Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Syöpäpotilaiden koko eksomien sekvensointi (WES).

maanantai 8. helmikuuta 2021 päivittänyt: Nikhil Wagle, Dana-Farber Cancer Institute

CanSeq: Syöpäpotilaiden koko eksomien sekvensointi (WES).

Syöpä syntyy, kun normaalia solukasvua sääteleviä molekyylejä (geenit ja proteiinit) muutetaan. Muutoksia kasvaingeeneissä ja normaalien solujen geeneissä kutsutaan "muutoksiksi". Monet näistä muutoksista voidaan havaita tutkimalla suoraan kasvaimessa tai veressä kiertäviä syöpäsoluja. Useita muutoksia, joita esiintyy toistuvasti tietyissä syöpätyypeissä, on jo tunnistettu. Nämä löydöt ovat johtaneet uusien lääkkeiden kehittämiseen, jotka "kohdistavat" näitä muutoksia. Lisää on löydettävä.

Osa muutoksista löytyy geeneistä. Geenit koostuvat DNA:n "kirjaimista", jotka sisältävät ohjeet, jotka kertovat kehomme soluille kuinka kasvaa ja toimia. Geenit tuottavat proteiineja, jotka todella toteuttavat ohjeita soluissamme.

Haluaisimme käyttää DNA:tasi syöpäsolujen ja verisolujen geenien muutosten etsimiseen käyttämällä "sekvensointi"-nimistä tekniikkaa. Geenisekvensointi on tapa lukea DNA:ta sellaisten geenivirheiden tunnistamiseksi, jotka voivat vaikuttaa solujen käyttäytymiseen. Jotkut muutokset geeneissä tapahtuvat vain syöpäsoluissa. Muita esiintyy myös normaaleissa soluissa, geeneissä, jotka ovat saattaneet siirtyä vanhemmalta lapselle. Tämä tutkimus tutkii molempia geenejä.

Tämän tutkimustutkimuksen tarkoituksena on suorittaa geenisekvensointia (geenitestejä) syöpäsoluillesi (saatu biopsiasta tai leikkauksesta) ja normaaleille kudoksille (yleensä verelle). Geenitestien tuloksia käytetään kehitettäessä parempia tapoja hoitaa ja ehkäistä syöpää. Tutkimme myös parempia tapoja viestiä näiden monimutkaisten geenitestien tulokset sinulle ja lääkäreillesi ja auttaa sinua ja lääkäreitäsi käyttämään näitä tietoja valitaksesi parhaat hoitotavat. Osana tätä työtä saatamme myös oppia asioita normaaleissa soluissasi olevista geeneistä; Osa tiedoista jaetaan myös sinulle ja lääkäreillesi, jos niin haluat.

Tärkeää on, että tässä tutkimuksessa käytetään kudosnäytteitä, jotka on jo kerätty ja säilytetty patologian osastolla osana kliinistä hoitoasi tai osana muita tutkimuksia, joihin saatat osallistua. Tässä tutkimuksessa materiaalille tehdään geenitestejä vasta kun tarvittavat kliiniset testit on suoritettu. Yleensä muita invasiivisia toimenpiteitä ei tarvita.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Yksityiskohtainen kuvaus

Jos suostut osallistumaan tähän tutkimukseen, pyydämme lupaasi lisäverinäytteen ottamiseksi (2 putkea tai 4 teelusikallista). Veren solut sisältävät normaalia, ei-syöpäsolu-DNA:ta, jota tarvitaan analyysiin.

Yksi tärkeimmistä syistä tutkia syöpien geneettisiä ominaisuuksia on oppia, voivatko ne ennustaa vastetta olemassa oleviin hoitoihin. Siksi tässä tutkimuksessa yhdistäisimme myös syöpääsi koskevien geenitestien tulokset lääketieteellisiin tietoihin, jotka ovat syntyneet hoitosi aikana. Lääketieteelliset tiedot sisältyvät sairauskertomukseesi.

Pienellä osalla geenitestin tuloksista voi olla merkitystä terveytesi tai hoidosi kannalta. He voivat esimerkiksi paljastaa geenimuutoksia, joiden tiedetään saavan syövät reagoimaan (tai olemaan vastustuskykyisiä) spesifisille hoidoille. Siksi pyydämme sinua harkitsemaan, haluatko, että kerromme lääkärillesi ja sinulle joistakin näiden geenitestien tuloksista.

