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Étude de phase II utilisant le profilage génomique et protéomique pour influencer les traitements des patientes atteintes d'un cancer du sein métastatique

20 mars 2015 mis à jour par: Sanford Health

Une étude pilote de phase II utilisant le profilage génomique et protéomique pour trouver des cibles potentielles et influencer les traitements pour les patientes atteintes d'un cancer du sein métastatique

Les gènes sont le "livre d'instructions" de base pour les cellules qui composent notre corps et sont constitués d'ADN. De nombreuses études de recherche sont menées pour trouver la meilleure façon possible de traiter les patients atteints de cancer. Récemment, il y a eu beaucoup d'intérêt pour le développement de nouveaux agents anticancéreux qui ciblent davantage l'information génétique individuelle d'un patient, ainsi que les maladies causées par des défauts dans les gènes d'une personne.

L'identification précise des traitements à utiliser contre la tumeur d'un patient spécifique est difficile. Dans cette étude, quatre technologies de pointe seront utilisées pour identifier les cibles génomiques (informations que nous obtenons de l'ADN et de l'ARN) et protéomiques (informations que nous obtenons des protéines) pour le traitement de votre tumeur. Ces quatre tests seront utilisés ensemble pour recueillir des informations sur votre tumeur, donnant aux médecins et aux scientifiques une meilleure compréhension de la structure de votre tumeur et du meilleur traitement ou de la meilleure combinaison de traitements pour vous. Le traitement que vous recevrez pour traiter votre tumeur sera basé sur vos antécédents médicaux, les traitements antérieurs pour votre maladie, le cas échéant, votre état de santé actuel et les résultats de ces quatre tests. Le traitement que vous recevrez en fin de compte sera sélectionné par votre médecin en consultation avec un panel d'experts en cancer et en génomique du cancer (le comité de sélection du traitement).

Aperçu de l'étude

Statut

Résilié

Description détaillée

L'ADN contient des informations génétiques qui servent de modèle pour la façon dont les parties de votre corps sont fabriquées et fonctionnent, déterminant des choses telles que la couleur des yeux et des cheveux. L'ADN est composé de longs brins de lettres répétées qui forment un code. L'ordre dans lequel ces lettres sont écrites est très précis. De la même manière qu'une faute d'orthographe dans un mot pourrait changer complètement sa signification (par exemple, signifier et viande), un seul changement dans la séquence de l'ADN peut entraîner un changement dans le fonctionnement du corps, ce qui peut entraîner une maladie. À l'heure actuelle, les chercheurs et les médecins connaissent certains des changements génétiques qui peuvent entraîner des maladies, mais ils ne connaissent pas tous les changements génétiques qui peuvent causer des maladies.

Les protéines sont les éléments de base de votre corps. Les parties de votre corps telles que vos muscles, votre peau et vos organes sont constituées principalement de protéines. L'ADN fournit les plans, ou les instructions, sur la façon dont chaque protéine doit être fabriquée. S'il y a un changement dans votre ADN, il peut y avoir un changement dans la façon dont une protéine est fabriquée. Parfois, ces changements peuvent entraîner des maladies. Pour fabriquer une protéine, les cellules de votre corps prennent l'ADN et en font une copie appelée ARN. Les cellules lisent l'ARN pour fabriquer la protéine. L'ADN peut être considéré comme le plan directeur original, l'ARN étant des photocopies de ce plan. Le nombre de copies d'ARN peut déterminer la quantité de protéines pouvant être fabriquées. Si le corps a besoin de plus de protéines, il peut produire plus d'ARN, mais s'il a besoin de moins de protéines, il peut également déchiqueter l'ARN afin qu'il ne puisse pas être lu. La quantité d'un ARN ou d'une protéine particulière peut également être importante dans le fonctionnement du corps. Trop ou trop peu d'une protéine particulière peut également entraîner des maladies. Comprendre la relation entre l'ADN, l'ARN et les protéines peut être important pour savoir ce qui cause la maladie et comment la traiter.

