Utveckling av ett optimalt tillvägagångssätt för att returnera resultat för nästa generations sekvensering för prenatal diagnostik

Även om hel exome-sekvensering (WES) först användes för identifiering av den genetiska orsaken till en sjukdom först 2009 och helgenomsekvensering (WGS) 2010, och frågor kvarstår om deras prestanda som kliniska tester, erbjuds de redan till patienter och läkare som ett kliniskt test av flera laboratorier certifierade av den amerikanska regeringen (14 labb för WES och 5 labb för WGS). Resultaten från WES och WGS kan vara komplexa och förvirrande, även för läkare och forskare som arbetar med denna teknik dagligen; för patienter kan processen att bestämma om de ska ha WES- eller WGS-testning, genomgå testningen, ta emot resultaten och försöka använda resultaten för vidare beslutsfattande vara ganska stressande. För närvarande sker denna process på ett ostandardiserat sätt, med vissa patienter som får omfattande utbildning och rådgivning, och andra får nästan ingen. Det finns ett kritiskt behov av att identifiera patientbehov och önskemål inom detta område och att utveckla strategier för att tillfredsställa dem. Det primära målet med detta projekt är att få kunskap om hur patienter som genomgår prenatal diagnostik för en fosteravvikelse förstår och reagerar på WGS-testning, så att vi kan utveckla ett mer etiskt och ansvarsfullt förhållningssätt till patientutbildning, rådgivning och återlämnande av resultat för patienter. . För att kunna göra detta måste vi utvärdera föräldrars förståelse av teknikens användbarhet och begränsningar, föräldrars preferenser angående vilken typ av resultat de vill få och den psykologiska effekten av att få resultat från denna teknik. Vi kommer att registrera 30 familjer bestående av en kvinna som bär på ett foster med en stor abnormitet som identifierats med ultraljud, och fostrets fader, som har valt fostervattenprov för standard prenatal diagnostisk testning (karyotypning, fluorescens in situ hybridisering (FISH) och/eller mikroarray-testning). Hälften av familjerna kommer att fungera som kontroller, som bara kommer att ha standardprenatal diagnostisk testning. För den andra hälften av familjerna kommer WGS att utföras utöver standarddiagnostiska tester. För alla 30 fall kommer vi att utföra psykosociala utvärderingar (inklusive bedömningar av försökspersonernas humör, förståelse för tekniken och preferenser för återlämnande av resultat) vid tidpunkten för inskrivningen, vid tidpunkten för återlämnande av CLIA-certifierade genetiska testresultat (karyotyp) , FISH, microarray och/eller WGS), och efter avslutad graviditet. På detta sätt kommer vi att lära oss om deltagarna får adekvat utbildning om nästa generations sekvensering för att göra välgrundade val, vilka preferenser som finns för återlämnande av resultat i en prenatal population (och om detta förändras när nya metoder för prenatal diagnostik används ), och huruvida användningen av WGS medför ytterligare psykologisk stress jämfört med standard prenatala diagnostiska test. Denna studie kommer att utföras i en stegvis och noggrant övervakad miljö, med framstegen som övervakas av en oberoende dataövervakningskommitté för att maximera den kunskap som erhålls samtidigt som potentiella skador minimeras.