Resistensen och immunsvaret mot Palbociclib vid bröstcancer

Utredarna föreslår att genomföra en biomarkör och molekylär profileringsstudie i longitudinellt parade tumörbiopsier och serum från patienter med hormonreceptorpositiv (HR+) metastaserad bröstcancer (BC) som behandlats med Palbociclib(Palbo) i kombination med endokrina terapier.

Utredarna planerar att erhålla tumörbiopsi och blodprov, tagna vid både förbehandling och efter progression, från 40 patienter som utvecklar förvärvad resistens mot Palbo + endokrin kombinationsbehandling. Alla analyser kommer att utföras parallellt på prover både före och efter behandling för att identifiera skillnader som kan förklara förvärvad resistens. Cyclin E1 och E2 nivåer kommer att bedömas av IHC på tumörbiopsier. Neuregulin-1-nivåer kommer att bedömas med ELISA-analys på serum. Tumörbiopsier kommer att profileras ytterligare med hjälp av hel-exom-sekvensering (WES) och hel-transkriptom-sekvensering (RNA-Seq). Matchade blodprover kommer att omfattas av WES för att underlätta upptäckt av somatisk mutation. Parade tumörbiopsier kommer att genomgå immunhistokemi (IHC) analys av TIL-markörer för att bedöma Palbo-inducerade förändringar. Slutligen kommer vi att tillämpa den interna analysen av cirkulerande tumör-DNA (ctDNA), som använder en specialdesignad panel för att studera Palbo förvärvad resistens, för analys av 40 par plasmaprover. Den anpassade ctDNA-panelen kommer att utökas till att omfatta ytterligare mutationer som identifierats från denna studie som ger förvärvad resistens.

För att ytterligare utvärdera effekterna av Palbo-behandling på intratumorala TILs, planerar forskarna att skaffa parad tumörbiopsi och matchade blodprover, vid baslinjen och två tidpunkter (6 veckor, 12 veckor) under behandlingen av Palbo från 20 patienter. Och de kommer att välja ut metastaserande BC-patienter som uppvisar stabila sjukdomar (SD) som svar på Palbo för tumörbiopsier, innan de vet om postprogressionsbiopsi skulle vara tillgänglig. Tumörbiopsier kommer att bli föremål för WES-, RNA-Seq- och IHC-analyser. Vidare planerar utredarna att kvantifiera överflödet av immuncellssubpopulationer i de matchade blodproverna med hjälp av flödescytometri (FACS) för att bedöma Palbo-behandlingseffekter på systematisk immunitet.

Även om prover under behandling kan samlas in efter 6 veckor och 12 veckor efter påbörjad Palbo-behandling, tar det i genomsnitt cirka 18 månader för initialt behandlade patienter med sent stadium av HR+ bröstcancer att utveckla förvärvad resistens. Endast uppskattningsvis 40 % av återfallsfallen kommer att ha framgångsrika biopsier på grund av bristande samtycke eller svåropererade biopsier såsom benmetastaser. Därför planerar utredarna att samla in biopsier och blodprover från cirka 100 patienter före behandling före andra kvartalet 2018 för att samla in 40 biopsier efter progression som matchade par inom den 2-åriga tidsramen. FFPE-objektglas kommer att göras från alla tumörbiopsier, inklusive de 100 fallen vid baslinjen, och föremål för H&E-färgning. Utredarna kommer att upptäcka och kvantifiera TILs genom maskininlärning och digital bildanalys av H&E-data.