Ocena ultraczułego wykrywania aneuploidii chromosomowych w celu wykrycia minimalnej choroby resztkowej w szpiczaku mnogim (EUCADD)

W szpiczaku mnogim minimalna choroba resztkowa (MRD) odnosi się do komórek szpiczaka obecnych w szpiku kostnym po zmierzeniu odpowiedzi klinicznej i remisji u pacjenta. Pacjent, u którego wynik testu na MRD jest negatywny po leczeniu szpiczaka, ma mniej niż jedną komórkę szpiczaka na milion komórek szpiku kostnego. Dane z ostatnich badań klinicznych sugerują, że pacjenci z tak niskim poziomem choroby mogą być mniej narażeni na nawrót choroby niż pacjenci z wyższym poziomem. W ostatnich latach testy MRD są obecnie stosowane w postępowaniu z pacjentami otrzymującymi standardowe terapie tej choroby.

Niestabilność chromosomów (CIN) wynika z błędów w segregacji chromosomów podczas mitozy, co prowadzi do strukturalnych i liczbowych nieprawidłowości chromosomalnych. Wygeneruje genomową heterogeniczność, która działa jako substrat dla doboru naturalnego. Ponadto udowodniono, że guzy z aneuploidiami i poliploidami wynikające z podwojenia całego genomu są związane z przerzutami, opornością na leczenie i zmniejszonym całkowitym przeżyciem. Szacuje się, że 60-80% ludzkich nowotworów wykazuje nieprawidłowości chromosomalne sugerujące CIN. CIN dodatnio koreluje ze stopniem zaawansowania nowotworu i jest wzbogacony w próbki guza z nawrotem, jak również z przerzutami. Ze względu na wszechobecność CIN w komórkach nowotworowych i komórki nowotworowe uwalniające DNA do krwi obwodowej (PB) podczas apoptozy, jest to potencjalnie nieinwazyjny sposób wykrywania CIN w PB cfDNA od pacjentów z MM do poziomu MRD postaci. UCAD to nowa metoda wykrywania CIN w próbce DNA od pacjentów, w tym ekstrakcja cfDNA z PB, analiza DNA za pomocą sekwencjonowania całego genomu o niskim pokryciu, przetwarzanie danych za pomocą technik bioinformacyjnych i wreszcie optymalizacja postępowania z pacjentami ze szpiczakiem mnogim.