Isännän RNA:n ilmentymisprofiilit ja proteiinien biomarkkerit vastasyntyneen herpes simplex -virusinfektiossa

Tausta:

Herpes simplex -virus (HSV) -infektio vastasyntyneillä on harvinainen, mutta se voi olla tuhoisa ja siihen liittyy merkittävää sairastuvuutta ja kuolleisuutta. Vastasyntyneen HSV-infektion diagnoosi on haastava, koska äidin sukupuolielinten herpes on usein oireeton ja kliininen esitys vastasyntyneillä voi olla epäspesifinen, etenkin taudin alkuvaiheessa. Tämä johtaa myöhäiseen diagnoosiin ja mahdollisesti kauheisiin seurauksiin vastasyntyneelle. Syy siihen, miksi joillekin vastasyntyneille kehittyy vakava sairaus HSV-infektion vuoksi, ei ole tiedossa. On ehdotettu, että immunologiset erot varhaislapsuudessa ovat avain jatkokehitykseen. Isäntä-RNA:n ilmentymisen profilointi, transkriptomiikka, isännän vasteen infektioille, on osoittanut suuren potentiaalin kliinisenä työkaluna diagnostiikassa ja molekyylisairauksien mekanismien paljastamisessa. Kuten aiemmin osoitettiin, luotettavat isäntä-RNA:n ilmentymistiedot voidaan saada vastasyntyneen kuivatun veripisteen (DBS) näytteistä RNA-sekvensoinnilla. Proteominen analyysi pystyy tunnistamaan samanaikaisesti satoja proteiinien biomarkkereita ja immuunisolupopulaatioita, mikä mahdollistaa taudin immunologisten reittien yksityiskohtaisen kartoituksen.

Menetelmä:

Valtakunnallinen retrospektiivinen tapauskontrollitutkimus kaikista vastasyntyneistä, joilla on HSV-infektio Tanskassa vuosina 2010–2019. DBS-näytteet saadaan Tanskan Neonatal Screening Biobankista, Statens Serum Institutista. RNA-sekvensointi ja proteomianalyysit suoritetaan Tanskan vastasyntyneiden seulontakeskuksessa, Statens Serum Institutin synnynnäisten häiriöiden osastolla. Tapaukset jaetaan satunnaisesti "Discovery-kohorttiin", ja niitä verrataan vastasyntyneiden kontrolliryhmään, joka vastaa raskauden ikää, sukupuolta ja syntymäpainoa.

Aikaikkuna:

Esimerkkitunnistus/rekrytointi: 1.1.-31.1.2022. Näyteanalyysi (RNA-sekvensointi ja proteominen analyysi): 1. helmikuuta - 30. huhtikuuta 2022.

Näkökulmat:

Perinteisiä menetelmiä täydentävät uudet molekyylipohjaiset diagnostiset työkalut voivat parantaa vastasyntyneiden HSV-infektioiden varhaista diagnosointia ja johtaa optimoituun hoitoon. Lisäksi taudin vakavien taudin ilmenemismuotojen patogeneesin ymmärtäminen molekyylitasolla voisi muodostaa perustan uusien interventioiden kehittämiselle paremman ehkäisyn ja hoidon parantamiseksi.