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Sequenziamento dell'intero esoma (WES) di pazienti affetti da cancro

8 febbraio 2021 aggiornato da: Nikhil Wagle, Dana-Farber Cancer Institute

CanSeq: sequenziamento dell'intero esoma (WES) di pazienti affetti da cancro

I tumori si verificano quando le molecole che controllano la normale crescita cellulare (geni e proteine) vengono alterate. I cambiamenti nei geni del tumore e nei geni delle cellule normali sono chiamati "alterazioni". Molte di queste alterazioni possono essere rilevate esaminando direttamente le cellule tumorali in un tumore o circolanti nel sangue. Sono già state identificate diverse alterazioni che si verificano ripetutamente in alcuni tipi di cancro. Queste scoperte hanno portato allo sviluppo di nuovi farmaci che "prendono di mira" tali alterazioni. Restano altri da scoprire.

Alcune delle alterazioni si trovano nei geni. I geni sono composti da "lettere" di DNA, che contengono le istruzioni che dicono alle cellule del nostro corpo come crescere e lavorare. I geni producono proteine ​​che effettivamente eseguono le istruzioni nelle nostre cellule.

Vorremmo usare il tuo DNA per cercare alterazioni nei geni nelle cellule tumorali e nelle cellule del sangue usando una tecnologia chiamata "sequenziamento". Il sequenziamento genico è un modo di leggere il DNA per identificare errori nei geni che possono contribuire al comportamento delle cellule. Alcuni cambiamenti nei geni si verificano solo nelle cellule tumorali. Altri si verificano anche nelle cellule normali, nei geni che potrebbero essere stati trasmessi da genitore a figlio. Questo studio di ricerca esaminerà entrambi i tipi di geni.

Lo scopo di questo studio di ricerca è eseguire il sequenziamento genico (test genetici) sulle cellule tumorali (ottenute da biopsie o interventi chirurgici) e sui tessuti normali (di solito sangue). I risultati dei test genetici verranno utilizzati per cercare di sviluppare modi migliori per trattare e prevenire i tumori. Studieremo anche modi migliori per comunicare i risultati di questi complessi test genetici a te e ai tuoi medici e per aiutare te e i tuoi medici a utilizzare queste informazioni per scegliere i percorsi migliori per il trattamento. Come parte di questo lavoro, potremmo anche imparare cose sui geni nelle vostre cellule normali; alcune di queste informazioni saranno condivise anche con te e i tuoi medici, se lo desideri.

È importante sottolineare che questo studio utilizzerà campioni di tessuto che sono già stati raccolti e conservati nel reparto di patologia come parte della tua assistenza clinica o come parte di altri studi di ricerca a cui potresti partecipare. In questo studio, i test genetici verranno eseguiti su materiale solo dopo che sono stati eseguiti i test clinici necessari. In generale, non saranno necessarie ulteriori procedure invasive.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

Se accetti di prendere parte a questo studio, ti chiediamo il permesso di ottenere un ulteriore campione di sangue (2 provette o 4 cucchiaini da tè). Le cellule del sangue contengono DNA cellulare normale, non canceroso, necessario per l'analisi.

Uno dei motivi principali per studiare le caratteristiche genetiche dei tumori è sapere se possono prevedere la risposta ai trattamenti esistenti. Pertanto, in questo studio, collegheremo anche i risultati dei test genetici sul cancro con le informazioni mediche che sono state generate durante il corso del trattamento. Le informazioni mediche sono contenute nella cartella clinica.

Un piccolo numero di risultati del test genetico può avere importanza per la tua salute o il tuo trattamento. Ad esempio, potrebbero scoprire alterazioni genetiche note per far sì che i tumori rispondano a (o siano resistenti a) terapie specifiche. Pertanto, ti chiediamo di considerare se desideri o meno che informiamo il tuo medico e te su alcuni dei risultati di questi test genetici.

Il medico può contattarti in merito ai risultati dei test genetici, ma solo se i risultati potrebbero influire direttamente sul trattamento del cancro o su altre malattie o se gli hai dato il permesso di farlo. In alcuni casi, un medico ricercatore potrebbe contattarti per scoprire se saresti interessato a partecipare a uno studio di ricerca diverso sulla base delle informazioni che potrebbero essere state trovate nei tuoi campioni di tessuto o sangue o nelle risposte al tuo sondaggio/intervista. Ti chiederemo inoltre di fornire il nome e le informazioni di contatto di un parente che potrebbe sapere dove ti trovi o che potrebbe decidere di utilizzare le tue informazioni per ricerche in futuro, se non sei disponibile a dare il permesso tu stesso.

Alcuni dei tuoi campioni, così come parte del materiale generato durante l'analisi dei tuoi tessuti o sangue, potrebbero essere utili per lo studio in futuro, con tecnologie e approcci più recenti. Chiediamo il tuo permesso per conservare questi campioni e materiali in un deposito sicuro di campioni biologici per eventuali ricerche successive.

Ti chiediamo inoltre di partecipare a due sondaggi relativi allo studio in alcuni momenti. Questi punti temporali includono quando ti unisci per la prima volta allo studio e dopo aver ricevuto i risultati dei test genetici eseguiti sui tuoi campioni. I sondaggi cercano di capire come stai pensando a questo tipo di analisi genetica e ai modi in cui le informazioni possono essere condivise con te che sarebbero più utili.

