Värd-RNA-uttrycksprofiler och proteinbiomarkörer vid neonatal Herpes Simplex-virusinfektion

Bakgrund:

Herpes Simplex Virus (HSV)-infektion hos nyfödda är ovanlig men kan vara förödande och är förknippad med betydande sjuklighet och dödlighet. Diagnosen av neonatal HSV-infektion är utmanande eftersom moderns genital herpes ofta är asymtomatisk och den kliniska presentationen hos nyfödda kan vara ospecifik, särskilt i de tidiga sjukdomsstadierna. Detta resulterar i sen diagnos och potentiellt fruktansvärda konsekvenser för den nyfödda. Orsaken till att vissa nyfödda utvecklar en allvarlig sjukdom på grund av HSV-infektion är okänd. Det har föreslagits att immunologiska skillnader i tidig spädbarnsålder är nyckeln till ytterligare framsteg. Värd-RNA-uttrycksprofilering, transkriptomik, av värdens svar på infektioner har visat stor potential som kliniskt verktyg för diagnostik och för att avslöja mekanismer för molekylära sjukdomar. Som tidigare visats kan tillförlitliga värd-RNA-expressionsdata erhållas från neonatala torkade blodfläckar (DBS) prover genom RNA-sekvensering. Proteomisk analys har potential att samtidigt identifiera hundratals proteinbiomarkörer och immuncellspopulationer, vilket möjliggör detaljerad kartläggning av sjukdomens immunologiska vägar.

Metod:

En rikstäckande retrospektiv fallkontrollstudie av alla nyfödda med HSV-infektion i Danmark från 2010 till 2019. DBS-prover kommer att erhållas från den danska neonatalscreeningsbiobanken, Statens Serum Institut. RNA-sekvensering och proteomanalyser kommer att utföras vid Dansk Center for Neonatal Screening, Institutionen för medfödda sjukdomar, Statens Serum Institut. Fall kommer att slumpmässigt tilldelas en "Discovery cohort" och jämfört med en kontrollgrupp av nyfödda matchade på graviditetsålder, kön och födelsevikt kommer att inkluderas.

Tidsram:

Providentifiering/rekrytering: 1 januari till 31 januari 2022. Provanalys (RNA-sekvensering och proteomanalys): 1 februari till 30 april 2022.

Perspektiv:

Nya molekylärbaserade diagnostiska verktyg som kompletterar konventionella metoder kan förbättra tidig diagnos av neonatala HSV-infektioner och leda till optimerad hantering. Dessutom kan förståelse för patogenesen på molekylär nivå av allvarliga sjukdomsmanifestationer av sjukdomen utgöra grunden för utveckling av nya insatser för bättre förebyggande och behandling.