Analyse av svulst og konstitusjonelt DNA for studiet av determinismen i barneneoplasi (ALADIN)

Bakgrunn. Kreft er den ledende dødsårsaken til sykdom hos barn. De fleste pediatriske svulster skiller seg fra voksne svulster når det gjelder biologiske og kliniske egenskaper. Hos barn kan delen av genetisk determinisme være høyere siden rollen til miljøfaktorer kan være mindre uttalt enn hos voksne og at en ung alder ved debut er et hovedtrekk ved genetisk kreftpredisposisjon. Nyere studier antydet at en rekke genetiske predisposisjoner gjenstår å karakterisere.

Metoder. Trio-basert heleksomesekvensering av kimlinje-DNA fra pasienter (barn og voksne diagnostisert med kreft mellom 0 og 17 år) og foreldre vil bli utført prospektivt i en multisentrisk studie som inkluderer 40 uselekterte tilfeller av ondartet svulst. Deltakende sykehus vil inkludere CHU i Montpellier, CHU de Nice og AP-HP. Tumoranalyse vil inkludere heleksomanalyse og transkriptom for identifisering av terapeutisk mål og bidra til å bekrefte potensiell sammenheng mellom konstitutive mutasjoner og tumorfenotype (som tap av uttrykk, tap av heterozygositet).

Perspektiver. Denne pediatriske onkologiske studien som foreslår en global tilnærming som integrerer triobasert heleksomsekvensering, somatisk DNA- og RNA-analyse, vil forbedre gjenkjennelsen av genetisk predisposisjon og karakteriseringen av målterapier hos barn med kreft.