横纹肌肉瘤患者的生物标志物

目标：

• 确定 ARMS 和 ERMS 中 DNA 甲基化的全基因组改变。
• 确定 ARMS 和 ERMS 中的全基因组 DNA 拷贝数变化。
• 通过综合基因组分析确定致病基因和通路。

大纲：将使用 HELP（通过连接介导的 PCR 富集 HpaII 微小片段）测定法对 ARMS、ERMS 和正常人骨骼肌成肌细胞进行全基因组 DNA 甲基化分析。 将分析启动子、基因体和基因间区域的 130 万个 CpG 的甲基化状态。 将进行平行基因表达分析并将其与甲基化变化相关联，以发现受表观遗传改变调节并因基因组丢失或增加而改变的基因。

MIGHT（人体组织基因组数据的多维整合）算法将选择在不同组患者中被遗传和表观遗传改变改变的基因，以发现可能参与 ARMS 和 ERMS 发病机制的新基因。 基因本体论、通路和 DNA 基序分析算法以及其他计算方法将用于确定变化的生物学后果。 一组优先的表观遗传和遗传改变将通过亚硫酸氢盐 MassArray、FISH 和 qRT-PCR 在大量 ARMS 和 ERMS 样本中进行验证。