Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Whole-Exome Sequencing (WES) av kreftpasienter

8. februar 2021 oppdatert av: Nikhil Wagle, Dana-Farber Cancer Institute

CanSeq: Whole-Exome Sequencing (WES) av kreftpasienter

Kreft oppstår når molekylene som styrer normal cellevekst (gener og proteiner) endres. Endringer i tumorgenene og i genene til normale celler kalles «endringer». Mange av disse endringene kan oppdages ved direkte å undersøke kreftceller i en svulst eller sirkulerer i blod. Flere endringer som skjer gjentatte ganger i visse typer kreft er allerede identifisert. Disse oppdagelsene har ført til utviklingen av nye medisiner som "målretter" disse endringene. Mer gjenstår å oppdage.

Noen av endringene finnes i gener. Gener er sammensatt av DNA-«bokstaver», som inneholder instruksjonene som forteller cellene i kroppen hvordan de skal vokse og arbeide. Gener lager proteiner som faktisk utfører instruksjonene i cellene våre.

Vi vil gjerne bruke ditt DNA til å se etter endringer i genene i kreftceller og blodceller ved hjelp av en teknologi som kalles "sekvensering". Gensekvensering er en måte å lese DNA for å identifisere feil i gener som kan bidra til cellenes oppførsel. Noen endringer i gener skjer bare i kreftceller. Andre forekommer også i normale celler, i genene som kan ha gått fra forelder til barn. Denne forskningsstudien vil undersøke begge typer gener.

Formålet med denne forskningsstudien er å utføre gensekvensering (gentester) på kreftcellene dine (innhentet fra biopsier eller kirurgi) og normalt vev (vanligvis blod). Resultatene fra gentestene skal brukes til å prøve å utvikle bedre måter å behandle og forebygge kreft på. Vi vil også studere bedre måter å kommunisere resultatene av disse komplekse gentestene til deg og legene dine på, og for å hjelpe deg og legene dine bruke denne informasjonen til å velge de beste behandlingene. Som en del av dette arbeidet kan vi også lære ting om genene i dine normale celler; noe av den informasjonen vil også bli delt med deg og legene dine hvis du ønsker det.

Viktigere er at denne studien vil bruke vevsprøver som allerede er samlet inn og lagret på patologiavdelingen som en del av din kliniske behandling eller som en del av andre forskningsstudier du kanskje deltar i. I denne studien vil gentester bli utført på materiale først etter at nødvendige kliniske tester er utført. Generelt vil ingen ytterligere invasive prosedyrer være nødvendig.

Studieoversikt

Status

Fullført

Detaljert beskrivelse

Hvis du godtar å delta i denne studien, ber vi deg om tillatelse til å få en ekstra blodprøve (2 rør eller 4 teskjeer). Celler fra blodet inneholder normalt, ikke-kreftcelle-DNA som er nødvendig for analysen.

En av hovedgrunnene til å studere de genetiske egenskapene til kreft er å finne ut om de kan forutsi respons på eksisterende behandlinger. Derfor vil vi i denne studien også koble resultatene av gentester på kreften din med medisinsk informasjon som har blitt generert i løpet av behandlingen. Den medisinske informasjonen finnes i din journal.

Et lite antall av gentestresultatene kan ha betydning for din helse eller behandling. For eksempel kan de avdekke genforandringer som er kjent for å få kreft til å reagere på (eller være resistente mot) spesifikke terapier. Derfor ber vi deg vurdere om du vil at vi skal informere legen din og deg om noen av resultatene av disse gentestene.

Legen din kan kontakte deg om resultater av gentester, men bare hvis resultatene kan påvirke kreftbehandlingen eller annen sykdom direkte, eller hvis du har gitt tillatelse til at han eller henne kan gjøre det. I noen tilfeller kan en forskningslege kontakte deg for å finne ut om du er interessert i å delta i en annen forskningsstudie basert på informasjon som kan ha blitt funnet i vevs- eller blodprøvene dine, eller i undersøkelsen/intervjusvarene dine. Vi vil også be deg om å oppgi navn og kontaktinformasjon for en slektning som kanskje vet hvor du befinner deg, eller som kan bestemme seg for å bruke informasjonen din til forskning i fremtiden, hvis du ikke er tilgjengelig for å gi tillatelse selv.

Noen av prøvene dine, så vel som noe av materialet som genereres under analysen av vevet eller blodet ditt, kan være nyttige for studier i fremtiden, med nyere teknologier og tilnærminger. Vi ber om din tillatelse til å lagre disse prøvene og materialene i et sikkert lagringsanlegg for biologiske prøver for mulig senere forskning.

Vi ber deg også delta i to undersøkelser knyttet til studien på noen få tidspunkter. Disse tidspunktene inkluderer når du først blir med i studien, og etter at du har mottatt resultater fra gentestene som er gjort på prøvene dine. Undersøkelsene søker å finne ut hvordan du tenker på denne typen genetisk analyse, og hvordan informasjonen kan deles med deg som vil være mest nyttig.

