Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Whole-Exome Sequencing (WES) pacientů s rakovinou

8. února 2021 aktualizováno: Nikhil Wagle, Dana-Farber Cancer Institute

CanSeq: Whole-Exome Sequencing (WES) pacientů s rakovinou

K rakovině dochází, když se změní molekuly, které řídí normální buněčný růst (geny a proteiny). Změny v nádorových genech a v genech normálních buněk se nazývají „změny“. Mnohé z těchto změn lze detekovat přímým vyšetřením rakovinných buněk v nádoru nebo cirkulujících v krvi. Již bylo identifikováno několik změn, které se opakovaně vyskytují u určitých typů rakoviny. Tyto objevy vedly k vývoji nových léků, které se „zaměřují“ na tyto změny. Zbývá zjistit více.

Některé ze změn se nacházejí v genech. Geny se skládají z „písmen“ DNA, která obsahují instrukce, které buňkám v našem těle říkají, jak mají růst a pracovat. Geny vytvářejí proteiny, které ve skutečnosti provádějí pokyny v našich buňkách.

Rádi bychom použili vaši DNA k hledání změn v genech v rakovinných buňkách a krevních buňkách pomocí technologie zvané „sekvenování“. Sekvenování genů je způsob čtení DNA k identifikaci chyb v genech, které mohou přispívat k chování buněk. Některé změny v genech se vyskytují pouze v rakovinných buňkách. Jiné se vyskytují také v normálních buňkách, v genech, které mohly být předány z rodiče na dítě. Tato výzkumná studie bude zkoumat oba druhy genů.

Účelem této výzkumné studie je provést genové sekvenování (genové testy) na vašich rakovinných buňkách (získaných z biopsií nebo chirurgického zákroku) a normálních tkáních (obvykle krve). Výsledky genových testů budou použity k pokusu vyvinout lepší způsoby léčby a prevence rakoviny. Budeme také studovat lepší způsoby, jak sdělit výsledky těchto komplexních genových testů vám a vašim lékařům, a pomoci vám a vašim lékařům použít tyto informace k výběru nejlepších cest pro léčbu. V rámci této práce se také můžeme dozvědět věci o genech ve vašich normálních buňkách; některé z těchto informací budou také sdíleny s vámi a vašimi lékaři, pokud se tak rozhodnete.

Důležité je, že tato studie bude používat tkáňové vzorky, které již byly odebrány a uloženy na patologickém oddělení jako součást vaší klinické péče nebo jako součást jiných výzkumných studií, kterých se můžete účastnit. V této studii budou genové testy provedeny na materiálu až po provedení nezbytných klinických testů. Obecně nebudou nutné žádné další invazivní postupy.

Přehled studie

Postavení

Dokončeno

Detailní popis

Pokud souhlasíte s účastí na této studii, žádáme vás o povolení získat další vzorek krve (2 zkumavky nebo 4 čajové lžičky). Buňky z krve obsahují normální, nerakovinnou buněčnou DNA, která je potřebná pro analýzu.

Jedním z hlavních důvodů pro studium genetických charakteristik rakoviny je zjistit, zda mohou předvídat reakci na stávající léčbu. Proto bychom v této studii také propojili výsledky genových testů vaší rakoviny s lékařskými informacemi, které byly vytvořeny v průběhu vaší léčby. Zdravotní informace jsou obsaženy ve vaší lékařské dokumentaci.

Malý počet výsledků genových testů může mít význam pro vaše zdraví nebo léčbu. Mohou například odhalit změny genů, o kterých je známo, že způsobují, že rakoviny reagují na specifické terapie (nebo jsou vůči nim odolné). Proto vás žádáme, abyste zvážili, zda si přejete, abychom vašeho lékaře a vás informovali o některých výsledcích těchto genových testů.

Váš lékař vás může kontaktovat ohledně výsledků genových testů, ale pouze v případě, že by výsledky mohly přímo ovlivnit vaši léčbu rakoviny nebo jiného onemocnění, nebo pokud jste mu k tomu dali svolení. V některých případech vás může kontaktovat výzkumný lékař, aby zjistil, zda byste měli zájem o účast v jiné výzkumné studii na základě informací, které mohly být nalezeny ve vzorcích vaší tkáně nebo krve nebo ve vašich odpovědích na průzkum/pohovor. Požádáme vás také o poskytnutí jména a kontaktních údajů na příbuzného, ​​který může znát vaše místo pobytu nebo který by mohl rozhodnout o použití vašich údajů pro výzkum v budoucnu, pokud nejste k dispozici, abyste dali svolení sami.

Některé z vašich vzorků, stejně jako část materiálu vytvořeného během analýzy vašich tkání nebo krve, mohou být užitečné pro studium v ​​budoucnu s novějšími technologiemi a přístupy. Žádáme vás o svolení uložit tyto vzorky a materiály v bezpečném skladu biologických vzorků pro případný pozdější výzkum.

Žádáme vás také o účast ve dvou průzkumech souvisejících se studií v několika časových bodech. Tyto časové body zahrnují okamžik, kdy se poprvé zapojíte do studie, a poté, co obdržíte jakékoli výsledky z genových testů provedených na vašich vzorcích. Průzkumy se snaží zjistit, jak přemýšlíte o tomto typu genetické analýzy a jak s vámi lze sdílet informace, které by byly nejužitečnější.

