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拔牙和阿莫西林后耐药组的变化。

2017年10月25日 更新者:Dr Michael G. Botelho、The University of Hong Kong

牙科手术后短期抗生素治疗引起的口腔和肠道细菌耐药性变化的评估 - 一项前瞻性临床研究。

本研究的目的是评估两组外科手术抗生素治疗后口腔和肠道细菌耐药性变化的性质。 干预组将在手术拔牙后接受阿莫西林和止痛药疗程,并在六个月内四次预约从唾液、舌苔和粪便样本中采集细菌样本。 这将与手术拔除后仅接受止痛药的对照组进行比较。

在手术拔除受影响的牙齿后,将对健康人群的口腔和肠道微生物群中抗生素耐药性的发展和可持续性进行为期 6 个月的随访检查。

将使用宏基因组 DNA 测序和抗性基因定量研究抗生素抗性细菌成分比例的变化。

研究概览

详细说明

试验设计 这是一项前瞻性、纵向、观察性、队列研究,调查年轻人在术后使用和不使用抗生素的情况下接受智齿手术拔除。 抗生素的处方将基于病例复杂性、创伤和手术时间长短的临床判断。 不会执行随机化。 将在四个观察时间点收集 3 个细菌样本(舌苔、唾液和粪便样本):基线、1 周、1 个月和 6 个月。

调查接受和未接受阿莫西林的第三磨牙手术拔除前后一组全身健康的年轻人口腔和肠道微生物群中一系列细菌耐药基因的范围和持久性。

假设 预计在手术拔牙(例如受影响的第三磨牙)后开具的单疗程阿莫西林(250 毫克,每天三次,持续五天)会改变短期和长期的抗生素耐药性,并导致显着的健康人群中口腔和肠道抵抗组组成的变化。

通过对细菌耐药性的分析,与基线数据随时间的比较将深入了解抗菌耐药性增加的影响。 了解这一点应该有助于为确定牙科手术临床程序合理处方抗生素的指南铺平道路,从而形成抗生素管理的基础,并确定在处方抗生素时有益意识的潜在风险。

该基线数据可以在更长的时间范围内进行跟进,以在以后的研究中检查抗性基因随时间的持久性。 预计大量患者将来自香港大学的学生群体,这将使以后的召回变得简单明了。 在初步研究后,患者将被要求记录抗生素消耗量,这可能会为以后的研究提供信息。

将招募书面同意参与研究的计划进行手术摘除的受试者。 接受过专业颌面外科培训 (ML Co-A) 的经验丰富的临床操作员将负责进行临床治疗。 抗生素的处方将根据病例的复杂程度、手术难度和所需时间而定。 因此,患者不会被随机化,而是基于每组获得 10 名患者。 将在以下四个时间点收集三组样本(唾液、舌背刮屑和粪便样本)。

受试者将被要求在进行样本采集的前一天晚上不要刷牙,并且同样被要求不要使用漱口水。 除收集时间点外,受试者将被要求在研究期间保持其“正常”、常规的口腔卫生程序。

收集基线样本后,将进行第三磨牙的手术拔除。 将为所有受试者提供拔牙后说明和止痛药,为所有受试者提供止痛药,为需要抗生素的受试者提供阿莫西林。 将通过询问患者并在召回预约时检查阿莫西林片剂包装条来检查合规性。 受试者将被要求在六个月的研究期间不要使用任何漱口水(如果他们还没有这样做的话),并且将提供不含抗菌成分的牙膏供使用。

如下所述,将在所有指定时间点收集用于 DNA 提取的舌苔、唾液和粪便样本。

基线-抗生素组 手术当天 基线-无抗生素 手术当天

1周

1周

1个月 6个月

口腔样本将在早上饭后至少两小时采集。 建议受试者在预约后 24 小时内收集粪便样本。

用消毒过的微型毛刷采集舌苔,每次在舌头前三分之二的一半处从后向前轻抚舌面三次,取舌苔样本。采样的时间点。 样品采集后,微刷的尖端将被切割并放入 Eppendorf 小瓶中。 在进行 DNA 提取之前,样本将储存在 -800°C。

对于唾液样本,受试者将被要求吐出到一个无菌容器中,该容器将立即转移到冰中,然后在 - 800C 下储存。 粪便样本的收集将根据为人类微生物组项目 (16) 提供的粪便样本收集指南进行。 使用由(Qiagen,USA)提供的 DNA 提取试剂盒从样品中提取 DNA。

宏基因组鸟枪法测序 对于宏基因组测序,提取的基因组 DNA 将被物理剪切成 250 bp 的平均片段大小。 片段化的 gDNA 将在 Illumina HighSeq 的泳道上进行双向测序(每个方向 100 bp)。 将使用 Trimmomatic (17) 执行质量过滤,之后配对和未配对的正向读取将被组合,并且具有超过 10% 的不明确碱基的读取将被删除。 接下来,将使用 Best Match Tagger v3.101 (18) 筛选人类序列的读数,之后将删除人类读数和重复读数。