Noen studiedeltakere vil også bli invitert til å delta i studierelaterte intervjuer. Hensikten med disse intervjuene er å forstå hva du forventer vil skje som følge av gentestene, og hvordan resultatene av gentestene kan ha påvirket deg.

Undersøkelsene bør ikke ta mer enn 15 minutter å fullføre. Intervjuene forventes å ta ca. 45 minutter å gjennomføre.

Til slutt vil raske fremskritt i forståelse og behandling av kreft skje når noe av den genetiske informasjonen fra vevet og blodet ditt kan deles med andre forskere. Spesielt National Institutes of Health (NIH) og andre organisasjoner har utviklet spesielle data (informasjon) depoter som analyserer data og samler inn resultatene av visse typer genetiske studier. Disse sentralbankene vil lagre din genetiske informasjon, prøver og undersøkelses-/intervjuinformasjon og gi dem til kvalifiserte forskere for å gjøre flere studier. Derfor ber vi også om tillatelse til å dele resultatene dine med disse spesialbankene. Din informasjon eller prøvene sendes kun med et kodenummer vedlagt. Ditt navn eller annen direkte identifiserbar informasjon vil ikke bli delt med databanker eller andre etterforskere. Det er mange sikkerhetstiltak på plass for å beskytte informasjonen og prøvene dine mens de lagres i depoter og brukes til forskning. selv om det kan være en liten risiko for tap av personvern når du deler denne informasjonen med disse bankene, har vi etablert prosedyrer for å kode prøvene og informasjonen og beskytte dataene dine. Selv om vi vil gjøre alt vi kan for å beskytte personvernet til dataene dine, kan vi ikke absolutt garantere personvernet eller forutsi hvordan genetisk informasjon vil bli brukt i fremtiden.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Faktiske)

244

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

    • Massachusetts
      • Boston, Massachusetts, Forente stater, 02215
        • Brigham and Women's Hospital
      • Boston, Massachusetts, Forente stater, 02215
        • Dana-Farber Cancer Insitute

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år og eldre (Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Nei

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Dana-Farber Cancer Institute-pasienter som er identifisert som onkologiske pasienter eller pasienter som mistenkes å ha en kvalifisert kreftdiagnose som definert av leverandørene deres.

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Har tidligere samtykket til DF/HCC-protokoll 11-104, 02-180 og/eller mottar for tiden klinisk testing for KRAS-mutasjoner ved BWH
  • Har en diagnose avansert lunge- eller kolorektalt adenokarsinom
  • Forventet levetid på minst 6 måneder
  • Tilstrekkelig genomisk DNA tilgjengelig for hele eksomsekvensering og CLIA-validering
  • Ha en behandlende onkolog som deltar i legestudien
  • Snakk engelsk eller spansk

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Adenokarsinomer i lunge/tykktarm
Metastatiske lunge- og tykktarmsadenokarsinomer

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Gjennomførbarhet av WES hos kreftpasienter
Tidsramme: 2 år
Å implementere en produksjonsskalaplattform for hel eksomsekvensering fra arkivmateriale (FFPE). For å få tumor- og kimlinjeprøver fra pasienter med metastatisk kreft som mottar behandling ved Dana-Farber Cancer Institute, som begynner med metastatiske lunge- og tykktarmsadenokarsinomer. For å utføre hel eksomsekvensering på disse prøvene for å bestemme somatiske og kimlinjegenomiske endringer som kan være relevante for utvikling eller behandling av kreft. Å utvikle og implementere et analytisk og fortolkende rammeverk for å prioritere klinisk viktige genomiske endringer.
2 år
Klinisk effekt av heleksomsekvensering hos kreftpasienter
Tidsramme: 2 år
For å bestemme den kliniske effekten av somatisk og kimlinje-heleksomesekvensering hos kreftpasienter. For å bestemme gjennomførbarheten av hel eksomsekvensering av kliniske kreftpasienter med avanserte solide svulster, som begynner med lunge- og tykktarmsadenokarsinomer. Å etablere et system for gjennomgang og avsløring av resultater, inkludert utvalgte tilfeldige resultater som ikke er relatert til pasientenes kreftdiagnoser, til leger, pasienter og deres familier. For å beskrive virkningen av data for hele eksomsekvenser på medisinsk behandling av pasienter med avanserte solide svulster.
2 år
Beskriv virkningen av informasjon hentet fra Exome-sekvensering
Tidsramme: 2 år
For å beskrive virkningen av informasjon hentet fra somatisk og kimlinje-heleksomsekvensering (WES) på kreftpasienter.
2 år

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Nikhil Wagle, MD, Dana-Farber Cancer Insitute

Publikasjoner og nyttige lenker

Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart

1. september 2012

Primær fullføring (Faktiske)

1. april 2017

Studiet fullført (Faktiske)

1. desember 2019

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

19. februar 2013

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

28. april 2014

Først lagt ut (Anslag)

30. april 2014

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

10. februar 2021

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

8. februar 2021

Sist bekreftet

1. februar 2021

Mer informasjon

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere