Haplotipagem de célula única em todo o genoma como um método genérico para diagnóstico genético pré-implantação

Os pesquisadores já desenvolveram abordagens para células humanas únicas SNP-, CNV- e haplotipo (Vanneste et al. 2009, Nature Medicine). Esses métodos abrem a possibilidade de serem desenvolvidos em uma nova técnica de diagnóstico genérico que amplia o espectro de alelos de doenças que podem ser selecionados durante o diagnóstico genético pré-implantacional (PGD) e que permite ajudar os casais que ainda não podem ser apoiados pelo PGD. O PGD é a análise genética de um único blastômero de um embrião fertilizado in vitro (FIV) e é oferecido a casais para evitar a transmissão de distúrbios genéticos hereditários para seus descendentes. As análises PGD são realizadas para (1) doenças monogênicas autossômicas dominantes ou recessivas, (2) distúrbios ligados ao cromossomo X e (3) aberrações cromossômicas que podem resultar em concepções aneuplóides. Este novo método é susceptível de superar e, portanto, substituir as técnicas atuais de diagnóstico genético pré-implantação. Neste projeto, os pesquisadores trarão a tecnologia de uma prova de princípio para a aplicação clínica. Para este fim, os investigadores farão melhorias computacionais para SNP-, CNV- e haplotipagem precisa de blastômero único e realizarão um grande estudo de validação. Para o estudo de validação, os investigadores analisarão os genomas dos blastômeros derivados de 60 embriões sobressalentes de origem diferente: (1) Embriões diagnosticados como geneticamente anormais usando os protocolos atuais de PCR e FISH. (2) Embriões diagnosticados como normais para a região investigada usando os protocolos atuais de PCR e FISH, mas não de qualidade suficiente para serem transferidos ou congelados. (3) Embriões do sexo que é selecionado após seleção de sexo baseada em PGD, ou embriões do sexo que é selecionado, mas de qualidade insuficiente para serem transferidos ou congelados. (4) Embriões que não foram biopsiados em um ciclo PGD, pois sofrem um leve atraso no crescimento. Este estudo de validação permitirá avaliar (1) a validade clínica (taxa de falsos positivos e negativos) e (2) a aplicabilidade clínica (em termos de facilidade de uso, taxa de sucesso, etc.). Além disso, nos trará mais insights fundamentais essenciais sobre as origens e mecanismos de instabilidade cromossômica operando durante a embriogênese inicial e suas consequências para aplicações clínicas de PGD. Finalmente, após o estudo de validação, este projeto implementará clinicamente a técnica para tratar 10 famílias.