Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Полноэкзомное секвенирование (WES) онкологических больных

8 февраля 2021 г. обновлено: Nikhil Wagle, Dana-Farber Cancer Institute

CanSeq: полноэкзомное секвенирование (WES) онкологических больных

Рак возникает, когда молекулы, контролирующие нормальный рост клеток (гены и белки), изменяются. Изменения в генах опухоли и в генах нормальных клеток называются «альтерациями». Многие из этих изменений могут быть обнаружены путем непосредственного исследования раковых клеток в опухоли или циркулирующих в крови. Несколько изменений, которые повторяются при определенных типах рака, уже идентифицированы. Эти открытия привели к разработке новых лекарств, «направленных» на эти изменения. Еще предстоит открыть.

Некоторые изменения обнаруживаются в генах. Гены состоят из «букв» ДНК, содержащих инструкции, сообщающие клеткам нашего тела, как расти и работать. Гены производят белки, которые фактически выполняют инструкции в наших клетках.

Мы хотели бы использовать вашу ДНК для поиска изменений в генах раковых клеток и клеток крови с помощью технологии, называемой «секвенирование». Секвенирование генов — это способ чтения ДНК для выявления ошибок в генах, которые могут влиять на поведение клеток. Некоторые изменения в генах происходят только в раковых клетках. Другие встречаются и в нормальных клетках, в генах, которые могли передаваться от родителей к детям. В этом исследовании будут изучены оба вида генов.

Целью этого исследования является секвенирование генов (генные тесты) на ваших раковых клетках (полученных в результате биопсии или хирургического вмешательства) и нормальных тканях (обычно крови). Результаты генных тестов будут использованы для разработки более эффективных способов лечения и профилактики рака. Мы также изучим лучшие способы сообщения результатов этих сложных генных тестов вам и вашим врачам, а также поможем вам и вашим врачам использовать эту информацию для выбора наилучших путей лечения. В рамках этой работы мы также можем узнать кое-что о генах ваших нормальных клеток; некоторая часть этой информации также будет передана вам и вашим врачам, если вы того пожелаете.

Важно отметить, что в этом исследовании будут использоваться образцы тканей, которые уже собраны и хранятся в патологоанатомическом отделении в рамках вашей клинической помощи или в рамках других исследований, в которых вы можете участвовать. В этом исследовании генные тесты будут проводиться на материале только после того, как будут проведены необходимые клинические тесты. Как правило, никаких дополнительных инвазивных процедур не требуется.

Обзор исследования

Подробное описание

Если вы согласны принять участие в этом исследовании, мы просим вашего разрешения на получение дополнительного образца крови (2 пробирки или 4 чайные ложки). Клетки крови содержат ДНК нормальных нераковых клеток, которая необходима для анализа.

Одна из основных причин для изучения генетических характеристик рака состоит в том, чтобы узнать, могут ли они предсказать ответ на существующие методы лечения. Поэтому в этом исследовании мы также свяжем результаты генных тестов вашего рака с медицинской информацией, полученной в ходе вашего лечения. Медицинская информация содержится в вашей медицинской карте.

Небольшое количество результатов генетического теста может иметь значение для вашего здоровья или лечения. Например, они могут обнаружить генные изменения, которые, как известно, заставляют рак реагировать (или быть устойчивым) к конкретным методам лечения. Поэтому мы просим вас подумать, хотите ли вы, чтобы мы информировали вашего врача и вас о некоторых результатах этих генных тестов.

Ваш врач может связаться с вами по поводу результатов генных тестов, но только в том случае, если результаты могут напрямую повлиять на ваше лечение рака или другого заболевания, или если вы дали ему или ей на это разрешение. В некоторых случаях врач-исследователь может связаться с вами, чтобы узнать, заинтересованы ли вы в участии в другом научном исследовании, основываясь на информации, которая могла быть обнаружена в ваших образцах тканей или крови или в ваших ответах на опросы/интервью. Мы также попросим вас предоставить имя и контактную информацию родственника, который может знать ваше местонахождение или принять решение об использовании вашей информации для исследований в будущем, если вы не можете дать разрешение самостоятельно.

Некоторые из ваших образцов, а также часть материала, полученного в ходе анализа ваших тканей или крови, могут оказаться полезными для изучения в будущем с использованием новых технологий и подходов. Мы просим вашего разрешения хранить эти образцы и материалы в безопасном хранилище биологических образцов для возможных последующих исследований.

Мы также просим вас принять участие в двух опросах, связанных с исследованием, в несколько моментов времени. Эти моменты времени включают время, когда вы впервые присоединяетесь к исследованию, и после того, как вы получите какие-либо результаты генных тестов, проведенных на ваших образцах. Опросы направлены на то, чтобы узнать, что вы думаете об этом типе генетического анализа, и как можно поделиться с вами информацией, которая была бы наиболее полезной.