L'identification précise des traitements à utiliser contre la tumeur d'un patient spécifique est difficile. Dans cette étude, quatre technologies de pointe seront utilisées pour identifier les cibles génomiques (informations que nous obtenons de l'ADN et de l'ARN) et protéomiques (informations que nous obtenons des protéines) pour le traitement de votre tumeur. Ces quatre tests seront utilisés ensemble pour recueillir des informations sur votre tumeur, donnant aux médecins et aux scientifiques une meilleure compréhension de la structure de votre tumeur et du meilleur traitement ou de la meilleure combinaison de traitements pour vous. Le traitement que vous recevrez pour traiter votre tumeur sera basé sur vos antécédents médicaux, les traitements antérieurs pour votre maladie, le cas échéant, votre état de santé actuel et les résultats de ces quatre tests. Le traitement que vous recevrez en fin de compte sera sélectionné par votre médecin en consultation avec un panel d'experts en cancer et en génomique du cancer (le comité de sélection du traitement).

Le but de cette étude est d'examiner l'impact de la thérapie ciblée pour le cancer du sein basée sur le profilage protéomique et génomique à l'aide de quatre méthodes d'analyse différentes.

  • La puce à protéines en phase inverse sera utilisée pour déterminer la fréquence à laquelle des protéines spécifiques pourraient rendre la tumeur sensible ou résistante au traitement.
  • L'immunohistochimie recherchera des marqueurs spécifiques de la maladie dans l'ADN.
  • Le séquençage de l'ARN sera utilisé pour aider les médecins et les scientifiques à comprendre le fonctionnement des gènes.
  • Le séquençage passe-bas du génome entier et de l'exome sera utilisé pour aider à identifier les variantes de l'ADN.

L'objectif de cette étude sera de recruter au moins 25 femmes qui recevront une thérapie influencée par les résultats dérivés du profilage génomique et protéomique. Jusqu'à 30 femmes recevront un traitement suggéré par une cible identifiée et jusqu'à 10 femmes recevront un traitement choisi par le sujet et son médecin. Le traitement réel de la maladie sera basé sur plusieurs facteurs, y compris l'état physique actuel, les traitements antérieurs, le cas échéant, les laboratoires et tests standard et la préférence du médecin. Les résultats du profilage génomique et protéomique s'ajouteront aux informations disponibles qui seront utilisées pour nous aider à décider du cours de la thérapie.

Type d'étude

Interventionnel

Inscription (Réel)

5

Phase

  • Phase 2

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

    • South Dakota
      • Sioux Falls, South Dakota, États-Unis, 57104
        • Sanford Health

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans et plus (ADULTE, OLDER_ADULT)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

La description

Critère d'intégration:

  • Comprendre et fournir un consentement éclairé écrit et une autorisation HIPAA avant le début de toute procédure spécifique à l'étude
  • Avoir une espérance de vie > 3 mois
  • Avoir un diagnostic de cancer du sein métastatique avec une maladie mesurable (RECIST 1.1)
  • Avoir une documentation de la progression, le cas échéant (par RECIST 1.1) sur le régime de traitement immédiatement avant d'entrer dans cette étude.
  • Avoir ≥ 18 ans
  • Avoir un score ECOG de 0-1
  • Être un bon candidat médical et être disposé à subir deux biopsies ou interventions chirurgicales pour obtenir des tissus, qui peuvent ou non faire partie des soins de routine du patient pour sa malignité. La 1ère biopsie est obligatoire et la 2ème biopsie est facultative.
  • Avoir une absence documentée de réponse ou une progression documentée depuis le dernier traitement.
  • Avoir un fonctionnement adéquat des organes et de la moelle osseuse tel que défini ci-dessous :
  • Moelle osseuse : nombre absolu de neutrophiles (ANC) ≥ 1,5 x 109/L ; hémoglobine 9 g/dL ; plaquettes > 100 x 109/L
  • Rénal : clairance de la créatinine ≥ 60 mL/min (calculée selon Cockcroft et Gault) ou créatinine ≤ 1,5 mg/dL
  • Hépatique : bilirubine ≤ 2,5 x la limite supérieure de la normale (LSN) ; les aspartates transaminases (AST/SGOT); alanine transaminases (ALT/SGPT) ≤ 2,5 x LSN (ou ≤ 5 x LSN si elles sont dues à des métastases hépatiques sous-jacentes) ; INR ≤ 1,5 x LSN (sauf en cas de traitement anticoagulant)
  • Les patientes en âge de procréer doivent avoir un test de grossesse négatif et accepter d'utiliser au moins une forme de contraception pendant l'étude et pendant au moins un mois après l'arrêt du traitement. Aux fins de cette étude, le potentiel de procréation est défini comme : toutes les patientes qui n'étaient pas en post-ménopause depuis au moins un an ou qui sont chirurgicalement stériles
  • Les patients de sexe masculin doivent utiliser une forme de contraception barrière approuvée par l'investigateur / médecin traitant pendant l'étude et pendant au moins un mois après l'arrêt du traitement

