Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Biomarkery u pacjentów z mięśniakomięsakiem prążkowanokomórkowym

17 maja 2016 zaktualizowane przez: Children's Oncology Group

Integracyjne podejście epigenomiczne do wykrywania genów w mięsaku prążkowanokomórkowym (RMS)

UZASADNIENIE: Badanie próbek tkanek od pacjentów z rakiem w laboratorium może pomóc lekarzom dowiedzieć się więcej o zmianach zachodzących w DNA i zidentyfikować biomarkery związane z rakiem.

CEL: To badanie naukowe dotyczy biomarkerów u pacjentów z mięśniakomięsakiem prążkowanokomórkowym.

Przegląd badań

Status

Zakończony

Warunki

Interwencja / Leczenie

Szczegółowy opis

CELE:

  • Określ zmiany w całym genomie w metylacji DNA w ARMS i ERMS.
  • Określ zmiany liczby kopii DNA w całym genomie w ARMS i ERMS.
  • Określ patogenne geny i szlaki poprzez integracyjną analizę genomową.

ZARYS: Analiza metylacji DNA całego genomu na ARMS, ERMS i normalnych ludzkich mioblastach szkieletowych zostanie przeprowadzona przy użyciu testu HELP (wzbogacanie małych fragmentów HpaII przez PCR za pośrednictwem ligacji). Przeanalizowany zostanie status metylacji 1,3 miliona CpG w promotorach, ciałach genów i obszarach międzygenowych. Przeprowadzona zostanie równoległa analiza ekspresji genów i skorelowana ze zmianami w metylacji, aby odkryć geny regulowane przez zmiany epigenetyczne i zmienione przez straty lub zyski genomowe.

Geny zmienione zarówno przez zmiany genetyczne, jak i epigenetyczne w różnych zestawach pacjentów zostaną wybrane przez algorytm MIGHT (wielowymiarowa integracja danych genomowych z ludzkich tkanek), aby odkryć nowe geny, które są potencjalnie zaangażowane w patogenezę ARMS i ERMS. Algorytmy analizy ontologii genów, szlaków i motywów DNA oraz inne podejścia obliczeniowe zostaną wykorzystane do określenia biologicznych konsekwencji zmian. Priorytetowy zestaw zmian epigenetycznych i genetycznych zostanie zweryfikowany za pomocą wodorosiarczynu MassArray, FISH i qRT-PCR w większej liczbie próbek ARMS i ERMS.

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Oczekiwany)

20

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

  • Dziecko
  • Dorosły
  • Starszy dorosły

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Płeć kwalifikująca się do nauki

Wszystko

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Spółdzielcza sieć tkanek ludzkich (CHTN)

Opis

CHARAKTERYSTYKA CHOROBY:

  • 10 zamrożonych próbek ARMS i 10 ERMS zostanie pobranych z banku COG za pośrednictwem Cooperative Human Tissue Network (CHTN)
  • Ludzkie mioblasty szkieletowe (ZenBio, Research Triangle Park, Karolina Północna) będą służyć jako kontrole

CHARAKTERYSTYKA PACJENTA:

  • Nieokreślony

WCZEŚNIEJSZA TERAPIA RÓWNOCZESNA:

  • Nieokreślony

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Zmiany w całym genomie w metylacji DNA w ARMS i ERMS
Zmiany liczby kopii DNA w całym genomie w ARMS i ERMS
Patogenne geny i szlaki poprzez integracyjną analizę genomową

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

Children's Oncology Group

Współpracownicy

National Cancer Institute (NCI)

Śledczy

  • Główny śledczy: Caroline Y. Hu, MD, Tomorrows Children's Institute at Hackensack University Medical Center

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów

1 października 2011

Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)

1 maja 2016

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

2 listopada 2011

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

2 listopada 2011

Pierwszy wysłany (Oszacować)

6 listopada 2011

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Oszacować)

19 maja 2016

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

17 maja 2016

Ostatnia weryfikacja

1 maja 2016

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Słowa kluczowe

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • ARST12B2 (Inny identyfikator: Children's Oncology Group)
  • COG-ARST12B2 (Inny identyfikator: Children's Oncology Group)
  • NCI-2011-03634 (Identyfikator rejestru: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Badania kliniczne na Mięsak

Badania kliniczne na analiza ekspresji genów

Wyszukaj podobne próby

Sponsorzy i współpracownicy

Warunki medyczne

Interwencje lekowe

CROs by country

CROs in Mongolia

Warunki

Rzadkie choroby

Interwencje lekowe

Suplementy diety

Sponsor / Współpracownicy

Lokalizacje

Subskrybuj