Lääkärisi voi ottaa sinuun yhteyttä geenitestien tuloksista, mutta vain, jos tulokset voivat vaikuttaa suoraan syövän hoitoon tai muuhun sairauteen tai jos olet antanut hänelle luvan siihen. Joissakin tapauksissa tutkijalääkäri voi ottaa sinuun yhteyttä selvittääkseen, olisitko kiinnostunut osallistumaan toiseen tutkimukseen kudos- tai verinäytteistäsi tai kysely-/haastatteluvastauksistasi mahdollisesti löytyneiden tietojen perusteella. Pyydämme sinua antamaan myös sellaisen sukulaisen nimen ja yhteystiedot, joka saattaa tietää olinpaikkasi tai joka voisi päättää tietojesi käyttämisestä jatkossa tutkimukseen, jos et itse ole saatavilla antamaan lupaa.

Jotkut näytteistäsi sekä osa kudosten tai veren analysoinnin aikana syntyvästä materiaalista voivat olla hyödyllisiä tulevaisuuden tutkimuksessa uudemmilla teknologioilla ja lähestymistavoilla. Pyydämme lupaasi säilyttää näitä näytteitä ja materiaaleja turvallisessa biologisten näytteiden säilytystilassa mahdollista myöhempää tutkimusta varten.

Pyydämme myös osallistumaan kahteen tutkimukseen liittyvään kyselyyn muutamalla ajankohtana. Näitä ajankohtia ovat esimerkiksi se, kun liityit ensimmäisen kerran tutkimukseen ja sen jälkeen, kun olet saanut näytteidesi geenitestien tulokset. Kyselyillä pyritään selvittämään, miten ajattelet tämän tyyppistä geneettistä analyysiä ja millä tavoilla tietoja voidaan jakaa kanssasi, mikä olisi hyödyllisintä.

Jotkut tutkimukseen osallistujat kutsutaan myös osallistumaan tutkimukseen liittyviin haastatteluihin. Näiden haastattelujen tarkoituksena on ymmärtää, mitä odotat geenitestien tuloksena tapahtuvan ja miten geenitestien tulokset ovat saattaneet vaikuttaa sinuun.

Kyselyjen täyttämiseen ei saa mennä yli 15 minuuttia. Haastattelujen odotetaan kestävän noin 45 minuuttia.

Lopuksi, syövän ymmärtämisessä ja hoidossa tapahtuu nopeaa edistystä, kun osa kudoksistasi ja verestäsi peräisin olevasta geneettisestä tiedosta voidaan jakaa muiden tutkijoiden kanssa. Erityisesti National Institutes of Health (NIH) ja muut organisaatiot ovat kehittäneet erityisiä tietovarastoja, jotka analysoivat tietoja ja keräävät tietyntyyppisten geneettisten tutkimusten tuloksia. Nämä keskuspankit tallentavat geneettiset tietosi, näytteesi ja tutkimus-/haastattelutietosi ja toimittavat ne päteville tutkijoille lisätutkimuksia varten. Siksi pyydämme myös lupaasi jakaa tuloksiasi näiden erityispankkien kanssa. Tietosi tai näytteesi lähetetään vain koodinumerolla. Nimeäsi tai muita suoraan tunnistettavia tietoja ei jaeta tietopankeille tai muille tutkijoille. Tietojesi ja näytteidesi suojaamiseksi on olemassa monia suojatoimia, kun niitä säilytetään arkistoissa ja niitä käytetään tutkimukseen. vaikka yksityisyyden menettämisen riski saattaa olla pieni, kun jaat näitä tietoja näiden pankkien kanssa, olemme ottaneet käyttöön menettelyt näytteidesi ja tietojesi koodaamiseksi ja tietojesi suojaamiseksi. Vaikka teemme kaikkemme suojellaksemme tietojesi yksityisyyttä, emme voi täysin taata niiden yksityisyyttä tai ennustaa, kuinka geneettistä tietoa käytetään tulevaisuudessa.

