基因突变与多遗传性外生骨疣的骨科症状相关性:多中心项目
多遗传性外生骨疣的基因型-表型相关性:多中心项目
研究概览
地位
条件
详细说明
学科招募:
新出现的 HME 患者将通过不列颠哥伦比亚省儿童医院骨科的办公室和诊所进行识别。 所有潜在参与者都将接受有关研究的基本原理、目的和程序的教育,并获得知情同意。
人口统计:
将采访所有愿意参加研究的先证者(受影响的患者)、他们的一级亲属和大家庭成员。 将阐明包括年龄、性别、种族、家族史、症状、并发症和既往手术史在内的信息。
表现型:
受影响的患者将绘制骨软骨瘤的位置、大小、形态和症状图。 总共将收集分为四大数据类别的七十五个表型参数。 前两类是从体检中积累的,包括身高和肢体节段长度(15(左右各 x2)。 其他两个类别,病变质量(19 个参数)和肢体对齐和畸形(26 个参数)将从作为患者当前护理的一部分的射线照相检查中得出。 将审查所有可用的 X 射线,并通过射线照相表征外生骨疣。 这将确定患者的基因型。
基因型:
每个基因型未知的参与者将有 10 cc。 在卑诗省儿童医院采集的血样。 该样本将在 BC 儿童医院的临床分子诊断实验室进行突变分析(从血液样本中提取 DNA,突变分析)。 将实施试点研究中使用的技术,但为了节省成本将不使用微卫星标记。
使用 EXT 1 和 EXT 2 引物(附录 1),使用 ABI Big Dye 化学版本 2 对 DNA 片段的两条链进行测序。然后将所得测序反应产物在 ABI 3100 Avant 基因分析仪上运行。 获得序列后,将使用 SeqScape 版本 2 软件对其进行分析,该软件允许与参考序列进行比较。
数据分析:
本研究得出的所有信息都将严格保密。 所有文件都将通过 ID 号进行识别,并保存在上锁的文件柜中。 在已完成研究的任何报告中都不会通过姓名来识别参与者。 数据库将存储在项目专用笔记本电脑上,锁在研究室。
收集的表型数据将用于描述家庭程度(使用西里尔软件设计)、受影响个体的表型和感兴趣的外生骨疣基因突变(突变位点和类型)。 受试者身高和段长将转换为百分位数字,以针对年龄和性别进行标准化,以便在各组之间进行比较。
来自血样突变分析的基因型数据将包括突变位置(基因早期与基因晚期)、突变类型(基因改变为错义、移码、无义或剪接位点)和氨基酸变化那是突变造成的。 数据将分析如下:
初步分析
- EXT 1 与 EXT 2
- 男性与女性
EXT 1 男性与 EXT 1 女性与 EXT 2 男性与 EXT 2 女性
二次分析
- 突变类型(错义与无义与剪接位点与移码)
- 早期或晚期突变(小于 1700 个碱基对与大于 1700 个碱基对)
对于 2-way 分析,将计算未配对的 t 检验,如果大于 2-way 分析,将计算 ANOVA。 由于样本量的巨大差异,每次比较都会计算功效。 统计显着性将设置为先验 0.05 和 0.8 的功效。
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习地点
-
-
British Columbia
-
Vancouver、British Columbia、加拿大、V6H 3V4
- BC Children's Hospital
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
- 孩子
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准:
- 诊断为 HME
排除标准
- 居住在不列颠哥伦比亚省以外的受试者无法在不列颠哥伦比亚省儿童医院现场进行基因检测和 X 光测量
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
- 观测模型:仅案例
- 时间观点:追溯
研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
大体时间 |
|---|---|
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通过 X 射线测量评估的骨科症状
大体时间:基因突变后鉴定
|
基因突变后鉴定
|
合作者和调查者
研究记录日期
研究主要日期
学习开始
初级完成 (预期的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (估计)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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