych markerów osocza o wyższej wartości predykcyjnej dla powrotu do zdrowia neurofizjologicznego ma kluczowe znaczenie dla postępowania z pacjentem po RKO.

Hipoteza: Stawiamy hipotezę, że można zidentyfikować określone białka wycieku tkankowego pochodzące z mózgu, aby ujawnić nowe, bardziej wiarygodne biomarkery prognostyczne dla dobrego wyniku neurologicznego.

Metody: To badanie translacyjne (n=100) jest połączeniem prospektywnego podstawowego badania naukowego mającego na celu zmniejszenie liczby potencjalnych kandydatów na biomarkery osocza za pomocą analiz proteomicznych w próbkach autopsji tkanki mózgowej i próbkach osocza resuscytowanych pacjentów (n=10) oraz prospektywne badanie walidacji klinicznej na dużej badanej populacji (n=90) za pomocą analiz o dużej przepustowości. Próbki będą analizowane za pomocą analiz proteomicznych typu shotgun przy użyciu spektrometru masowego Q-Exactive kwadrupolowo-orbitrapowego (MS). Dane MS/MS będą interpretowane przez oprogramowanie MaxQuant i Perseus. W celu identyfikacji białek pochodzących z mózgu w osoczu, proteom osocza 10 resuscytowanych pacjentów zostanie porównany z profilem proteomicznym tkanki mózgowej. Zmniejszy to liczbę kandydatów na potencjalne biomarkery osocza związane z wynikiem neurologicznym. Prospektywna walidacja próbek osocza zostanie przeprowadzona za pomocą ukierunkowanego podejścia proteomicznego z wykorzystaniem monitorowania wybranych reakcji (SRM) na potrójnym kwadrupolowym jonowym MS. Wynik neurologiczny zostanie oceniony na pięciostopniowej skali (śmierć, trwały stan wegetatywny, ciężka niepełnosprawność, umiarkowana niepełnosprawność i dobry powrót do zdrowia) zgodnie z kategoriami sprawności mózgu (CPC). Ból CPC <3 jest uważany za dobry wynik neurologiczny. Wybór markerów proteomicznych i ocena sygnatur zostanie przeprowadzona przez regularyzowaną regresję logistyczną L1, w której parametr dostrajania zostanie zoptymalizowany przez zweryfikowaną krzyżowo wydajność modelu. Zdolność sygnatury do rozróżniania pacjentów z dobrymi i złymi wynikami zostanie opisana za pomocą analizy ROC.

Perspektywa kliniczna: Dokładny predyktor wyniku neurologicznego po RKO ma ogromne znaczenie kliniczne. Jednak poprzednie badania koncentrowały się na bardzo ograniczonej gamie biomarkerów. Dlatego ustrukturyzowane podejście do analizy proteomicznej może zidentyfikować najlepszy marker spośród wszystkich białek uwolnionych podczas uszkodzenia komórek.