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Todellinen)

244

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskelupaikat

    • Massachusetts
      • Boston, Massachusetts, Yhdysvallat, 02215
        • Brigham and Women's Hospital
      • Boston, Massachusetts, Yhdysvallat, 02215
        • Dana-Farber Cancer Insitute

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

18 vuotta ja vanhemmat (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Ei-todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Dana-Farber Cancer Institute -potilaat, jotka on tunnistettu syöpäpotilaiksi tai potilaiksi, joilla epäillään olevan kelvollinen syöpädiagnoosi palveluntarjoajansa määrittelemällä tavalla.

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

  • olet aiemmin hyväksynyt DF/HCC-protokollan 11-104, 02-180 ja/tai saa parhaillaan kliinisiä testejä KRAS-mutaatioiden varalta BWH:ssa
  • Sinulla on diagnosoitu pitkälle edennyt keuhko- tai kolorektaalinen adenokarsinooma
  • Elinajanodote vähintään 6 kuukautta
  • Riittävästi genomista DNA:ta saatavilla koko eksomin sekvensointiin ja CLIA-validointiin
  • Pyydä hoitavaa onkologia, joka osallistuu lääkärin tutkimukseen
  • Puhu englantia tai espanjaa

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti
Keuhkojen / paksusuolen adenokarsinoomat
Metastaattiset keuhkojen ja paksusuolen adenokarsinoomat

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
WES:n toteutettavuus syöpäpotilailla
Aikaikkuna: 2 vuotta
Toteuttaa tuotantolaajuinen alusta koko exome-sekvensointiin arkistomateriaalista (FFPE). Ottaa kasvain- ja ituratanäytteitä potilailta, joilla on etäpesäkkeinen syöpä ja jotka saavat hoitoa Dana-Farber Cancer Institutessa, alkaen metastaattisista keuhkojen ja paksusuolen adenokarsinoomista. Suorittaa näille näytteille koko eksoomisekvensointi somaattisten ja ituradan genomimuutosten määrittämiseksi, jotka voivat olla merkityksellisiä syövän kehittymisen tai hoidon kannalta. Kehittää ja toteuttaa analyyttinen ja tulkitseva viitekehys kliinisesti tärkeiden genomimuutosten priorisoimiseksi.
2 vuotta
Koko eksomin sekvensoinnin kliininen vaikutus syöpäpotilailla
Aikaikkuna: 2 vuotta
Määrittää somaattisen ja ituradan koko eksomin sekvensoinnin kliinisen vaikutuksen syöpäpotilailla. Selvittää koko eksomin sekvensoinnin toteutettavuus kliinisillä syöpäpotilailla, joilla on edennyt kiinteitä kasvaimia, alkaen keuhkojen ja paksusuolen adenokarsinoomista. Luodaan lääkäreille, potilaille ja heidän perheilleen tulosten tarkastelu- ja julkistamisjärjestelmä, mukaan lukien valitut satunnaiset tulokset, jotka eivät liity potilaiden syöpädiagnooseihin. Kuvaamaan kokonaisten exome-sekvensointitietojen vaikutusta potilaiden hoitoon, joilla on edennyt kiinteä kasvain.
2 vuotta
Kuvaile Exome-sekvensoinnista saatujen tietojen vaikutusta
Aikaikkuna: 2 vuotta
Kuvaamaan somaattisesta ja ituradan koko eksomin sekvensoinnista (WES) saadun tiedon vaikutusta syöpäpotilaisiin.
2 vuotta

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Tutkijat

  • Päätutkija: Nikhil Wagle, MD, Dana-Farber Cancer Insitute

Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä

Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus

Lauantai 1. syyskuuta 2012

Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)

Lauantai 1. huhtikuuta 2017

Opintojen valmistuminen (Todellinen)

Sunnuntai 1. joulukuuta 2019

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Tiistai 19. helmikuuta 2013

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Maanantai 28. huhtikuuta 2014

Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)

Keskiviikko 30. huhtikuuta 2014

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)

Keskiviikko 10. helmikuuta 2021

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Maanantai 8. helmikuuta 2021

Viimeksi vahvistettu

Maanantai 1. helmikuuta 2021

Lisää tietoa

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Tilaa