Некоторых участников исследования также пригласят принять участие в связанных с исследованием интервью. Цель этих интервью — понять, что, по вашему мнению, произойдет в результате генных тестов, и как результаты генных тестов могли повлиять на вас.

Прохождение опроса должно занимать не более 15 минут. Ожидается, что интервью займет около 45 минут.

Наконец, быстрый прогресс в понимании и лечении рака произойдет, когда часть генетической информации, полученной из ваших тканей и крови, может быть передана другим исследователям. В частности, Национальные институты здоровья (NIH) и другие организации разработали специальные хранилища данных (информации), которые анализируют данные и собирают результаты отдельных видов генетических исследований. Эти центральные банки будут хранить вашу генетическую информацию, образцы и данные опросов/интервью и предоставлять их квалифицированным исследователям для проведения дополнительных исследований. Поэтому мы также просим вашего разрешения поделиться вашими результатами с этими специальными банками. Ваша информация или образцы будут отправлены только с прикрепленным кодовым номером. Ваше имя или другая информация, позволяющая установить личность, не будет передана банкам данных или другим следователям. Существует множество мер безопасности для защиты вашей информации и образцов, пока они хранятся в репозиториях и используются для исследований. хотя может существовать небольшой риск потери конфиденциальности при передаче этой информации этим банкам, мы установили процедуры для кодирования ваших образцов и информации и защиты ваших данных. Хотя мы сделаем все возможное для защиты конфиденциальности ваших данных, мы не можем абсолютно гарантировать их конфиденциальность или предсказать, как генетическая информация будет использоваться в будущем.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Действительный)

244

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Места учебы

    • Massachusetts
      • Boston, Massachusetts, Соединенные Штаты, 02215
        • Brigham and Women's Hospital
      • Boston, Massachusetts, Соединенные Штаты, 02215
        • Dana-Farber Cancer Insitute

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

18 лет и старше (Взрослый, Пожилой взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Полы, имеющие право на обучение

Все

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Пациенты Института рака Дана-Фарбер, которые идентифицированы как пациенты с онкологическими заболеваниями или пациенты с подозрением на подходящий диагноз рака, как это определено их поставщиками.

Описание

Критерии включения:

  • Ранее согласились на протоколы DF/HCC 11-104, 02-180 и/или в настоящее время проходят клиническое тестирование на мутации KRAS в BWH
  • Диагноз запущенной аденокарциномы легкого или колоректальной карциномы
  • Ожидаемая продолжительность жизни не менее 6 месяцев
  • Достаточное количество геномной ДНК доступно для полноэкзомного секвенирования и проверки CLIA.
  • Иметь лечащего онколога, который участвует в клиническом исследовании
  • Говорите по-английски или по-испански

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Аденокарциномы легких/толстой кишки
Метастатические аденокарциномы легкого и толстой кишки

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Осуществимость WES у онкологических больных
Временное ограничение: 2 года
Внедрить производственную платформу для секвенирования всего экзома из архивного материала (FFPE). Получить образцы опухоли и зародышевой линии от пациентов с метастатическим раком, которые проходят лечение в Институте рака Дана-Фарбер, начиная с метастатических аденокарцином легких и толстой кишки. Выполнить секвенирование полного экзома этих образцов, чтобы определить соматические и зародышевые геномные изменения, которые могут иметь отношение к развитию или лечению рака. Разработать и внедрить аналитическую и интерпретативную основу для определения приоритетов клинически важных геномных изменений.
2 года
Клиническое влияние секвенирования полного экзома у онкологических больных
Временное ограничение: 2 года
Определить клиническое влияние секвенирования полного экзома соматической и зародышевой линии у онкологических больных. Определить возможность полноэкзомного секвенирования онкологических больных с прогрессирующими солидными опухолями, начиная с аденокарцином легкого и толстой кишки. Создать систему обзора и раскрытия результатов, включая отдельные случайные результаты, не связанные с диагнозами рака у пациентов, для врачей, пациентов и их семей. Описать влияние данных полноэкзомного секвенирования на лечение пациентов с солидными опухолями на поздних стадиях.
2 года
Описать влияние информации, полученной в результате секвенирования экзома
Временное ограничение: 2 года
Описать влияние информации, полученной в результате полноэкзомного секвенирования соматической и зародышевой линии (WES), на больных раком.
2 года

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Следователи

  • Главный следователь: Nikhil Wagle, MD, Dana-Farber Cancer Insitute

Публикации и полезные ссылки

Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования

1 сентября 2012 г.

Первичное завершение (Действительный)

1 апреля 2017 г.

Завершение исследования (Действительный)

1 декабря 2019 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

19 февраля 2013 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

28 апреля 2014 г.

Первый опубликованный (Оценивать)

30 апреля 2014 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

10 февраля 2021 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

8 февраля 2021 г.

Последняя проверка

1 февраля 2021 г.

Дополнительная информация

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться