Klinische Sequenzierung von Krebs und Geweberepository: OncoGenomics

Hintergrund:

• Laborbasierte Untersuchungen haben zu einem besseren Verständnis der Krebsbiologie und zur Entwicklung neuer Therapien für bösartige Erkrankungen beigetragen.
• Die Omics-Untersuchung kann neue Treiber in der Keimbahn oder im Tumor für Hochrisiko-, rezidivierte, refraktäre oder seltene Krebsarten identifizieren.
• Die Omics-Untersuchung kann Keimbahn- oder somatische Veränderungen identifizieren, die medizinisch umsetzbar sind und/oder eine Präzisionstherapie ermöglichen können.

Ziele - Hauptziel:

- Identifizieren Sie zufällige und sekundäre Befunde in der Keimbahn-DNA und umsetzbare somatische Mutationen für die Meldung klinischer Ergebnisse aus einem CLIA-zertifizierten Labor in die CRIS-Patientenakten.

Eignung - Erwachsene oder pädiatrische Patienten jeden Alters mit einem der folgenden:

• Diagnose von Tumoren, Malignitäten, prämalignen Erkrankungen oder familiären Syndromen mit Verdacht auf Krebsanfälligkeit, unabhängig vom Alter des Patienten; ODER
• Personen ohne bösartige Vorgeschichte, die sich einer Operation unterziehen; ODER
• Personen ohne Krebsvorgeschichte, aber Hinweis auf ein vererbtes Krebssyndrom aufgrund der Familienanamnese und/oder anderer Manifestationen eines präkanzerösen Syndroms (z. Polyposis, plexiforme Neurofibrome, myelodysplastische Erkrankung); ODER
• Patient, der in einem genehmigten Begleitprotokoll registriert ist.
• Gewebe (einschließlich Tumor, Normal, Blut, Knochenmark, Serum, Plasma oder andere Gewebe), das zuvor unter CLIA entnommen und in einem CLIA-Labor aufbewahrt wurde, das für die CLIA-Analyse zur Verfügung steht.
• Gewebe (einschließlich Tumor-, Normal-, Blut-, Knochenmark-, Serum-, Plasma- oder andere Gewebe), das zuvor entnommen wurde und für Forschungsanalysen zur Verfügung steht.
• Bioproben können mit minimalem zusätzlichem Risiko für den Probanden während der Probenentnahme oder Verfahren entnommen werden, die für die routinemäßige Patientenversorgung erforderlich sind.
• Die Person kann sich einer Behandlung wegen Malignität, eines prämalignen Zustands oder einer anderen Behandlung im Zusammenhang mit einem erblichen Krebssyndrom unterziehen.
• Patienten können von externen Institutionen an den Hauptprüfarzt überwiesen werden.
• Fähigkeit des Subjekts oder gesetzlich bevollmächtigten Vertreters (LAR) zu verstehen und die Bereitschaft, eine schriftliche Einverständniserklärung zu unterzeichnen ODER
• IRB-Verzicht auf das Erfordernis einer informierten Einwilligung für bestimmte Gewebearten.

Design:

• Diese Studie wird die Entnahme von Proben für die CLIA-Meldung von Keimbahn- und somatischen Mutationen ermöglichen. Die Studie wird auch Proben für ein Gewebelager und für andere Untersuchungen sammeln, wie unten beschrieben.

• CLIA-Testaktivitäten umfassen

  • DNA, die aus einem Schnitt von Tumor-, bösartigen Gewebe-, Blut- oder Knochenmarksproben zur Analyse somatischer Mutationssequenzen extrahiert wurde
  • Aus Lymphozyten, Speichel, Haut oder anderen normalen, unbeteiligten Geweben extrahierte Keimbahn-DNA zur Sequenzanalyse zur Identifizierung somatischer Veränderungen des Krebses und zur Meldung zufälliger Befunde von nachgewiesener klinischer Gültigkeit und Nützlichkeit.

• Forschungsaktivitäten können umfassen:

  • DNA-, RNA- und Protein-Omics-Analysen aus extrahiertem Normal- und/oder Tumorgewebe; der Rest des Tumorgewebes wird eingelagert.
  • Keimbahn-DNA- und RNA-Analysen aus extrahierten Lymphozyten oder anderem normalen, unbeteiligten Gewebe.
  • T (TCR)- oder B-Zell-Rezeptor-Sequenzierung aus Blut, Tumor oder bösartigem Gewebe.
  • Etablierung von patientenabgeleiteten Modellen wie patientenabgeleiteten Xenotransplantaten (PDXs), In-vitro-Tumorkulturen in früher Passage und Organoidkulturen, bedingt reprogrammierten Zelllinien (CRC), Explantaten und Zelllinien aus Tumor- oder normalen Proben durch das NCI Patient-Derived Models Repository (PDMR) des Frederick National Laboratory for Cancer Research oder des OncoGenomics Laboratory.
  • Kryokonservierung von lebensfähigem Normal (z. PBMC) oder bösartiges Gewebe.
  • Etablierung von EBV-transformierten Zelllinien aus Blut für die medizinische Forschung entweder durch das Coriell Institute oder durch Prüfer dieses Protokolls.
  • Omics-Studien (Genomik, Proteomik, Epigenetik, Metabolomik) werden durchgeführt.
• Voraussichtlicher Zuwachs von 50-500 Patienten pro Jahr. Gesamtziel des Protokolls 5.000 Patienten.