Анализ опухолевой и конституциональной ДНК для изучения детерминизма детской неоплазии (ALADIN)

Фон. Рак является ведущей причиной детской смертности от болезней. Большинство детских опухолей отличаются от опухолей взрослых по биологическим и клиническим характеристикам. У детей доля генетического детерминизма может быть выше, так как роль факторов окружающей среды может быть менее выражена, чем у взрослых, и что основным признаком генетической предрасположенности к раку является молодой возраст начала заболевания. Недавние исследования показали, что еще предстоит охарактеризовать ряд генетических предрасположенностей.

Методы. Полноэкзомное секвенирование зародышевой линии ДНК пациентов (детей и взрослых с диагнозом рак в возрасте от 0 до 17 лет) и родителей будет проведено проспективно в многоцентровом исследовании, включающем 40 невыбранных случаев злокачественной опухоли. Участвующие больницы будут включать CHU Монпелье, CHU де Ниццы и AP-HP. Анализ опухоли будет включать анализ всего экзома и транскриптома для идентификации терапевтической мишени и будет способствовать подтверждению потенциальной связи между конститутивными мутациями и фенотипом опухоли (например, потеря экспрессии, потеря гетерозиготности).

Перспективы. Это исследование детской онкологии, предлагающее глобальный подход, объединяющий секвенирование всего экзома на основе трио, анализ соматической ДНК и РНК, улучшит распознавание генетической предрасположенности и характеристику таргетной терапии у детей с раком.