- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT01466283
Biomarcatori in pazienti con rabdomiosarcoma
Approccio epigenomico integrativo alla scoperta genica nel rabdomiosarcoma (RMS)
RAZIONALE: Lo studio di campioni di tessuto di pazienti affetti da cancro in laboratorio può aiutare i medici a saperne di più sui cambiamenti che si verificano nel DNA e identificare i biomarcatori correlati al cancro.
SCOPO: Questo studio di ricerca sta studiando i biomarcatori nei pazienti con rabdomiosarcoma.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Descrizione dettagliata
OBIETTIVI:
- Determina le alterazioni dell'intero genoma nella metilazione del DNA in ARMS e ERMS.
- Determina le alterazioni del numero di copie del DNA a livello di genoma in ARMS e ERMS.
- Determinare geni patogeni e percorsi mediante analisi genomica integrativa.
SCHEMA: L'analisi della metilazione del DNA dell'intero genoma su ARMS, ERMS e mioblasti scheletrici umani normali sarà condotta utilizzando il test HELP (HpaII tiny fragment Enrichment by Ligation-mediated PCR). Verrà analizzato lo stato di metilazione di 1,3 milioni di CpG a promotori, corpi genici e aree intergeniche. L'analisi parallela dell'espressione genica sarà eseguita e correlata con i cambiamenti nella metilazione per scoprire geni regolati da alterazioni epigenetiche e alterati da perdite o guadagni genomici.
I geni che sono alterati da alterazioni sia genetiche che epigenetiche in diversi gruppi di pazienti saranno selezionati dall'algoritmo MIGHT (Multi-dimensional Integration of Genomic data from Human Tissues) per scoprire nuovi geni che sono potenzialmente coinvolti nella patogenesi di ARMS e ERMS. Per determinare le conseguenze biologiche dei cambiamenti verranno utilizzati algoritmi di analisi dell'ontologia genica, del percorso e del motivo del DNA e altri approcci computazionali. L'insieme prioritario di alterazioni epigenetiche e genetiche sarà convalidato da bisolfito MassArray, FISH e qRT-PCR in un numero maggiore di campioni ARMS ed ERMS.
Tipo di studio
Iscrizione (Anticipato)
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Bambino
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
CARATTERISTICHE DELLA MALATTIA:
- 10 campioni congelati ARMS e 10 campioni ERMS saranno raccolti dalla banca COG tramite la Cooperative Human Tissue Network (CHTN)
- I mioblasti scheletrici umani (ZenBio, Research Triangle Park, NC) fungeranno da controlli
CARATTERISTICHE DEL PAZIENTE:
- Non specificato
TERAPIA CONCORRENTE PRECEDENTE:
- Non specificato
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
|---|
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Alterazioni dell'intero genoma nella metilazione del DNA in ARMS e ERMS
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Alterazioni del numero di copie del DNA a livello di genoma in ARMS e ERMS
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Geni e percorsi patogeni mediante analisi genomica integrativa
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Collaboratori
Investigatori
- Investigatore principale: Caroline Y. Hu, MD, Tomorrows Children's Institute at Hackensack University Medical Center
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Inizio studio
Completamento primario (Effettivo)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Stima)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Stima)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- ARST12B2 (Altro identificatore: Children's Oncology Group)
- COG-ARST12B2 (Altro identificatore: Children's Oncology Group)
- NCI-2011-03634 (Identificatore di registro: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
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Prove cliniche su analisi dell'espressione genica
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Ruijin HospitalRenJi Hospital; West China Hospital; Shandong Provincial Hospital; Tianjin Medical... e altri collaboratoriReclutamentoLinfoma a cellule T perifericheCina