Профили экспрессии РНК-хозяина и белковые биомаркеры при неонатальной инфекции, вызванной вирусом простого герпеса

Задний план:

Инфекция вируса простого герпеса (ВПГ) у новорожденных встречается редко, но может быть разрушительной и связана со значительной заболеваемостью и смертностью. Диагностика неонатальной ВПГ-инфекции затруднена, поскольку материнский генитальный герпес часто протекает бессимптомно, а клиническая картина у новорожденных может быть неспецифической, особенно на ранних стадиях заболевания. Это приводит к поздней диагностике и потенциально ужасным последствиям для новорожденного. Причина, по которой у некоторых новорожденных развивается тяжелое заболевание из-за инфекции ВПГ, неизвестна. Было высказано предположение, что иммунологические различия в раннем младенчестве являются ключом к дальнейшему прогрессу. Профилирование экспрессии РНК хозяина, транскриптомика ответа хозяина на инфекции продемонстрировали большой потенциал в качестве клинического инструмента для диагностики и раскрытия молекулярных механизмов заболевания. Как было показано ранее, надежные данные об экспрессии РНК хозяина могут быть получены из образцов высушенных пятен крови новорожденных (DBS) путем секвенирования РНК. Протеомный анализ может одновременно идентифицировать сотни белковых биомаркеров и популяций иммунных клеток, что позволяет детально картировать иммунологические пути заболевания.

Метод:

Общенациональное ретроспективное исследование случай-контроль всех новорожденных с ВПГ-инфекцией в Дании с 2010 по 2019 год. Образцы DBS будут получены из Датского биобанка неонатального скрининга Statens Serum Institut. Секвенирование РНК и протеомный анализ будут проводиться в Датском центре неонатального скрининга, отделение врожденных заболеваний, Statens Serum Institut. Случаи будут случайным образом распределены в «когорту Discovery» и будут включены в сравнение с контрольной группой новорожденных, совпадающих по гестационному возрасту, полу и массе тела при рождении.

Период времени:

Идентификация/набор образцов: с 1 по 31 января 2022 года. Анализ образцов (секвенирование РНК и протеомный анализ): с 1 февраля по 30 апреля 2022 г.

Перспективы:

Новые инструменты молекулярной диагностики, дополняющие традиционные методы, могут улучшить раннюю диагностику неонатальных ВПГ-инфекций и привести к оптимизации лечения. Кроме того, понимание патогенеза на молекулярном уровне тяжелых проявлений заболевания может стать основой для разработки новых вмешательств для улучшения профилактики и лечения.