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癌症患者的全外显子组测序 (WES)

2021年2月8日 更新者:Nikhil Wagle、Dana-Farber Cancer Institute

CanSeq:癌症患者的全外显子组测序 (WES)

当控制正常细胞生长的分子(基因和蛋白质)发生改变时,就会发生癌症。 肿瘤基因和正常细胞基因的变化称为“改变”。 许多这些改变可以通过直接检查肿瘤中的癌细胞或血液中的循环癌细胞来检测。 已经确定了在某些类型的癌症中反复发生的几种改变。 这些发现导致了“靶向”这些改变的新药的开发。 还有更多有待发现。

一些改变是在基因中发现的。 基因由 DNA“字母”组成,其中包含告诉我们体内的细胞如何生长和工作的指令。 基因制造的蛋白质实际上在我们的细胞中执行指令。

我们想使用您的 DNA,使用一种称为“测序”的技术来寻找癌细胞和血细胞中基因的改变。 基因测序是一种读取 DNA 以识别可能导致细胞行为的基因错误的方法。 一些基因变化只发生在癌细胞中。 其他也发生在正常细胞中,发生在可能从父母传给孩子的基因中。 这项研究将检查这两种基因。

这项研究的目的是对您的癌细胞(从活检或手术中获得)和正常组织(通常是血液)进行基因测序(基因测试)。 基因测试的结果将用于尝试开发更好的治疗和预防癌症的方法。 我们还将研究更好的方式将这些复杂基因检测的结果传达给您和您的医生,并帮助您和您的医生使用这些信息来选择最佳治疗途径。 作为这项工作的一部分,我们还可以了解您正常细胞中的基因;如果您愿意,其中一些信息也将与您和您的医生共享。

重要的是,这项研究将使用已经收集并存储在病理科的组织标本作为您临床护理的一部分或作为您可能参与的其他研究的一部分。 在这项研究中,只有在进行了必要的临床测试后,才会对材料进行基因测试。 一般来说,不需要额外的侵入性手术。

研究概览

地位

完全的

详细说明

如果您同意参加这项研究,我们会征求您的同意,以获得额外的血液样本(2 管或 4 茶匙)。 血液中的细胞含有分析所需的正常非癌细胞 DNA。

研究癌症遗传特征的主要原因之一是了解它们是否可以预测对现有治疗的反应。 因此,在这项研究中,我们还将您的癌症基因检测结果与您在治疗过程中产生的医学信息联系起来。 医疗信息包含在您的医疗记录中。

少数基因测试结果可能对您的健康或治疗有重要意义。 例如,他们可能会发现已知使癌症对特定疗法产生反应(或产生耐药性)的基因改变。 因此,我们要求您考虑是否希望我们将这些基因测试的某些结果告知您的医生和您。

您的医生可能会就基因测试的结果与您联系,但前提是该结果可能直接影响您的癌症治疗或其他疾病,或者您已同意他或她这样做。 在某些情况下,研究医生可能会与您联系,根据可能在您的组织或血液样本中或在您的调查/访谈答复中发现的信息,了解您是否有兴趣参与另一项研究。 我们还会要求您提供可能知道您行踪的亲属的姓名和联系信息,或者如果您无法亲自给予许可,他们可能会决定将来使用您的信息进行研究。

您的一些标本,以及在您的组织或血液分析过程中产生的一些材料,可能对未来的研究有用,采用更新的技术和方法。 我们请求您允许将这些标本和材料储存在安全的生物样本储存设施中,以备日后可能的研究之用。

我们还要求您在几个时间点参与两项与研究相关的调查。 这些时间点包括您第一次加入研究的时间,以及您收到对您的样本进行的基因测试的任何结果之后。 这些调查旨在了解您如何看待这种类型的基因分析,以及与您分享最有帮助的信息的方式。