Critère d'exclusion:

  • Avoir une biopsie tumorale destinée à être utilisée dans l'étude en cours qui a été réalisée plus de 2 mois avant l'analyse
  • Avoir des lésions métastatiques qui ne sont pas accessibles à la biopsie
  • Avoir subi une thérapie interventionnelle contre le cancer après la collecte de la biopsie avant l'analyse
  • Avoir des métastases symptomatiques du SNC. Les patients ayant des antécédents de métastases du SNC qui ont été traités par irradiation du cerveau entier doivent être stables sans symptômes pendant 4 semaines après la fin du traitement, avec une documentation d'image requise, et doivent être soit sans stéroïdes, soit sous une dose stable de stéroïdes pendant ≥ 2 semaines avant l'inscription
  • Avoir des antécédents d'une autre tumeur maligne (autre que le carcinome basocellulaire guéri de la peau ou le carcinome in situ guéri du col de l'utérus) dans les 5 ans suivant l'entrée à l'étude
  • Avoir une maladie concomitante non contrôlée, y compris, mais sans s'y limiter, une infection grave en cours ou active, une insuffisance cardiaque congestive symptomatique, une angine de poitrine instable, des arythmies cardiaques instables, une maladie psychiatrique ou des situations qui limiteraient le respect des exigences de l'étude ou la capacité de donner volontairement des consentement éclairé
  • Avoir connu une infection par le VIH, le VHB, le VHC
  • Les patientes enceintes ou allaitantes ou toute patiente en âge de procréer n'utilisent pas de contraception adéquate

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Objectif principal: TRAITEMENT
  • Répartition: N / A
  • Modèle interventionnel: SINGLE_GROUP
  • Masquage: AUCUN

Armes et Interventions

Groupe de participants / Bras
Intervention / Traitement
EXPÉRIMENTAL: Profilage génomique et protéomique
  • La puce à protéines en phase inverse sera utilisée pour déterminer la fréquence à laquelle des protéines spécifiques pourraient rendre votre tumeur sensible ou résistante au traitement.
  • L'immunohistochimie recherchera des marqueurs spécifiques de la maladie dans votre ADN.
  • Le séquençage de l'ARN sera utilisé pour aider les médecins et les scientifiques à comprendre le fonctionnement de vos gènes.
  • Le séquençage passe-bas du génome entier et de l'exome sera utilisé pour aider à identifier les variantes de votre ADN.
Après examen des cibles par le comité de sélection du traitement, le médecin traitant décidera s'il convient de poursuivre le traitement prévu ou de modifier le cours du traitement en fonction des résultats génomiques.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Délai
Survie sans progression grâce à une thérapie ciblée pour le cancer du sein suggérée par le profilage protéomique et génomique à l'aide de RPMA, le reséquençage ciblé, l'analyse IHC, le séquençage WGS, RNA-Seq et Exome.
Délai: L'état de la maladie sera évalué toutes les 7 ± 1 semaines jusqu'à la progression ou le moment de l'arrêt du traitement, selon la dernière éventualité.
L'état de la maladie sera évalué toutes les 7 ± 1 semaines jusqu'à la progression ou le moment de l'arrêt du traitement, selon la dernière éventualité.

