N-PhenoGENICS：儿童白血病幸存者的神经认知现象、基因组、表观基因组和营养组 (NPG)
2020年10月6日 更新者：Shinya Ito、The Hospital for Sick Children
寻找可能的治疗目标，以帮助预防可能由化疗引起的儿童白血病幸存者的长期大脑和行为副作用（治疗相关的晚期不良神经认知效应：TRANCE）。
研究假设是叶酸相关循环和甲氨蝶呤处置网络中元素的遗传变异与儿童白血病幸存者的缺陷表型 (TRANCE) 相关。
研究概览
地位
完全的
条件
详细说明
假设 叶酸相关循环和甲氨蝶呤处置网络中元素的遗传变异与儿童白血病幸存者的 TRANCE 表型相关。
目标
- 确定儿童白血病幸存者的 TRANCE 表型。
- 表征这些儿童的叶酸和维生素 B12 水平
- 鉴定与白血病幸存者 TRANCE 特征相关的 DNA 甲基化模式
- 鉴定与白血病幸存者的 TRANCE 特征相关的 SNP。
- 确定仅与 TRANCE 白血病幸存者相关的“缺陷基因型”，但与表现出类似于 TRANCE 的发育表型的普通人群儿童无关：TRANCE 独特的缺陷变异
- 在儿童白血病幸存者群体中复制 TRANCE 独特缺陷变异与 TRANCE 特征之间的关联。
- 评估罕见遗传变异在白血病幸存者 TRANCE 特征中的重要性。
研究设计：白血病幸存者的病例对照研究
分析
- 白血病幸存者将通过他们的神经认知功能状态来表征，并分为缺陷病例和非缺陷对照病例。
它们还将具有以下属性
- 基于通路的遗传变异状态（叶酸和 PK 相关基因）
- 叶酸和维生素 B12 的状态
- 表观遗传标记
- 神经认知缺陷表型 (TRANCE) 与对照对这些参数的比较分析
研究类型
观察性的
注册 (实际的)
204
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
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Ontario
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Toronto、Ontario、加拿大、M5G 1X8
- The Hospital for Sick Children
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
8年 至 20年 (孩子、成人)
接受健康志愿者
不
有资格学习的性别
全部
取样方法
非概率样本
研究人群
儿童白血病幸存者
描述
纳入标准：
- 既往诊断为急性淋巴细胞白血病
- 8 岁 : 0 个月 - 20 岁 : 11 个月 在他们的研究访问时
- 至少 2 年 : 在他们的研究访问时最后一次治疗急性淋巴细胞白血病后 0 个月
- 持续完全缓解且未接受骨髓移植或颅脑放射治疗
- 英语流利（一名受试者和一名家长）以完成测试
- 签署知情同意书
排除标准：
- 无法完成表型测试
- 唐氏综合症诊断
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
- 观测模型：病例对照
- 时间观点：预期
队列和干预
团体/队列 |
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具有神经认知缺陷的白血病幸存者
具有神经认知缺陷表型的白血病幸存者。
基于 DIVERGET 和其他表型分析工具，我们将识别那些具有缺陷表型的人。
这将被视为“案例”。
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没有神经认知缺陷的白血病幸存者
与上述定义的对照组相比，未表现出神经认知功能受损的白血病幸存者。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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发散
大体时间：入学后6个月内
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这是一组简短的测试，已被证明可以预测儿童癌症幸存者的整体和学术障碍。
所有神经认知测试都在同一天完成。
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入学后6个月内
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停止信号任务 (SST)
大体时间：入学后6个月内
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反应抑制，受到行为注意力不集中的干扰，将使用我们基于任务的计算机程序，停止信号任务 (SST) 来表征。
所有神经认知测试都在同一天完成。
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入学后6个月内
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康纳斯 3
大体时间：入学后6个月内
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为了表征行为方面，我们将根据家长报告管理标准措施。
所有神经认知测试都在同一天完成。
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入学后6个月内
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基于通路的基因变异状态
大体时间：报名结束后3个月内
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在假设驱动的全基因组方法中，我们将关注候选通路/区域，包括（但不限于）：a）叶酸/甲硫氨酸循环基因和转运蛋白； b) 药物代谢酶和转运蛋白（包括 CYP、SLC 和 ABC 转运蛋白家族）； c) 表观遗传修饰因子； d) 神经再生和组织修复。
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报名结束后3个月内
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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WISC-IV
大体时间：入学后6个月内
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为了在我们的样本中确认 DIVERGT 的有效性，并为未来的研究提供数据源，我们将包括一般认知功能测试 (WISC-IV)。
所有神经认知测试都在同一天完成。
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入学后6个月内
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WIAT-III 数值运算和数学流畅性综合评分
大体时间：入学后6个月内
