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Biomarcatori in pazienti con rabdomiosarcoma

17 maggio 2016 aggiornato da: Children's Oncology Group

Approccio epigenomico integrativo alla scoperta genica nel rabdomiosarcoma (RMS)

RAZIONALE: Lo studio di campioni di tessuto di pazienti affetti da cancro in laboratorio può aiutare i medici a saperne di più sui cambiamenti che si verificano nel DNA e identificare i biomarcatori correlati al cancro.

SCOPO: Questo studio di ricerca sta studiando i biomarcatori nei pazienti con rabdomiosarcoma.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

OBIETTIVI:

  • Determina le alterazioni dell'intero genoma nella metilazione del DNA in ARMS e ERMS.
  • Determina le alterazioni del numero di copie del DNA a livello di genoma in ARMS e ERMS.
  • Determinare geni patogeni e percorsi mediante analisi genomica integrativa.

SCHEMA: L'analisi della metilazione del DNA dell'intero genoma su ARMS, ERMS e mioblasti scheletrici umani normali sarà condotta utilizzando il test HELP (HpaII tiny fragment Enrichment by Ligation-mediated PCR). Verrà analizzato lo stato di metilazione di 1,3 milioni di CpG a promotori, corpi genici e aree intergeniche. L'analisi parallela dell'espressione genica sarà eseguita e correlata con i cambiamenti nella metilazione per scoprire geni regolati da alterazioni epigenetiche e alterati da perdite o guadagni genomici.

I geni che sono alterati da alterazioni sia genetiche che epigenetiche in diversi gruppi di pazienti saranno selezionati dall'algoritmo MIGHT (Multi-dimensional Integration of Genomic data from Human Tissues) per scoprire nuovi geni che sono potenzialmente coinvolti nella patogenesi di ARMS e ERMS. Per determinare le conseguenze biologiche dei cambiamenti verranno utilizzati algoritmi di analisi dell'ontologia genica, del percorso e del motivo del DNA e altri approcci computazionali. L'insieme prioritario di alterazioni epigenetiche e genetiche sarà convalidato da bisolfito MassArray, FISH e qRT-PCR in un numero maggiore di campioni ARMS ed ERMS.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Anticipato)

20

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Bambino
  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

No

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Rete cooperativa del tessuto umano (CHTN)

Descrizione

CARATTERISTICHE DELLA MALATTIA:

  • 10 campioni congelati ARMS e 10 campioni ERMS saranno raccolti dalla banca COG tramite la Cooperative Human Tissue Network (CHTN)
  • I mioblasti scheletrici umani (ZenBio, Research Triangle Park, NC) fungeranno da controlli

CARATTERISTICHE DEL PAZIENTE:

  • Non specificato

TERAPIA CONCORRENTE PRECEDENTE:

  • Non specificato

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Alterazioni dell'intero genoma nella metilazione del DNA in ARMS e ERMS
Alterazioni del numero di copie del DNA a livello di genoma in ARMS e ERMS
Geni e percorsi patogeni mediante analisi genomica integrativa

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Investigatore principale: Caroline Y. Hu, MD, Tomorrows Children's Institute at Hackensack University Medical Center

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio

1 ottobre 2011

Completamento primario (Effettivo)

1 maggio 2016

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

2 novembre 2011

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

2 novembre 2011

Primo Inserito (Stima)

6 novembre 2011

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Stima)

19 maggio 2016

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

17 maggio 2016

Ultimo verificato

1 maggio 2016

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Altri numeri di identificazione dello studio

  • ARST12B2 (Altro identificatore: Children's Oncology Group)
  • COG-ARST12B2 (Altro identificatore: Children's Oncology Group)
  • NCI-2011-03634 (Identificatore di registro: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su analisi dell'espressione genica

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