II 期研究使用基因组和蛋白质组学分析来影响转移性乳腺癌患者的治疗
一项利用基因组和蛋白质组学分析寻找潜在靶点并影响转移性乳腺癌患者治疗的 II 期试点研究
基因是构成我们身体并由 DNA 构成的细胞的基本“说明书”。 许多研究都是为了找到治疗癌症患者的最佳方法。 最近,人们对开发新的抗癌药物产生了极大的兴趣,这些药物更针对患者的个体遗传信息,以及由人的基因缺陷引起的疾病。
准确地确定针对特定患者的肿瘤使用哪些治疗方法具有挑战性。 在这项研究中,将使用四种尖端技术来识别基因组(我们从 DNA 和 RNA 获得的信息)和蛋白质组(我们从蛋白质获得的信息)目标,以治疗您的肿瘤。 这四种测试将一起使用来收集有关您的肿瘤的信息,让医生和科学家更好地了解您的肿瘤结构以及什么是最适合您的治疗或治疗组合。 您接受的治疗肿瘤的疗法将基于您的病史、先前对您疾病的治疗(如果适用)、当前健康状况以及这四项测试的结果。 您最终接受的治疗将由您的医生在咨询癌症和癌症基因组学专家小组(治疗选择委员会)后选择。
研究概览
详细说明
DNA 包含的遗传信息可以作为人体各部分构造和工作方式的蓝图,决定眼睛和头发的颜色等。 DNA 由形成代码的长链重复字母组成。 这些字母的书写顺序非常精确。 就像单词中的拼写错误可能会完全改变其含义(例如,mean 和 meat)一样,DNA 序列的单一变化可能会导致身体工作方式发生变化,从而可能导致疾病。 目前,研究人员和医生知道一些可能导致疾病的基因变化,但他们不知道所有可能导致疾病的基因变化。
蛋白质是您身体的基本组成部分。 身体的各个部分,例如肌肉、皮肤和器官,主要由蛋白质组成。 DNA 提供了每种蛋白质应该如何制造的计划或说明。 如果您的 DNA 发生变化,则蛋白质的制造方式可能会发生变化。 有时这些变化会导致疾病。 为了制造蛋白质,您体内的细胞会提取 DNA 并制作一份称为 RNA 的副本。 细胞读取 RNA 以制造蛋白质。 DNA 可以被认为是原始的总体规划,而 RNA 是该规划的复印件。 RNA 的拷贝数可以决定可以制造的蛋白质的数量。 如果身体需要更多的蛋白质,它可以制造更多的 RNA,但如果它需要更少的蛋白质,它也可以切碎 RNA,使其无法读取。 特定 RNA 或蛋白质的数量对于身体的运作方式也很重要。 过多或过少的特定蛋白质也会导致疾病。 了解 DNA、RNA 和蛋白质之间的关系对于了解疾病的病因和治疗方法非常重要。
准确地确定针对特定患者的肿瘤使用哪些治疗方法具有挑战性。 在这项研究中,将使用四种尖端技术来识别基因组(我们从 DNA 和 RNA 获得的信息)和蛋白质组(我们从蛋白质获得的信息)目标,以治疗您的肿瘤。 这四种测试将一起使用来收集有关您的肿瘤的信息,让医生和科学家更好地了解您的肿瘤结构以及什么是最适合您的治疗或治疗组合。 您接受的治疗肿瘤的疗法将基于您的病史、先前对您疾病的治疗(如果适用)、当前健康状况以及这四项测试的结果。 您最终接受的治疗将由您的医生在咨询癌症和癌症基因组学专家小组(治疗选择委员会)后选择。
本研究的目的是使用四种不同的分析方法,基于蛋白质组学和基因组分析来检查靶向治疗对乳腺癌的影响。
- 反相蛋白质微阵列将用于确定特定蛋白质的出现频率,这些蛋白质可能使肿瘤对治疗敏感或耐药。
- 免疫组织化学将在 DNA 中寻找特定的疾病标记。
- RNA 测序将用于帮助医生和科学家了解基因的工作原理。
- 低通全基因组和外显子组测序将用于帮助识别 DNA 中的变异。
本研究的目标是招募至少 25 名女性,她们将接受受基因组和蛋白质组分析结果影响的治疗。 最多 30 名女性将接受确定目标建议的治疗,最多 10 名女性将接受受试者及其医生选择的治疗。 疾病的实际治疗将基于多种因素,包括当前的身体状况、先前的治疗(如果适用)、标准实验室和测试以及医生的偏好。 基因组和蛋白质组学分析的结果将添加到可用信息中,这些信息将用于帮助我们决定治疗过程。
研究类型
注册 (实际的)
阶段
- 阶段2
联系人和位置
学习地点
-
-
South Dakota
-
Sioux Falls、South Dakota、美国、57104
- Sanford Health
-
-
参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
描述
纳入标准:
- 在开始任何特定于研究的程序之前了解并提供书面知情同意书和 HIPAA 授权
- 预期寿命 >3 个月
- 诊断为具有可测量疾病的转移性乳腺癌 (RECIST 1.1)
- 如果适用(根据 RECIST 1.1),在进入本研究之前立即记录治疗方案的进展情况。
- 年满 18 岁
- ECOG 评分为 0-1
- 成为一名优秀的医学候选人并愿意接受两次活检或外科手术以获取组织,这可能是也可能不是患者恶性肿瘤常规护理的一部分。 第一次活检是必需的,第二次活检是可选的。
- 已记录缺乏反应或记录了上次治疗的进展。
- 具有如下定义的足够的器官和骨髓功能:
- 骨髓:中性粒细胞绝对计数 (ANC) ≥ 1.5 x 109/L;血红蛋白 9 克/分升;血小板 > 100 x 109/L
- 肾脏:肌酐清除率 ≥ 60 mL/min(根据 Cockcroft 和 Gault 计算)或肌酐 ≤ 1.5 mg/dL