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为了在我们的样本中确认 DIVERGT 的有效性，并为未来的研究提供数据源，我们将包括一般认知功能测试：WIAT-III 数值运算和数学流畅性综合得分。
所有神经认知测试都在同一天完成。
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入学后6个月内
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执行功能的简要评级清单 (BRIEF)
大体时间：入学后6个月内
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为了在我们的样本中确认 DIVERGT 的有效性，并为未来的研究提供数据源，我们将管理执行功能的简要评级清单 (BRIEF)，该清单旨在评估家庭环境中的执行功能。
所有神经认知测试都在同一天完成。
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入学后6个月内
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N-Back任务
大体时间：入学后6个月内
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为了在我们的样本中确认 DIVERGT 的有效性，并为未来的研究提供数据源，我们将执行 N-Back 任务，这是一个连续的性能计算机化任务，用于测量工作记忆的各个方面。
所有神经认知测试都在同一天完成。
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入学后6个月内
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叶酸、维生素 B12 和铁的摄入量
大体时间：入学后6个月内
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叶酸和其他维生素的摄入量因人而异。
加拿大食品中的叶酸强化改变了加拿大人口的叶酸状况标准，几乎消除了叶酸缺乏状况。
然而，仍然存在较大的个体间差异。
我们将使用补充调查问卷来收集有关参与者当前可能服用的所有和任何补充剂的信息。
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入学后6个月内
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叶酸状态
大体时间：入学后6个月内
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为了补充补充问卷（上文），我们将测量血浆和红细胞中的叶酸浓度。
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入学后6个月内
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血清维生素B12
大体时间：入学后6个月内
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维生素 B12 和叶酸途径相互作用以维持生化稳态。
为了补充摄入量评估（上文），我们将测量血清维生素 B12。
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入学后6个月内
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铁状态
大体时间：入学后6个月内
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铁的状态影响儿童的认知功能。
除了摄入量评估（上图）外，我们还将通过测量血红蛋白和可溶性转铁蛋白受体来评估铁的状态。
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入学后6个月内
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其他结果措施
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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表观遗传标记
大体时间：报名结束后3个月内
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DNA 甲基化信号代表了最稳定的表观遗传标记之一，已知其会受到包括药物和叶酸等营养素在内的环境因素的影响。
通过这些因素传递的环境信息被转化为由 DNA 甲基化介导的基因表达变化。
虽然这可能会导致白血病幸存者的神经认知缺陷，但在这方面没有先前的数据。
因此，这项探索性分析的目的是确定是否有任何迹象表明参与者的 DNA 甲基化模式发生了改变。
DNA 将从每个血液、口腔拭子和唾液样本中分离出来，并使用亚硫酸氢钠进行修饰，然后用于确定 DNA 甲基化模式。
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报名结束后3个月内
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
合作者
调查人员
- 首席研究员：Dr. Shinya Ito, MD、The Hospital for Sick Children
- 首席研究员：Dr. Sharon Guger、The Hospital for Sick Children
- 首席研究员：Dr. Johann Hitzler、The Hospital for Sick Children
- 首席研究员：Dr. Deborah L O'Connor、The Hospital for Sick Children
- 首席研究员：Dr. Russell Schachar、The Hospital for Sick Children
- 首席研究员：Dr. Brenda Spiegler、The Hospital for Sick Children
- 首席研究员：Dr. Rosanna Weksberg、The Hospital for Sick Children
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2013年7月1日
初级完成 (实际的)
2018年1月1日
研究完成 (实际的)
2019年6月1日
研究注册日期
首次提交
2013年7月29日
首先提交符合 QC 标准的
2013年7月29日
首次发布 (估计)
2013年7月31日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2020年10月8日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2020年10月6日
最后验证
2020年10月1日
更多信息
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