Haplotipado de células individuales de todo el genoma como método genérico para el diagnóstico genético previo a la implantación

Los investigadores desarrollaron previamente enfoques para células humanas únicas de tipo SNP, CNV y haplo (Vanneste et al. 2009, Nature Medicine). Estos métodos abren la posibilidad de convertirse en una técnica de diagnóstico genérica novedosa que amplíe el espectro de alelos de enfermedades contra los que se puede seleccionar durante el diagnóstico genético preimplantacional (PGD) y que permita ayudar a aquellas parejas que aún no pueden ser respaldadas por PGD. El PGD es el análisis genético de un solo blastómero de un embrión fertilizado in vitro (FIV) y se ofrece a las parejas para evitar la transmisión de trastornos genéticos hereditarios a su descendencia. Los análisis de PGD se realizan para (1) enfermedades monogénicas autosómicas dominantes o recesivas, (2) trastornos ligados al cromosoma X y (3) aberraciones cromosómicas que pueden resultar en concepciones aneuploides. Es probable que este nuevo método supere y, por lo tanto, reemplace las técnicas actuales para el diagnóstico genético preimplantacional. En este proyecto, los investigadores llevarán la tecnología de una prueba de principio a la aplicación clínica. Con este fin, los investigadores realizarán mejoras computacionales para la tipificación precisa de SNP, CNV y haplo de blastómeros individuales y realizarán un gran estudio de validación. Para el estudio de validación, los investigadores analizarán los genomas de los blastómeros derivados de 60 embriones sobrantes de diferente origen: (1) Embriones diagnosticados como genéticamente anormales utilizando los protocolos PCR y FISH actuales. (2) Embriones diagnosticados como normales para la región investigada usando los protocolos actuales de PCR y FISH, pero sin la calidad suficiente para ser transferidos o congelados. (3) Embriones del sexo que se selecciona en contra de la selección de sexo basada en PGD, o embriones del sexo que se selecciona pero de calidad insuficiente para ser transferidos o congelados. (4) Embriones que no fueron biopsiados en un ciclo de DGP ya que sufren un ligero retraso en el crecimiento. Este estudio de validación nos permitirá evaluar (1) la validez clínica (tasa de falsos positivos y negativos) y (2) la aplicabilidad clínica (en términos de facilidad de uso, tasa de éxito, etc.). Además, nos brindará conocimientos fundamentales adicionales sobre los orígenes y los mecanismos de inestabilidad cromosómica que operan durante la embriogénesis temprana y sus consecuencias para las aplicaciones clínicas del DGP. Finalmente, tras el estudio de validación, este proyecto implementará clínicamente la técnica para tratar a 10 familias.