Антенатальное исследование плодов со сложными врожденными пороками сердца с использованием мультиОМИКС (CARDIOMICS)

Врожденные пороки сердца (ВПС) представляют собой весьма гетерогенную группу заболеваний сердца с точки зрения эмбриональных механизмов, фенотипов и этиологии. При изолированных формах генетические причины выявляются лишь в 19% случаев, связанные с хромосомными аномалиями (8%) или вариантами генов (11%). Экологические причины, такие как инфекция, воздействие токсичных веществ или прием тератогенных веществ, также могут способствовать возникновению МКК. Хотя в большинстве случаев этиология остается неизвестной, обнаружение MCC в антенатальном периоде почти систематически приводит к генетическому этиологическому исследованию с использованием амниотической жидкости для определения кариотипа, Array-CGH и, в последнее время, анализа экзома. Что касается экологических причин, последние данные в литературе сообщают о связи между воздействиями окружающей среды (профессиональными, внепрофессиональными или медицинскими) и врожденными аномалиями.

Цели: Низкий процент генетических аномалий и токсических факторов, выявленных как причинные у пациентов с несиндромальной ИБС, побуждает к поиску более сложных причин, таких как эпигенетические модификации, связанные с взаимодействием между генами и факторами окружающей среды.

Методы: подход мультиомного исследования с использованием технологий высокопроизводительного секвенирования (экзом, RNASeq, methylSeq) обеспечивает обширную информацию о клеточных и/или тканевых сигнальных путях в ответ на воздействие. Комплексный анализ транскриптомов и метиломов продемонстрировал возникновение комбинированных дефектов экспрессии и метилирования генов после токсического воздействия. Период формирования ВПС в эмбриональном развитии побуждает искать эпигенетические модификации во внутриутробном периоде, максимально приближенные к патофизиологическим механизмам, приводящим к данному пороку развития.

Ожидаемые результаты: мультиомик-анализ, примененный к плодам с несиндромальной сложной ИБС, в сочетании с характеристикой профессиональных и непрофессиональных воздействий окружающей среды, позволит нам расширить этиологический поиск этих пороков развития, идентифицировать биомаркеры, связанные с возникновением и тяжесть этих пороков развития и лучше понять патофизиологические механизмы, связанные с ИБС.

В долгосрочной перспективе это исследование послужит основой для крупномасштабных исследований, которые позволят разработать политику профилактики на основе исчерпывающих многоцентровых когорт. Кроме того, мультиомные исследования могут идентифицировать генные маркеры по экзому, транскриптому и/или метилому, которые затем можно будет целенаправленно изучать.