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Biomarker bei Patienten mit Rhabdomyosarkom

17. Mai 2016 aktualisiert von: Children's Oncology Group

Integrativer epigenomischer Ansatz zur Genentdeckung beim Rhabdomyosarkom (RMS)

BEGRÜNDUNG: Die Untersuchung von Gewebeproben von Krebspatienten im Labor kann Ärzten dabei helfen, mehr über Veränderungen in der DNA zu erfahren und krebsbedingte Biomarker zu identifizieren.

ZWECK: Diese Forschungsstudie untersucht Biomarker bei Patienten mit Rhabdomyosarkom.

Studienübersicht

Status

Abgeschlossen

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Detaillierte Beschreibung

ZIELE:

  • Bestimmen Sie genomweite Veränderungen der DNA-Methylierung in ARMS und ERMS.
  • Bestimmen Sie genomweite Veränderungen der DNA-Kopienzahl in ARMS und ERMS.
  • Bestimmen Sie pathogene Gene und Signalwege durch integrative Genomanalyse.

ÜBERBLICK: Eine genomweite DNA-Methylierungsanalyse an ARMS, ERMS und normalen menschlichen Skelettmyoblasten wird unter Verwendung des HELP-Assays (HpaII tiny fragment Enrichment by Ligation-mediated PCR) durchgeführt. Der Methylierungsstatus von 1,3 Millionen CpGs an Promotoren, Genkörpern und intergenen Bereichen wird analysiert. Es werden parallele Genexpressionsanalysen durchgeführt und mit Veränderungen in der Methylierung korreliert, um Gene aufzudecken, die durch epigenetische Veränderungen reguliert und durch genomische Verluste oder Gewinne verändert werden.

Gene, die sowohl durch genetische als auch epigenetische Veränderungen in verschiedenen Patientengruppen verändert werden, werden durch den MIGHT-Algorithmus (Multi-dimensional Integration of Genomic data from Human Tissues) ausgewählt, um neue Gene aufzudecken, die möglicherweise an der Pathogenese von ARMS und ERMS beteiligt sind. Zur Bestimmung der biologischen Folgen der Veränderungen werden Genontologie-, Signalweg- und DNA-Motivanalysealgorithmen sowie andere rechnerische Ansätze eingesetzt. Ein priorisierter Satz epigenetischer und genetischer Veränderungen wird durch Bisulfit-MassArray, FISH und qRT-PCR in einer größeren Anzahl von ARMS- und ERMS-Proben validiert.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Voraussichtlich)

20

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Kind
  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Kooperatives Netzwerk für menschliches Gewebe (CHTN)

Beschreibung

EIGENSCHAFTEN DER KRANKHEIT:

  • 10 gefrorene ARMS- und 10 ERMS-Proben werden über das Cooperative Human Tissue Network (CHTN) von der COG-Bank gesammelt.
  • Als Kontrollen dienen menschliche Skelettmyoblasten (ZenBio, Research Triangle Park, NC).

PATIENTENMERKMALE:

  • Nicht angegeben

VORHERIGE GLEICHZEITIGE THERAPIE:

  • Nicht angegeben

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Genomweite Veränderungen der DNA-Methylierung in ARMS und ERMS
Genomweite Veränderungen der DNA-Kopienzahl in ARMS und ERMS
Pathogene Gene und Signalwege durch integrative Genomanalyse

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Children's Oncology Group

Mitarbeiter

National Cancer Institute (NCI)

Ermittler

  • Hauptermittler: Caroline Y. Hu, MD, Tomorrows Children's Institute at Hackensack University Medical Center

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn

1. Oktober 2011

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

1. Mai 2016

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

2. November 2011

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

2. November 2011

Zuerst gepostet (Schätzen)

6. November 2011

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Schätzen)

19. Mai 2016

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

17. Mai 2016

Zuletzt verifiziert

1. Mai 2016

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Schlüsselwörter

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • ARST12B2 (Andere Kennung: Children's Oncology Group)
  • COG-ARST12B2 (Andere Kennung: Children's Oncology Group)
  • NCI-2011-03634 (Registrierungskennung: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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