- 肝脏:胆红素≤正常上限 (ULN) 的 2.5 倍;天冬氨酸转氨酶 (AST/SGOT);丙氨酸转氨酶 (ALT/SGPT) ≤ 2.5 x ULN(或 ≤ 5 x ULN,如果由于潜在的肝转移); INR ≤ 1.5 x ULN(抗凝治疗除外)
- 有生育能力的女性患者必须进行阴性妊娠试验,并同意在研究期间和停止治疗后至少一个月使用至少一种避孕方法。 出于本研究的目的,生育潜力定义为:所有未绝经至少一年或手术绝育的女性患者
- 男性患者必须在研究期间和治疗停止后至少一个月内使用经研究者/治疗医师批准的一种屏障避孕方法
排除标准:
- 在分析前 2 个多月进行了打算用于当前研究的肿瘤活检
- 有无法进行活检的转移性病灶
- 在分析前收集活检后进行过介入性癌症治疗
- 有症状的中枢神经系统转移。 接受过全脑放疗的有 CNS 转移病史的患者必须在治疗完成后 4 周内保持稳定且无症状,需要影像记录,并且必须停用类固醇或使用稳定剂量的类固醇 ≥ 2 周入学前
- 在进入研究后 5 年内有任何其他恶性肿瘤病史(已治愈的皮肤基底细胞癌或已治愈的宫颈原位癌除外)
- 患有不受控制的并发疾病,包括但不限于持续或活动性严重感染、有症状的充血性心力衰竭、不稳定型心绞痛、不稳定的心律失常、精神疾病或会限制遵守研究要求或自愿提供书面意见的能力的情况知情同意
- 已知感染 HIV、HBV、HCV
- 怀孕或哺乳期患者或任何有生育能力的患者是否未使用适当的避孕措施
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
- 主要用途:治疗
- 分配:北美
- 介入模型:单组
- 屏蔽:没有任何
武器和干预
参与者组/臂 |
干预/治疗 |
|---|---|
|
实验性的:基因组和蛋白质组学分析
|
在治疗选择委员会审查目标后,治疗医师将决定是继续计划的治疗还是根据基因组结果改变治疗过程。
|
研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
大体时间 |
|---|---|
|
使用 RPMA、靶向重测序、IHC 分析、WGS、RNA-Seq 和外显子组测序的蛋白质组学和基因组分析表明,乳腺癌靶向治疗导致的无进展生存期。
大体时间:每 7 ± 1 周评估一次疾病状态,直至疾病进展或停止治疗,以较晚者为准。
|
每 7 ± 1 周评估一次疾病状态,直至疾病进展或停止治疗,以较晚者为准。
|
次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
|
通过 RPMA、靶向重测序、IHC 分析、WGS、RNA-Seq 和外显子组测序对肿瘤进行蛋白质组学、IHC 和基因组图谱分析的频率。
大体时间:分析结果将在收到组织标本后 10 个工作日内提供给调查人员。
|
分析结果将在收到组织标本后 10 个工作日内提供给调查人员。
|
|
|
治疗 7 ± 2 天后重新活检和分析后初始治疗建议的变化频率。
大体时间:治疗 7 ± 2 天后。
|
治疗 7 ± 2 天后。
|
|
|
LCM 与非 LCM 样本在确定驱动突变、转录本和替代途径激活方面的结果。
大体时间:入学后一年内。
|
入学后一年内。
|
|
|
RPMA、靶向重测序、IHC 分析、RNA-Seq 和基于外显子组测序的治疗的时间百分比与患者医生选择的治疗时间百分比不同。
大体时间:在学习结束后一年内入学。
|
在学习结束后一年内入学。
|
|
|
使用低通全基因组测序 (WGS) 鉴定后的结构变化和拷贝数变异意义。
大体时间:在初始活检和第 7 天活检(如果进行)。
|
在初始活检和第 7 天活检(如果进行)。
|
|
|
反应率(根据 RECIST 1.1 反应标准)- 4 个月时无进展的患者百分比,以及 - 总生存期,在通过蛋白质组学和基因组分析以及 IHC 分析选择治疗的患者中。
大体时间:4个月时。
|
4个月时。
|
|
|
作为一个整体,最佳组织生物标志物子集最能预测给定治疗导致结果改善的患者数量。
大体时间:在关闭注册后的一年内。
|
在关闭注册后的一年内。
|
|
|
医生和患者对在乳腺癌中使用蛋白质组学和基因组分析的期望、态度、经验和心理反应。
大体时间:在关闭注册后的一年内。
|
将向医生和患者提供一份调查问卷,以衡量他们对基因组学和与癌症护理相互作用的了解。
|
在关闭注册后的一年内。
|
|
治疗相关症状清单 (TRSC) 确定的患者症状与通过基因组分析确定的任何相关 SNP 相关
大体时间:在关闭注册后的一年内。
|
在关闭注册后的一年内。
|
合作者和调查者
调查人员
- 研究主任:David Pearce, PhD、Sanford Research
研究记录日期
研究主要日期
学习开始
初级完成 (实际的)
研究完成 (实际的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (估计)
研究记录更新
最后更新发布 (估计)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
此信息直接从 clinicaltrials.gov 网站检索,没有任何更改。如果您有任何更改、删除或更新研究详细信息的请求,请联系 register@clinicaltrials.gov. clinicaltrials.gov 上实施更改,我们的网站上也会自动更新.