Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Biomarkører hos patienter med rhabdomyosarkom

17. maj 2016 opdateret af: Children's Oncology Group

Integrativ epigenomisk tilgang til genopdagelse i rhabdomyosarkom (RMS)

RATIONALE: At studere prøver af væv fra patienter med kræft i laboratoriet kan hjælpe læger med at lære mere om ændringer, der opstår i DNA, og identificere biomarkører relateret til kræft.

FORMÅL: Dette forskningsstudie studerer biomarkører hos patienter med rhabdomyosarkom.

Studieoversigt

Detaljeret beskrivelse

MÅL:

  • Bestem genomomfattende ændringer i DNA-methylering i ARMS og ERMS.
  • Bestem ændringer i DNA-kopinummeret i hele genomet i ARMS og ERMS.
  • Bestem patogene gener og pathways ved integrativ genomisk analyse.

OVERSIGT: Genomomfattende DNA-methyleringsanalyse på ARMS, ERMS og normale humane skeletmyoblaster vil blive udført ved hjælp af HELP (HpaII tiny fragment Enrichment by Ligation-mediated PCR) assay. Methyleringsstatus for 1,3 millioner CpG'er ved promotorer, genlegemer og intergene områder vil blive analyseret. Parallel genekspressionsanalyse vil blive udført og korreleret med ændringer i methylering for at afdække gener reguleret af epigenetiske ændringer og ændret af genomiske tab eller gevinster.

Gener, der er ændret af både genetiske og epigenetiske ændringer i forskellige sæt af patienter, vil blive udvalgt af MIGHT (Multi-dimensional Integration of Genomic data from Human Tissues) algoritmen for at afdække nye gener, der potentielt er involveret i patogenesen af ​​ARMS og ERMS. Genontologi, pathway- og DNA-motivanalysealgoritmer og andre beregningsmæssige tilgange vil blive brugt til at bestemme de biologiske konsekvenser af ændringerne. Prioriterede sæt af epigenetiske og genetiske ændringer vil blive valideret af bisulfit MassArray, FISH og qRT-PCR i et større antal ARMS- og ERMS-prøver.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Forventet)

20

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

  • Barn
  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Cooperative Human Tissue Network (CHTN)

Beskrivelse

SYGDOMS KARAKTERISTIKA:

  • 10 ARMS og 10 ERMS frosne prøver vil blive indsamlet fra COG-banken via Cooperative Human Tissue Network (CHTN)
  • Menneskelige skeletmyoblaster (ZenBio, Research Triangle Park, NC) vil tjene som kontroller

PATIENT KARAKTERISTIKA:

  • Ikke specificeret

FORUDSÆTNING SAMTYDLIG TERAPI:

  • Ikke specificeret

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Genomomfattende ændringer i DNA-methylering i ARMS og ERMS
Ændringer i DNA-kopinummer i hele ARMS og ERMS
Patogene gener og veje ved integrativ genomisk analyse

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Samarbejdspartnere

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Caroline Y. Hu, MD, Tomorrows Children's Institute at Hackensack University Medical Center

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart

1. oktober 2011

Primær færdiggørelse (Faktiske)

1. maj 2016

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

2. november 2011

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

2. november 2011

Først opslået (Skøn)

6. november 2011

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Skøn)

19. maj 2016

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

17. maj 2016

Sidst verificeret

1. maj 2016

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Andre undersøgelses-id-numre

  • ARST12B2 (Anden identifikator: Children's Oncology Group)
  • COG-ARST12B2 (Anden identifikator: Children's Oncology Group)
  • NCI-2011-03634 (Registry Identifier: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Sarkom

Kliniske forsøg med genekspressionsanalyse

Abonner