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횡문근육종 환자의 바이오마커

2016년 5월 17일 업데이트: Children's Oncology Group

횡문근육종(RMS)의 유전자 발견에 대한 통합적 후성유전학적 접근법

근거: 실험실에서 암 환자의 조직 샘플을 연구하면 의사가 DNA에서 발생하는 변화에 대해 더 많이 배우고 암과 관련된 바이오마커를 식별하는 데 도움이 될 수 있습니다.

목적: 본 연구는 횡문근육종 환자의 바이오마커를 연구하고 있다.

연구 개요

상태

완전한

정황

육종

개입 / 치료

상세 설명

목표:

ARMS 및 ERMS에서 DNA 메틸화의 게놈 전체 변경을 결정합니다.
ARMS 및 ERMS에서 게놈 차원의 DNA 사본 수 변경을 결정합니다.
통합 게놈 분석을 통해 병원성 유전자 및 경로를 결정합니다.

개요: ARMS, ERMS 및 정상 인간 골격 근모세포에 대한 게놈 차원의 DNA 메틸화 분석은 HELP(결찰 매개 PCR에 의한 HpaII 작은 조각 강화) 분석을 사용하여 수행됩니다. 프로모터, 유전자 본체 및 유전자간 영역에서 130만 CpG의 메틸화 상태를 분석합니다. 병렬 유전자 발현 분석이 수행되고 메틸화의 변화와 연관되어 후생유전학적 변경에 의해 조절되고 게놈 손실 또는 이득에 의해 변경된 유전자를 밝혀냅니다.

ARMS 및 ERMS의 병인에 잠재적으로 관여할 수 있는 새로운 유전자를 발견하기 위해 MIGHT(인간 조직의 게놈 데이터의 다차원 통합) 알고리즘에 의해 서로 다른 환자 세트의 유전적 및 후성적 변형에 의해 변경된 유전자가 선택됩니다. 유전자 온톨로지, 경로, DNA 모티프 분석 알고리즘 및 기타 전산 접근 방식을 사용하여 변경 사항의 생물학적 결과를 결정합니다. 더 많은 수의 ARMS 및 ERMS 샘플에서 바이설파이트 MassArray, FISH 및 qRT-PCR에 의해 우선순위가 지정된 후생유전학적 및 유전적 변형 세트가 검증됩니다.

연구 유형

관찰

등록 (예상)

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

어린이
성인
고령자

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

아니

연구 대상 성별

모두

샘플링 방법

비확률 샘플

연구 인구

협동 인간 조직 네트워크(CHTN)

설명

질병 특성:

10개의 ARMS 및 10개의 ERMS 동결 샘플은 협동 인간 조직 네트워크(CHTN)를 통해 COG 은행에서 수집됩니다.
인간 골격 근모세포(ZenBio, Research Triangle Park, NC)가 대조군 역할을 할 것입니다.

환자 특성:

명시되지 않은

이전 동시 치료:

명시되지 않은

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
ARMS 및 ERMS에서 DNA 메틸화의 게놈 전체 변경
ARMS 및 ERMS에서 게놈 차원의 DNA 카피 수 변경
통합 게놈 분석에 의한 병원성 유전자 및 경로

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

스폰서

Children's Oncology Group

협력자

National Cancer Institute (NCI)

수사관

수석 연구원: Caroline Y. Hu, MD, Tomorrows Children's Institute at Hackensack University Medical Center

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작

2011년 10월 1일

기본 완료 (실제)

2016년 5월 1일

연구 등록 날짜

최초 제출

2011년 11월 2일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2011년 11월 2일

처음 게시됨 (추정)

2011년 11월 6일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (추정)

2016년 5월 19일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2016년 5월 17일

마지막으로 확인됨