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全基因组单细胞单倍型分析作为植入前遗传学诊断的通用方法

2011年4月14日 更新者:Universitaire Ziekenhuizen KU Leuven
研究人员之前开发了 SNP 型、CNV 型和单倍型单倍体人类细胞的方法(Vanneste 等人,2009 年,Nature Medicine)。 这些方法为开发成一种新的通用诊断技术提供了可能性,这种技术扩大了在植入前遗传学诊断 (PGD) 期间可以选择的疾病等位基因的范围,并且能够帮助那些尚无法得到 PGD 支持的夫妇。 PGD​​ 是对来自体外受精 (IVF) 胚胎的单个卵裂球进行的遗传分析,它提供给夫妇以避免将可遗传的遗传疾病传染给他们的后代。 PGD​​ 分析针对 (1) 常染色体显性或隐性单基因疾病,(2) X 连锁疾病和 (3) 可能导致非整倍体受孕的染色体畸变进行。 这种新方法很可能优于并因此取代目前的植入前基因诊断技术。 在这个项目中,研究人员将把这项技术从原理验证带到临床应用。 为此,研究人员将对准确的单个卵裂球 SNP、CNV 和单倍体分型进行计算改进,并进行大型验证研究。 对于验证研究,研究人员将分析源自 60 个不同来源的备用胚胎的卵裂球基因组:(1) 使用当前的 PCR 和 FISH 方案诊断为遗传异常的胚胎。 (2) 使用当前的 PCR 和 FISH 协议诊断为调查区域正常的胚胎,但质量不足以转移或冷冻。 (3) 与基于 PGD 的性别选择相悖的性别选择的胚胎,或选择的性别胚胎质量不佳而无法移植或冷冻的胚胎。 (4) 未在 PGD 周期中进行活检的胚胎,因为它们会出现轻微的生长延迟。 这项验证研究将使我们能够评估 (1) 临床有效性(假阳性率和假阴性率)和 (2) 临床适用性(在易用性、成功率等方面)。 此外,它将为我们带来关于早期胚胎发生过程中染色体不稳定的起源和机制及其对 PGD 临床应用的影响的重要进一步基本见解。 最后,经过验证研究,该项目将临床实施该技术治疗10个家庭。

研究概览

地位

未知

研究类型

观察性的

注册 (预期的)

60

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

    • Vlaams Brabant
      • Leuven、Vlaams Brabant、比利时、3000
        • Universitaire Ziekenhuizen Leuven

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

  • 孩子
  • 成人
  • 年长者

接受健康志愿者

不

有资格学习的性别

全部

取样方法

概率样本

研究人群

我们的目标是收集 30 对选择植入前基因诊断的夫妇的备用胚胎(参见资格标准)。

描述

纳入标准:

从备用胚胎中活检的卵裂球((A) 使用当前的 PCR 和 FISH 协议诊断为遗传异常的胚胎;(B) 使用当前的 PCR 和 FISH 协议诊断为调查区域正常的胚胎,但质量不足以转移或冷冻;(C) 根据 PGD 性别选择选择的性别胚胎,或选择的性别胚胎质量不足以转移或冷冻;(D) 未进行活检的胚胎一个 PGD 周期,因为它们会出现轻微的生长延迟。) 来自以下患者群体:

  1. 第一个患者组涉及患有复杂染色体重排 (CCR) 的夫妇,该重排被定义为具有至少三个断点的结构性染色体重排以及两个或多个染色体之间的遗传物质交换。
  2. 第二组患者涉及患有 X 连锁隐性疾病的夫妇。
  3. 第三组患者由携带平衡染色体重排(易位、插入或倒位)的夫妇组成,这可能导致反复流产或非整倍体、严重残疾的后代。
  4. 第四个患者组是有单基因疾病传播风险的夫妇。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

  • 观测模型:仅案例
  • 时间观点:预期

队列和干预

团体/队列
干预/治疗
PGD​​-鱼

以下夫妇选择基于 FISH 进行植入前基因诊断:

  • 患有复杂染色体重排 (CCR) 的夫妇
  • 患有 X 连锁隐性疾病的夫妇
  • 携带平衡染色体重排的夫妇
我们的目标是从 30 对夫妇的备用 IVF 胚胎中收集单个卵裂球,以优化和测试单细胞单倍型分析的方法。 我们的目标是分别收集 20 对和 10 对夫妇来生育中心进行基于 FISH 或 PCR 的 PGD。 在两组中,将收集至少 5 种不同的 PGD 适应症。 每对夫妇,我们将执行 10 个 SNP 阵列:2 个用于捐赠胚胎的夫妇,4 个用于家庭成员(通常是夫妇的父母),4 个用于卵裂球,因为我们的目标是从每对夫妇的 2 个胚胎中挑选 2 个细胞。 对于五对夫妇,将吸出所有可用胚胎的 2 个卵裂球,以验证和优化定相方法。 最后,对于一些胚胎,将挑选所有卵裂球以能够证明单细胞单倍型分析的可重复性。
PGD​​-PCR

以下夫妇选择基于 PCR 进行植入前基因诊断:

- 有传播单基因疾病风险的夫妇

我们的目标是从 30 对夫妇的备用 IVF 胚胎中收集单个卵裂球,以优化和测试单细胞单倍型分析的方法。 我们的目标是分别收集 20 对和 10 对夫妇来生育中心进行基于 FISH 或 PCR 的 PGD。 在两组中,将收集至少 5 种不同的 PGD 适应症。 每对夫妇,我们将执行 10 个 SNP 阵列:2 个用于捐赠胚胎的夫妇,4 个用于家庭成员(通常是夫妇的父母),4 个用于卵裂球,因为我们的目标是从每对夫妇的 2 个胚胎中挑选 2 个细胞。 对于五对夫妇,将吸出所有可用胚胎的 2 个卵裂球,以验证和优化定相方法。 最后,对于一些胚胎,将挑选所有卵裂球以能够证明单细胞单倍型分析的可重复性。

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Joris R Vermeesch, Professor、Universitaire Ziekenhuizen KU Leuven
  • 首席研究员:Thierry Voet, Professor、KU Leuven
  • 首席研究员:Thomas D'Hooghe, Professor、Universitaire Ziekenhuizen KU Leuven
  • 首席研究员:Yves Moreau, Professor、KU Leuven
  • 首席研究员:Karen Sermon, Professor、Vrije Universiteit Brussel
  • 首席研究员:De Rycke Martine, Professor、Universitair Ziekenhuis Brussel

出版物和有用的链接

负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始

2010年10月1日

初级完成 (预期的)

2013年9月1日

研究完成 (预期的)

2013年9月1日

研究注册日期

首次提交

2011年4月13日

首先提交符合 QC 标准的

2011年4月14日

首次发布 (估计)

2011年4月15日

研究记录更新

最后更新发布 (估计)

2011年4月15日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2011年4月14日

最后验证

2010年4月1日

更多信息

与本研究相关的术语

其他相关的 MeSH 术语

其他研究编号

  • IWT-TBM-090878

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