Někteří účastníci studie budou také pozváni, aby se zúčastnili pohovorů souvisejících se studií. Účelem těchto rozhovorů je pochopit, co očekáváte, že se stane v důsledku genových testů, a jak vás výsledky genových testů mohly ovlivnit.

Vyplnění průzkumů by nemělo trvat déle než 15 minut. Očekává se, že dokončení rozhovorů bude trvat přibližně 45 minut.

A konečně, rychlý pokrok v porozumění a léčbě rakoviny nastane, když některé genetické informace odvozené z vašich tkání a krve budou moci být sdíleny s ostatními výzkumníky. Zejména National Institutes of Health (NIH) a další organizace vyvinuly speciální datová (informační) úložiště, která analyzují data a shromažďují výsledky určitých typů genetických studií. Tyto centrální banky budou uchovávat vaše genetické informace, vzorky a informace z průzkumů/rozhovorů a poskytnou je kvalifikovaným výzkumníkům, aby provedli další studie. Proto vás také žádáme o svolení sdílet vaše výsledky s těmito speciálními bankami. Vaše informace nebo vzorky budou zaslány pouze s připojeným číselným kódem. Vaše jméno ani jiné přímo identifikovatelné informace nebudou sdíleny s databankami ani jinými vyšetřovateli. Existuje mnoho bezpečnostních opatření, která chrání vaše informace a vzorky, zatímco jsou uloženy v úložištích a používány pro výzkum. ačkoli při sdílení těchto informací s těmito bankami může existovat mírné riziko ztráty soukromí, zavedli jsme postupy pro kódování vašich vzorků a informací a ochranu vašich dat. Přestože uděláme vše, co je v našich silách, abychom ochránili soukromí vašich údajů, nemůžeme absolutně zaručit jejich soukromí ani předvídat, jak budou genetické informace v budoucnu využívány.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Aktuální)

244

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

    • Massachusetts
      • Boston, Massachusetts, Spojené státy, 02215
        • Brigham and Women's Hospital
      • Boston, Massachusetts, Spojené státy, 02215
        • Dana-Farber Cancer Insitute

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Pacienti Dana-Farber Cancer Institute, kteří jsou identifikováni jako onkologičtí pacienti nebo pacienti s podezřením na způsobilou diagnózu rakoviny podle definice jejich poskytovatelů.

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • dříve souhlasili s protokolem DF/HCC 11-104, 02-180 a/nebo v současné době podstupují klinické testy na mutace KRAS na BWH
  • Mají diagnózu pokročilého plicního nebo kolorektálního adenokarcinomu
  • Předpokládaná délka života minimálně 6 měsíců
  • K dispozici dostatek genomové DNA pro sekvenování celého exomu a validaci CLIA
  • Mít ošetřujícího onkologa, který se účastní lékařské studie
  • Mluvte anglicky nebo španělsky

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Adenokarcinomy plic / tlustého střeva
Metastatické adenokarcinomy plic a tlustého střeva

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Proveditelnost WES u pacientů s rakovinou
Časové okno: 2 roky
Implementovat produkční platformu pro sekvenování celého exomu z archivního (FFPE) materiálu. Získání vzorků nádoru a zárodečné linie od pacientů s metastatickým karcinomem, kteří jsou léčeni v Dana-Farber Cancer Institute, počínaje metastatickými adenokarcinomy plic a tlustého střeva. Provést sekvenování celého exomu na těchto vzorcích za účelem stanovení somatických a zárodečných genomových změn, které mohou být relevantní pro vývoj nebo léčbu rakoviny. Vyvinout a implementovat analytický a interpretační rámec pro upřednostnění klinicky důležitých genomických změn.
2 roky
Klinický dopad sekvenování celého Exomu u pacientů s rakovinou
Časové okno: 2 roky
Stanovit klinický dopad somatického a zárodečného sekvenování celého exomu u pacientů s rakovinou. Stanovit proveditelnost sekvenování celého exomu u klinických pacientů s rakovinou s pokročilými solidními nádory, počínaje adenokarcinomy plic a tlustého střeva. Zavést systém kontroly a zveřejňování výsledků, včetně vybraných náhodných výsledků, které nesouvisejí s diagnózami rakoviny pacientů, lékařům, pacientům a jejich rodinám. Popsat dopad dat sekvenování celého exomu na lékařskou péči u pacientů s pokročilými solidními nádory.
2 roky
Popište dopad informací odvozených ze sekvenování Exome
Časové okno: 2 roky
Popsat dopad informací získaných ze somatického a zárodečného sekvenování celého exomu (WES) na pacienty s rakovinou.
2 roky

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Nikhil Wagle, MD, Dana-Farber Cancer Insitute

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia

1. září 2012

Primární dokončení (Aktuální)

1. dubna 2017

Dokončení studie (Aktuální)

1. prosince 2019

Termíny zápisu do studia

První předloženo

19. února 2013

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

28. dubna 2014

První zveřejněno (Odhad)

30. dubna 2014

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

10. února 2021

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

8. února 2021

Naposledy ověřeno

1. února 2021

Více informací

Termíny související s touto studií

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Adenokarcinom plic

Předplatit