还将邀请一些研究参与者参加与研究相关的访谈。 这些访谈的目的是了解您对基因测试结果的预期,以及基因测试的结果可能如何影响您。

完成调查的时间不应超过 15 分钟。 完成访谈预计需要大约 45 分钟。

最后,当从您的组织和血液中提取的一些遗传信息可以与其他研究人员共享时,在理解和治疗癌症方面将会取得快速进展。 特别是,美国国立卫生研究院 (NIH) 和其他组织开发了专门的数据(信息)存储库,用于分析数据并收集某些类型的基因研究的结果。 这些中央银行将存储您的基因信息、样本和调查/访谈信息,并提供给合格的研究人员进行更多研究。 因此,我们也请求您允许与这些特殊银行分享您的结果。 您的信息或样品将仅在附有代码的情况下发送。 您的姓名或其他可直接识别的信息不会与数据库或其他调查人员共享。 当您的信息和样本存储在存储库中并用于研究时,有许多保护措施可以保护它们。 尽管在与这些银行共享此信息时可能存在隐私泄露的轻微风险,但我们已制定程序对您的样本和信息进行编码并保护您的数据。 尽管我们会尽一切努力保护您数据的隐私,但我们不能绝对保证其隐私或预测未来基因信息的使用方式。

研究类型

观察性的

注册 (实际的)

244

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

    • Massachusetts
      • Boston、Massachusetts、美国、02215
        • Brigham and Women's Hospital
      • Boston、Massachusetts、美国、02215
        • Dana-Farber Cancer Insitute

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

18年 及以上 (成人、年长者)

接受健康志愿者

不

有资格学习的性别

全部

取样方法

非概率样本

研究人群

Dana-Farber 癌症研究所被确定为肿瘤患者的患者或疑似符合其提供者定义的合格癌症诊断的患者。

描述

纳入标准:

  • 之前已同意 DF/HCC 协议 11-104、02-180 和/或目前正在 BWH 接受 KRAS 突变的临床测试
  • 诊断为晚期肺或结直肠腺癌
  • 至少6个月的预期寿命
  • 足够的基因组 DNA 可用于全外显子组测序和 CLIA 验证
  • 有一位正在参与医师研究的治疗肿瘤学家
  • 说英语或西班牙语

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

队列和干预

团体/队列
肺/结肠腺癌
转移性肺和结肠腺癌

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
WES 在癌症患者中的可行性
大体时间:2年
实施一个生产规模的平台,用于从档案 (FFPE) 材料中进行全外显子组测序。 从在丹娜—法伯癌症研究所接受治疗的转移性癌症患者获取肿瘤和种系标本,首先是转移性肺腺癌和结肠腺癌。 对这些标本进行全外显子组测序以确定可能与癌症的发展或治疗相关的体细胞和种系基因组改变。 开发和实施分析和解释框架,以优先考虑临床上重要的基因组改变。
2年
全外显子组测序对癌症患者的临床影响
大体时间:2年
确定体细胞和种系全外显子组测序对癌症患者的临床影响。 确定对患有晚期实体瘤的临床癌症患者进行全外显子组测序的可行性,从肺癌和结肠腺癌开始。 建立一个审查和披露结果的系统,包括选定的与患者癌症诊断无关的偶然结果,向医生、患者及其家属披露。 描述全外显子组测序数据对晚期实体瘤患者医疗管理的影响。
2年
描述外显子组测序信息的影响
大体时间:2年
描述来自体细胞和种系全外显子组测序 (WES) 的信息对癌症患者的影响。
2年

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Nikhil Wagle, MD、Dana-Farber Cancer Insitute

出版物和有用的链接

负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始

2012年9月1日

初级完成 (实际的)

2017年4月1日

研究完成 (实际的)

2019年12月1日

研究注册日期

首次提交

2013年2月19日

首先提交符合 QC 标准的

2014年4月28日

首次发布 (估计)

2014年4月30日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2021年2月10日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2021年2月8日

最后验证

2021年2月1日

更多信息

与本研究相关的术语

此信息直接从 clinicaltrials.gov 网站检索,没有任何更改。如果您有任何更改、删除或更新研究详细信息的请求,请联系 register@clinicaltrials.gov. clinicaltrials.gov 上实施更改,我们的网站上也会自动更新.

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