Prospektiv kohort för tidig upptäckt av levercancer (Pearl)

Pearl Cohort

Alla 3000 patienter rekryterade till Pearl-studien

Övrig: Blod- och urinprov

Proverna kommer att användas för att identifiera en rad tester (inklusive genetiska, protein- och andra biomarkörer), som tillsammans med kliniska data förhoppningsvis kommer att identifiera de som löper störst risk att utveckla HCC, och för att identifiera HCC vid tidigast möjliga tidpunkter.

Känslighet hos nya diagnostiska metoder för tidig diagnos av HCC hos inskrivna patienter som diagnostiseras med HCC med konventionella metoder.

Diagnostiska metoder som ska testas inkluderar:

1. upptäckt av epigenetisk (t.ex. metyleringsprofilering) och genetiska mutationer, och kopieantalvariationer i cirkulerande tumör-DNA;
2. multiparametrisk MRI-leveravbildning inklusive MR-biomarkörer för inflammation, fibros, fett- och järnhalt;
3. värd genetisk makeup (relevanta varianter identifierade genom Genome Wide Association Studies);
4. detektion av autoantikroppar mot tumörassocierade antigener;
5. epitopkartläggning av cirkulerande antikroppsrepertoar med användning av slumpmässiga peptidbibliotek;
6. proteinbiomarkörer inklusive L3-isoformen av alfafetoprotein och des-gammakarboxi-protrombin;
7. proteomisk och metabolomisk profilering, inklusive steroidmetaboliska signaturer i urin.

Specificitet för nya diagnostiska tillvägagångssätt för tidig diagnos av HCC hos inskrivna patienter som diagnostiseras med HCC med konventionella metoder.

Diagnostiska metoder som ska testas inkluderar:

1. upptäckt av epigenetisk (t.ex. metyleringsprofilering) och genetiska mutationer, och kopieantalvariationer i cirkulerande tumör-DNA;
2. multiparametrisk MRI-leveravbildning inklusive MR-biomarkörer för inflammation, fibros, fett- och järnhalt;
3. värd genetisk makeup (relevanta varianter identifierade genom Genome Wide Association Studies);
4. detektion av autoantikroppar mot tumörassocierade antigener;
5. epitopkartläggning av cirkulerande antikroppsrepertoar med användning av slumpmässiga peptidbibliotek;
6. proteinbiomarkörer inklusive L3-isoformen av alfafetoprotein och des-gammakarboxi-protrombin;
7. proteomisk och metabolomisk profilering, inklusive steroidmetaboliska signaturer i urin.

Positiva/negativa prediktiva värden för nya diagnostiska tillvägagångssätt för tidig diagnos av HCC hos inskrivna patienter som diagnostiseras med HCC med konventionella metoder.

Diagnostiska metoder som ska testas inkluderar:

1. upptäckt av epigenetisk (t.ex. metyleringsprofilering) och genetiska mutationer, och kopieantalvariationer i cirkulerande tumör-DNA;
2. multiparametrisk MRI-leveravbildning inklusive MR-biomarkörer för inflammation, fibros, fett- och järnhalt;
3. värd genetisk makeup (relevanta varianter identifierade genom Genome Wide Association Studies);
4. detektion av autoantikroppar mot tumörassocierade antigener;
5. epitopkartläggning av cirkulerande antikroppsrepertoar med användning av slumpmässiga peptidbibliotek;
6. proteinbiomarkörer inklusive L3-isoformen av alfafetoprotein och des-gammakarboxi-protrombin;
7. proteomisk och metabolomisk profilering, inklusive steroidmetaboliska signaturer i urin.

Att utveckla modeller som kan användas för att "riskstratifiera" cirrospatienter efter deras framtida risk för HCC

Harrell's Concordance Index (C-index) kommer att beräknas för varje biomarkör/modell av intresse. Minsta och maximala C-indexpoäng är 0 respektive 1, där ju högre poäng desto bättre är biomarkören/modellen på att identifiera HCC-risk. C-indexvärden indikerar i vilken grad individer som utvecklar HCC har högre riskpoäng än de som inte gör det. C-indexvärden kommer att anpassas för att inkludera icke-HCC-dödlighet som en konkurrerande risk. C-indexvärdet kommer att användas för att identifiera de biomarkörer/modeller som har bäst särskiljningsförmåga.

För att bättre förstå förekomsten av HCC i en brittisk befolkning stratifierad av underliggande cirros etiologi

Kumulativ incidens av HCC enligt cirros etiologi