Verts-RNA-ekspresjonsprofiler og proteinbiomarkører ved neonatal herpes simplex virusinfeksjon

Bakgrunn:

Herpes Simplex Virus (HSV)-infeksjon hos nyfødte er uvanlig, men kan være ødeleggende og er assosiert med betydelig sykelighet og dødelighet. Diagnosen av neonatal HSV-infeksjon er utfordrende fordi mors genital herpes ofte er asymptomatisk og den kliniske presentasjonen hos nyfødte kan være uspesifikk, spesielt i de tidlige sykdomsstadiene. Dette resulterer i sen diagnose og potensielt forferdelige konsekvenser for den nyfødte. Årsaken til at noen nyfødte utvikler alvorlig sykdom på grunn av HSV-infeksjon er ukjent. Det har blitt antydet at immunologiske forskjeller i tidlig spedbarnsalder er nøkkelen til ytterligere fremskritt. Verts-RNA-ekspresjonsprofilering, transkriptomikk, av vertsresponsen på infeksjoner har vist stort potensial som klinisk verktøy for diagnostikk og for å avdekke molekylære sykdomsmekanismer. Som tidligere vist, kan pålitelige verts-RNA-ekspresjonsdata oppnås fra neonatale tørkede blodflekker (DBS) prøver ved RNA-sekvensering. Proteomisk analyse har potensial til å identifisere hundrevis av proteinbiomarkører og immuncellepopulasjoner samtidig, noe som muliggjør detaljert kartlegging av sykdomsimmunologiske veier.

Metode:

En landsomfattende retrospektiv case-control studie av alle nyfødte med HSV-infeksjon i Danmark fra 2010 til 2019. DBS-prøver vil bli hentet fra den danske neonatalscreeningsbiobanken, Statens Serum Institut. RNA-sekvensering og proteomiske analyser vil bli utført ved Dansk Center for Neonatal Screening, Avdeling for medfødte lidelser, Statens Serum Institut. Tilfeller vil bli tilfeldig tilordnet en "Discovery cohort" og sammenlignet med en kontrollgruppe av nyfødte matchet på svangerskapsalder, kjønn og fødselsvekt vil bli inkludert.

Tidsramme:

Eksempel på identifisering/rekruttering: 1. januar til 31. januar 2022. Prøveanalyse (RNA-sekvensering og proteomisk analyse): 1. februar til 30. april 2022.

Perspektiver:

Nye molekylærbaserte diagnostiske verktøy som komplementerer konvensjonelle metoder kan forbedre tidlig diagnose av neonatale HSV-infeksjoner og føre til optimalisert behandling. I tillegg vil forståelse av patogenesen på et molekylært nivå av alvorlige sykdomsmanifestasjoner av sykdommen kunne danne grunnlaget for utvikling av nye intervensjoner for bedre forebygging og behandling.