Sequenciamento Clínico de Câncer e Repositório de Tecidos: OncoGenomics

Fundo:

• Investigações baseadas em laboratório contribuíram para uma melhor compreensão da biologia do câncer e para o desenvolvimento de novas terapias para malignidades.
• A investigação ômica pode identificar novos drivers na linhagem germinativa ou tumor para cânceres de alto risco, recidivantes, refratários ou raros.
• A investigação ômica pode identificar alterações germinativas ou somáticas que são clinicamente acionáveis ​​e/ou podem permitir terapia de precisão.

Objetivos - Objetivo Primário:

-Identifique achados incidentais e secundários no DNA da linhagem germinativa e mutações somáticas acionáveis ​​para relatar os resultados clínicos de um laboratório certificado pela CLIA nos registros médicos do CRIS.

Elegibilidade - Pacientes adultos ou pediátricos de qualquer idade com um dos seguintes:

• Diagnóstico de qualquer tumor, malignidade, distúrbio pré-maligno ou suspeita de síndromes familiares de suscetibilidade ao câncer, independentemente da idade do paciente; OU
• Indivíduos sem histórico de malignidade que estão sendo operados; OU
• Indivíduos sem histórico de câncer, mas com evidência de uma síndrome hereditária de câncer com base no histórico familiar e/ou outras manifestações de uma síndrome pré-cancerosa (p. polipose, neurofibromas plexiformes, doença mielodisplásica); OU
• Paciente inscrito em um protocolo de acompanhante aprovado.
• Tecido (incluindo tumor, normal, sangue, medula óssea, soro, plasma ou outros tecidos) que foi previamente coletado sob CLIA e mantido em um laboratório CLIA que está disponível para análise CLIA.
• Tecido (incluindo tumor, normal, sangue, medula óssea, soro, plasma ou outros tecidos) que foi coletado anteriormente e está disponível para análise de pesquisa.
• Os bioespécimes podem ser coletados com risco adicional mínimo para o sujeito durante a amostragem ou procedimentos necessários para o cuidado rotineiro do paciente.
• O indivíduo pode estar em tratamento para malignidade, condição pré-maligna ou receber outros cuidados associados a uma síndrome de câncer hereditária.
• Os pacientes podem ser encaminhados ao Investigador Principal de instituições externas.
• Capacidade do sujeito ou Representante Legalmente Autorizado (LAR) de entender e a vontade de assinar um consentimento informado por escrito OU
• Dispensa do IRB da exigência de consentimento informado para tipos específicos de tecido.

Projeto:

• Este estudo permitirá a coleta de espécimes para relatórios CLIA de linhagem germinativa e mutações somáticas. O estudo também coletará espécimes para um Repositório de Tecidos e para outras investigações conforme descrito abaixo.

• As atividades de teste do CLIA incluirão

  • DNA extraído de uma seção de tumor, tecido maligno, sangue ou amostras de medula óssea para análise de sequência de mutação somática
  • DNA germinativo extraído de linfócitos, saliva, pele ou quaisquer tecidos normais não envolvidos para análise de sequência para identificar alterações somáticas no câncer e para relatar achados incidentais de validade e utilidade clínica estabelecidas.

• As atividades de pesquisa podem incluir:

  • Análises ômicas de DNA, RNA e proteínas de tecidos normais e/ou tumorais extraídos; o restante do tecido tumoral será armazenado.
  • Análises germinativas de DNA e RNA de linfócitos extraídos ou outro tecido normal não envolvido.
  • Sequenciamento de receptores de células T (TCR) ou B de sangue, tumor ou tecido maligno.
  • Estabelecimento de modelos derivados de pacientes, como xenoenxertos derivados de pacientes (PDXs), culturas tumorais in vitro de passagem precoce e culturas organoides, linhas de células condicionalmente reprogramadas (CRC), explantes e linhas celulares de amostras normais ou tumorais pelo NCI Patient-Derived Models Repository (PDMR) no Frederick National Laboratory for Cancer Research ou pelo laboratório OncoGenomics.
  • Criopreservação de normal viável (por exemplo, PBMC) ou tecidos malignos.
  • Estabelecimento de linhas de células EBV transformadas a partir de sangue para pesquisa médica pelo Coriell Institute ou por investigadores neste protocolo.
  • Serão realizados estudos ômicos (genômica, proteômica, epigenética, metabolômica).
• Acumulação esperada de 50 a 500 pacientes por ano. Meta total de acúmulo de protocolo 5.000 pacientes.