Weryfikacja integracyjnych podejść multi-omikowych w chorobach związanych z zespołem metabolicznym

To długoterminowe, wieloośrodkowe badanie ma na celu walidację integracyjnych metodologii multi-omiki do przewidywania postępu choroby i powikłań w zespole metabolicznym. Uczestnicy będą rekrutowani ze wszystkich oddziałów Szpitali Pamięci Chang Gung. Osoby spełniające kryteria diagnostyczne zespołu metabolicznego będą stanowić grupę badawczą, podczas gdy osoby w tym samym wieku i płci bez zespołu metabolicznego posłużą jako grupa kontrolna.

Badanie obejmie pobieranie próbek krwi obwodowej, moczu i kału w celu kompleksowego profilowania multi-omiki, w tym genomiki (sekwencjonowanie DNA), transkryptomiki (sekwencjonowanie RNA), metabolomiki (profilowanie metabolitów w surowicy i moczu) i mikrobiomiki (analiza mikrobioty kałowej). Próbki krwi (10 ml) będą pobierane corocznie do analiz genetycznych i metabolomicznych, natomiast próbki moczu (30 ml) i kału (1 ml) będą wykorzystywane do oceny sygnatur metabolicznych i mikrobiologicznych. Te biospecimens zostaną powiązane z długoterminowymi danymi klinicznymi uczestników i wynikami badań laboratoryjnych pobranymi z Bazy Badawczej Chang Gung (CGRD), zapewniając ujednolicone ramy do analizy integracyjnej.

Integracja danych wykorzysta zaawansowane potoki bioinformatyczne i narzędzia biologii systemowej do identyfikacji wielowarstwowych sieci molekularnych związanych z początkiem i postępem choroby. Metody analityczne obejmują redukcję wymiarowości, grupowanie i selekcję cech opartą na uczeniu maszynowym do konstruowania modeli predykcyjnych dla powikłań metabolicznych, takich jak choroba sercowo-naczyniowa, przewlekła choroba nerek i stłuszczenie wątroby. Zidentyfikowane biomarkery i szlaki będą walidowane wewnętrznie i porównywane krzyżowo z istniejącymi danymi z "Zintegrowanej Bazy Danych Inteligentnej Opieki Zdrowotnej dla Otyłości".

Wszystkie dane będą anonimizowane i bezpiecznie przechowywane na serwerach instytucjonalnych z ograniczonym dostępem. Każdemu uczestnikowi zostanie przypisany unikalny kod badania w celu zapewnienia poufności. Łączenie danych między zestawami danych omiki a wynikami klinicznymi będzie przeprowadzane za pomocą zaszyfrowanych, chroniących prywatność algorytmów pod nadzorem instytucjonalnego komitetu zarządzania danymi. Badanie przestrzega standardów etycznych ustalonych przez Instytucjonalną Komisję Rewizyjną, zapewniając ochronę uczestników podczas zbierania, analizy i rozpowszechniania danych.