Profile ekspresji RNA gospodarza i biomarkery białkowe w noworodkowej infekcji wirusem opryszczki pospolitej

Tło:

Zakażenie wirusem opryszczki pospolitej (HSV) u noworodków jest rzadkie, ale może być wyniszczające i wiąże się ze znaczną chorobowością i śmiertelnością. Rozpoznanie zakażenia HSV u noworodków jest trudne, ponieważ opryszczka narządów płciowych matki często przebiega bezobjawowo, a obraz kliniczny u noworodków może być niespecyficzny, zwłaszcza we wczesnych stadiach choroby. Skutkuje to późną diagnozą i potencjalnie strasznymi konsekwencjami dla noworodka. Powód, dla którego niektóre noworodki rozwijają ciężką chorobę z powodu zakażenia HSV, jest nieznany. Sugerowano, że różnice immunologiczne we wczesnym okresie niemowlęcym są kluczem do dalszych postępów. Profilowanie ekspresji RNA gospodarza, transkryptomika, odpowiedzi gospodarza na infekcje wykazało ogromny potencjał jako narzędzie kliniczne do diagnostyki i odkrywania mechanizmów chorób molekularnych. Jak pokazano wcześniej, wiarygodne dane dotyczące ekspresji RNA gospodarza można uzyskać z próbek wysuszonej plamki krwi noworodków (DBS) przez sekwencjonowanie RNA. Analiza proteomiczna może jednocześnie identyfikować setki biomarkerów białkowych i populacji komórek odpornościowych, umożliwiając szczegółowe mapowanie szlaków immunologicznych choroby.

Metoda:

Ogólnokrajowe retrospektywne badanie kliniczno-kontrolne wszystkich noworodków z zakażeniem HSV w Danii w latach 2010-2019. Próbki DBS zostaną uzyskane z duńskiego biobanku badań przesiewowych noworodków, Statens Serum Institut. Sekwencjonowanie RNA i analizy proteomiczne zostaną przeprowadzone w Duńskim Centrum Badań Przesiewowych Noworodków, Department of Congenital Disorders, Statens Serum Institut. Przypadki zostaną losowo przydzielone do „kohorty Discovery” i porównane z grupą kontrolną noworodków dobranych pod względem wieku ciążowego, płci i masy urodzeniowej.

Ramy czasowe:

Przykładowa identyfikacja/rekrutacja: od 1 stycznia do 31 stycznia 2022 r. Analiza próbek (sekwencjonowanie RNA i analiza proteomiczna): od 1 lutego do 30 kwietnia 2022 r.

Perspektywy:

Nowe molekularne narzędzia diagnostyczne, uzupełniające metody konwencjonalne, mogą usprawnić wczesną diagnostykę zakażeń HSV u noworodków i zoptymalizować postępowanie. Ponadto zrozumienie patogenezy na poziomie molekularnym ciężkich objawów chorobowych choroby może stanowić podstawę do opracowania nowych interwencji na rzecz lepszej profilaktyki i leczenia.