- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT01466283
Biomarkery u pacientů s rabdomyosarkomem
Integrativní epigenomický přístup k objevování genů u rabdomyosarkomu (RMS)
ZDŮVODNĚNÍ: Studium vzorků tkáně od pacientů s rakovinou v laboratoři může lékařům pomoci dozvědět se více o změnách, ke kterým dochází v DNA, a identifikovat biomarkery související s rakovinou.
ÚČEL: Tato výzkumná studie studuje biomarkery u pacientů s rhabdomyosarkomem.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
CÍLE:
- Určete celogenomové změny v metylaci DNA v ARMS a ERMS.
- Určete změny počtu kopií DNA v celém genomu v ARMS a ERMS.
- Určete patogenní geny a cesty integrativní genomickou analýzou.
PŘEHLED: Analýza methylace DNA v celém genomu na ARMS, ERMS a normálních lidských kosterních myoblastech bude provedena pomocí testu HELP (HpaII tiny fragment Enrichment by Ligation-mediated PCR). Bude analyzován stav metylace 1,3 milionu CpG v promotorech, tělech genů a intergenových oblastech. Bude provedena analýza paralelní genové exprese a korelována se změnami v metylaci, aby se odhalily geny regulované epigenetickými změnami a změněné genomickými ztrátami nebo zisky.
Geny, které jsou změněny jak genetickými, tak epigenetickými změnami u různých souborů pacientů, budou vybrány pomocí algoritmu MIGHT (Multi-dimensional Integration of Genomic data from Human Tissues), aby se odhalily nové geny, které se potenciálně podílejí na patogenezi ARMS a ERMS. K určení biologických důsledků změn budou použity algoritmy genové ontologie, analýzy drah a motivů DNA a další výpočetní přístupy. Prioritní sada epigenetických a genetických změn bude ověřena bisulfitovým MassArray, FISH a qRT-PCR ve větším počtu vzorků ARMS a ERMS.
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
CHARAKTERISTIKA ONEMOCNĚNÍ:
- 10 ARMS a 10 ERMS zmrazených vzorků bude odebráno z COG banky prostřednictvím Cooperative Human Tissue Network (CHTN)
- Jako kontroly budou sloužit lidské kosterní myoblasty (ZenBio, Research Triangle Park, NC).
CHARAKTERISTIKA PACIENTA:
- Nespecifikováno
PŘEDCHOZÍ SOUČASNÁ TERAPIE:
- Nespecifikováno
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
|---|
|
Genomové změny v methylaci DNA v ARMS a ERMS
|
|
Změny počtu kopií DNA v celém genomu v ARMS a ERMS
|
|
Patogenní geny a dráhy integrativní genomickou analýzou
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Caroline Y. Hu, MD, Tomorrows Children's Institute at Hackensack University Medical Center
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhad)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Odhad)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- ARST12B2 (Jiný identifikátor: Children's Oncology Group)
- COG-ARST12B2 (Jiný identifikátor: Children's Oncology Group)
- NCI-2011-03634 (Identifikátor registru: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na analýza genové exprese
-
University Hospital, ToulouseNábor
-
Burcin CelikOndokuz Mayıs UniversityZatím nenabírámeChronická obstrukční plicní nemoc (CHOPN)
-
Philips Consumer LifestyleDokončeno
-
Istituto per la Ricerca e l'Innovazione BiomedicaNábor
-
University of VirginiaNeznámý
-
IRCCS Eugenio MedeaDokončenoPoruchou autistického spektra | Včasná intervenceItálie
-
University of AlbertaNáborMrtvice | Dětská mozková obrna | Traumatické zranění mozku | Poranění míchy | Idiopatická chůze po prstech | Dědičná spastická paraparéza | Tethering míchy | Dědičná smyslová motorická neuropatieKanada
-
Johns Hopkins UniversityNational Institute on Deafness and Other Communication Disorders (NIDCD); GN...DokončenoZávrať | ZávraťSpojené státy
-
The Cleveland ClinicNational Heart, Lung, and Blood Institute (NHLBI)DokončenoAneuryzma břišní aortySpojené státy
-
QIAGEN Gaithersburg, IncDokončeno