Alcuni partecipanti allo studio saranno anche invitati a prendere parte a interviste relative allo studio. Lo scopo di queste interviste è capire cosa ti aspetti che accadrà a seguito dei test genetici e in che modo i risultati dei test genetici potrebbero averti influenzato.

Il completamento dei sondaggi non dovrebbe richiedere più di 15 minuti. I colloqui dovrebbero durare circa 45 minuti.

Infine, si verificheranno rapidi progressi nella comprensione e nel trattamento del cancro quando alcune delle informazioni genetiche derivate dai tessuti e dal sangue potranno essere condivise con altri ricercatori. In particolare, i National Institutes of Health (NIH) e altre organizzazioni hanno sviluppato speciali archivi di dati (informazioni) che analizzano i dati e raccolgono i risultati di alcuni tipi di studi genetici. Queste banche centrali memorizzeranno le tue informazioni genetiche, campioni e informazioni su sondaggi/interviste e le forniranno a ricercatori qualificati per fare ulteriori studi. Pertanto, chiediamo anche il permesso di condividere i risultati con queste banche speciali. Le tue informazioni o campioni verranno inviati solo con un numero di codice allegato. Il tuo nome o altre informazioni direttamente identificabili non saranno condivise con banche dati o altri investigatori. Esistono molte misure di sicurezza per proteggere le informazioni e i campioni mentre sono archiviati in archivi e utilizzati per la ricerca. sebbene ci possa essere un leggero rischio di perdita della privacy quando si condividono queste informazioni con queste banche, abbiamo stabilito procedure per codificare i tuoi campioni e informazioni e proteggere i tuoi dati. Sebbene faremo tutto il possibile per proteggere la privacy dei tuoi dati, non possiamo assolutamente garantirne la privacy o prevedere come le informazioni genetiche verranno utilizzate in futuro.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Effettivo)

244

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

    • Massachusetts
      • Boston, Massachusetts, Stati Uniti, 02215
        • Brigham and Women's Hospital
      • Boston, Massachusetts, Stati Uniti, 02215
        • Dana-Farber Cancer Insitute

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

18 anni e precedenti (Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

No

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Pazienti del Dana-Farber Cancer Institute che sono identificati come pazienti oncologici o pazienti sospettati di avere una diagnosi di cancro ammissibile come definito dai loro fornitori.

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Hanno precedentemente acconsentito al protocollo DF/HCC 11-104, 02-180 e/o stanno attualmente ricevendo test clinici per mutazioni KRAS presso BWH
  • Avere una diagnosi di adenocarcinoma polmonare o colorettale avanzato
  • Aspettativa di vita di almeno 6 mesi
  • DNA genomico sufficiente disponibile per il sequenziamento dell'intero esoma e la convalida CLIA
  • Avere un oncologo curante che partecipa allo studio del medico
  • Parla inglese o spagnolo

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Adenocarcinomi del polmone/colon
Adenocarcinomi metastatici del polmone e del colon

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Fattibilità di WES nei malati di cancro
Lasso di tempo: 2 anni
Implementare una piattaforma su scala di produzione per il sequenziamento dell'intero esoma da materiale d'archivio (FFPE). Per ottenere campioni tumorali e germinali da pazienti con cancro metastatico che stanno ricevendo un trattamento presso il Dana-Farber Cancer Institute, a partire da adenocarcinomi metastatici del polmone e del colon. Eseguire il sequenziamento dell'intero esoma su questi campioni al fine di determinare alterazioni genomiche somatiche e germinali che potrebbero essere rilevanti per lo sviluppo o il trattamento del cancro. Sviluppare e implementare un quadro analitico e interpretativo per dare la priorità alle alterazioni genomiche clinicamente importanti.
2 anni
Impatto clinico del sequenziamento dell'intero esoma nei pazienti oncologici
Lasso di tempo: 2 anni
Per determinare l'impatto clinico del sequenziamento dell'intero esoma somatico e germinale nei pazienti oncologici. Per determinare la fattibilità del sequenziamento dell'intero esoma di pazienti affetti da cancro clinico con tumori solidi avanzati, a partire da adenocarcinomi del polmone e del colon. Stabilire un sistema di revisione e divulgazione dei risultati, compresi i risultati casuali selezionati non correlati alle diagnosi di cancro dei pazienti, ai medici, ai pazienti e alle loro famiglie. Descrivere l'impatto dei dati di sequenziamento dell'intero esoma sulla gestione medica dei pazienti con tumori solidi avanzati.
2 anni
Descrivere l'impatto delle informazioni derivate dal sequenziamento dell'esoma
Lasso di tempo: 2 anni
Descrivere l'impatto delle informazioni derivate dal sequenziamento somatico e germinale dell'intero esoma (WES) sui pazienti oncologici.
2 anni

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Investigatore principale: Nikhil Wagle, MD, Dana-Farber Cancer Insitute

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio

1 settembre 2012

Completamento primario (Effettivo)

1 aprile 2017

Completamento dello studio (Effettivo)

1 dicembre 2019

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

19 febbraio 2013

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

28 aprile 2014

Primo Inserito (Stima)

30 aprile 2014

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

10 febbraio 2021

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

8 febbraio 2021

Ultimo verificato

1 febbraio 2021

Maggiori informazioni

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su Adenocarcinoma polmonare

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