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
La fréquence à laquelle l'analyse de profilage protéomique, IHC et génomique d'une tumeur par RPMA, le reséquençage ciblé, l'analyse IHC, le séquençage WGS, RNA-Seq et Exome donne une cible.
Délai: Les résultats du profilage seront mis à la disposition des enquêteurs dans les 10 jours ouvrables suivant la réception des échantillons de tissus.
Les résultats du profilage seront mis à la disposition des enquêteurs dans les 10 jours ouvrables suivant la réception des échantillons de tissus.
La fréquence des modifications des recommandations de traitement initiales après re-biopsie et analyse après 7 ± 2 jours de traitement.
Délai: Après 7 ± 2 jours de traitement.
Après 7 ± 2 jours de traitement.
Résultats des échantillons LCM vs non-LCM sur la détermination des mutations motrices, des transcrits et de l'activation de la voie alternative.
Délai: Dans un délai d'un an après l'inscription.
Dans un délai d'un an après l'inscription.
Le pourcentage de temps pendant lequel le traitement basé sur la RPMA, le reséquençage ciblé, l'analyse IHC, l'ARN-Seq et le séquençage Exome est différent de celui qui aurait été sélectionné par le médecin du patient.
Délai: Dans l'année suivant la clôture des études à l'inscription.
Dans l'année suivant la clôture des études à l'inscription.
Modifications structurelles et variantes du nombre de copies signifiant après identification à l'aide du séquençage passe-bas du génome entier (WGS).
Délai: Lors de la biopsie initiale et de la biopsie au jour 7 (si effectuée).
Lors de la biopsie initiale et de la biopsie au jour 7 (si effectuée).
Taux de réponse (selon les critères de réponse RECIST 1.1) - le pourcentage de patients sans progression à 4 mois, et - la survie globale, chez les patients dont le traitement est sélectionné par analyse protéomique et génomique et analyse IHC.
Délai: A 4 mois.
A 4 mois.
Nombre de patients, dans leur ensemble, pour lesquels le sous-ensemble optimal de biomarqueurs tissulaires est le plus prédictif d'un traitement donné conduisant à une amélioration des résultats.
Délai: Dans l'année suivant la clôture des inscriptions.
Dans l'année suivant la clôture des inscriptions.
Attentes, attitudes, expériences et réponses psychologiques des médecins et des patientes face à l'utilisation du profilage protéomique et génomique dans le cancer du sein.
Délai: Dans l'année suivant la clôture des inscriptions.
Un questionnaire sera fourni aux médecins et aux patients pour mesurer leurs connaissances sur la génomique et l'interaction avec les soins contre le cancer.
Dans l'année suivant la clôture des inscriptions.
Les symptômes du patient identifiés par la liste de contrôle des symptômes liés à la thérapie (TRSC) sont en corrélation avec tous les SNP associés identifiés par l'analyse génomique
Délai: Dans l'année suivant la clôture des inscriptions.
Dans l'année suivant la clôture des inscriptions.

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Les enquêteurs

  • Directeur d'études: David Pearce, PhD, Sanford Research

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude

1 septembre 2013

Achèvement primaire (RÉEL)

1 janvier 2014

Achèvement de l'étude (RÉEL)

1 janvier 2014

Dates d'inscription aux études

Première soumission

30 octobre 2013

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

6 décembre 2013

Première publication (ESTIMATION)

11 décembre 2013

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (ESTIMATION)

24 mars 2015

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

20 mars 2015

Dernière vérification

1 mars 2015

Plus d'information

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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