Profils d'expression de l'ARN hôte et biomarqueurs protéiques dans l'infection néonatale par le virus de l'herpès simplex

Arrière plan:

L'infection par le virus de l'herpès simplex (HSV) chez les nouveau-nés est rare mais peut être dévastatrice et est associée à une morbidité et une mortalité importantes. Le diagnostic de l'infection néonatale à HSV est difficile car l'herpès génital maternel est souvent asymptomatique et la présentation clinique chez les nouveau-nés peut être non spécifique, en particulier dans les premiers stades de la maladie. Il en résulte un diagnostic tardif et des conséquences potentiellement terribles pour le nouveau-né. La raison pour laquelle certains nouveau-nés développent une maladie grave due à une infection par le HSV est inconnue. Il a été suggéré que les différences immunologiques dans la petite enfance sont la clé des progrès futurs. Le profilage de l'expression de l'ARN de l'hôte, transcriptomique, de la réponse de l'hôte aux infections a montré un grand potentiel en tant qu'outil clinique pour le diagnostic et pour dévoiler les mécanismes moléculaires de la maladie. Comme indiqué précédemment, des données fiables sur l'expression de l'ARN de l'hôte peuvent être obtenues à partir d'échantillons néonataux de taches de sang séché (DBS) par séquençage d'ARN. L'analyse protéomique a le potentiel d'identifier simultanément des centaines de biomarqueurs protéiques et de populations de cellules immunitaires permettant une cartographie détaillée des voies immunologiques de la maladie.

Méthode:

Une étude cas-témoins rétrospective à l'échelle nationale de tous les nouveau-nés infectés par le VHS au Danemark de 2010 à 2019. Les échantillons de DBS seront obtenus auprès de la biobanque danoise de dépistage néonatal, Statens Serum Institut. Le séquençage de l'ARN et les analyses protéomiques seront effectués au Centre danois de dépistage néonatal, Département des troubles congénitaux, Statens Serum Institut. Les cas seront assignés au hasard à une «cohorte de découverte» et comparés à un groupe témoin de nouveau-nés appariés sur l'âge gestationnel, le sexe et le poids à la naissance seront inclus.

Plage de temps:

Identification/recrutement de l'échantillon : du 1er janvier au 31 janvier 2022. Analyse d'échantillons (séquençage d'ARN et analyse protéomique) : du 1er février au 30 avril 2022.

Points de vue:

De nouveaux outils de diagnostic moléculaires complémentaires aux méthodes conventionnelles peuvent améliorer le diagnostic précoce des infections néonatales à HSV et conduire à une gestion optimisée. En outre, la compréhension de la pathogenèse au niveau moléculaire des manifestations graves de la maladie pourrait constituer la base du développement de nouvelles interventions pour une meilleure prévention et un meilleur traitement.