抗性基因的相对丰度 使用的 blaTEM 引物将如 Kim 等人 (22) 所述。 分析 erm (G)、erm (B) 和 erm (F) 抗性基因存在的引物将如 Jansonn 等人 (23) 所述。 Tet (M) 和 Tet (W) 基因的引物将如 Diaz-Torez 等人 (24) 所述。 16S通用引物将作为标准用于相对定量。

12 将使用实时 PCR 评估相对基因丰度。 常规 PCR 反应将用于生成基因特异性扩增子,用作 qPCR 的模板 DNA 标准。 将使用凝胶/PCR 提取试剂盒 QIAquick PCR 纯化试剂盒(Qiagen,美国)纯化扩增子,并使用 Quant-iTTM PicoGreen® dsDNA 检测试剂盒(Invitrogen)进行荧光定量。 将根据扩增子的大小和质量计算 DNA 分子的数量。 将按照 Yu 等人的程序制备和使用扩增子的十倍连续稀释。 (25).

研究对象的选择和退出将从香港大学菲腊牙科医院的轮候名单中招募经过临床筛选并希望拔除阻生智齿的患者。

样本量 我们将以 log 10 比例显示与从粪便样本中提取的社区 DNA 中第 0 天相比的结果。 根据之前的研究 (15),我们预计标准偏差为 1.25 个单位。 通过使用软件 G*Power 版本 3.1.9.2(Franz Faul,德国基尔大学)确定样本量,我们需要每组至少 8 个才能具有 0.8 的功效来检测 0.05 处的 1.25 单位差异显着性水平。 因此,在本研究中,我们在初始阶段收集的总样本量为 16 个(每组 8 个)。

受试者治疗 这是一项前瞻性、纵向、观察性、队列研究,调查年轻成人在术后使用和不使用抗生素的情况下接受智齿手术拔除。 术后会给予抗生素和止痛药。

阿莫西林 口服,每天 3 次,每次 250 毫克,持续 5 天 镇痛药 - Arcoxia 120 毫克,持续三天,扑热息痛 500 毫克 QID PRN,持续 3 天,或扑热息痛 1 克加磷酸可待因 16 毫克。 抗生素的处方将基于病例复杂性、创伤和手术时间长短的临床判断。 不会执行第 14 次随机化。 将在四个观察时间点收集 3 个细菌样本(舌苔、漱口水和粪便样本):基线、1 周、1 个月和 6 个月。

如果患者在六个月的审查期间必须服用额外的抗生素,他们将被要求告知研究者。

将通过询问患者并在召回预约时检查阿莫西林片剂包装条来检查合规性。

疗效评估 该研究并未研究新药的疗效。 正在执行的治疗程序是根据常规治疗方案进行的。

安全性评估 该研究不关注新药的安全性。 正在执行的治疗程序是根据常规治疗方案进行的。

研究类型

观察性的

注册 (预期的)

16

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

      • Hong Kong、中国
        • Oral Rehabilitation, Faculty of Dentistry, The University of Hong Kong

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

18年 至 45年 (成人)

接受健康志愿者

不

有资格学习的性别

全部

取样方法

非概率样本

研究人群

患者将从 Prince Philip 牙科医院的等候名单中招募,计划进行第三磨牙拔除的受试者将根据纳入和排除标准招募,前提是他们对获取唾液、舌苔和粪便样本提供书面知情同意书在指定的时间点,在研究者详细解释了研究设计和目标之后。

抗生素的处方将基于基于病例复杂性和手术创伤程度的临床判断。术中第 1 组-使用抗生素进行手术拔除-阿莫西林 250 毫克,每天 3 次,持续 5 天,并使用止痛药来缓解疼痛。

第 2 组 - 不使用抗生素的手术拔牙 - 仅使用镇痛剂来缓解疼痛

描述

纳入标准:

  1. 年龄在 18 至 45 岁之间的男性和女性
  2. 计划进行手术拔牙的受试者。
  3. 在被告知研究设计、目标和风险/收益后签署知情同意书的受试者
  4. 参与研究前三个月内无抗生素使用史。
  5. 没有妨碍外科手术或抗生素治疗的医疗状况。
  6. 无对 β 内酰胺过敏史。
  7. 阿莫西林治疗无禁忌症。
  8. 受试者没有怀孕或目前正在哺乳。
  9. 没有已知或怀疑的免疫缺陷。

排除标准:

  1. 基线评估后 3 个月内的抗生素使用史。
  2. 任何妨碍外科手术或抗生素治疗的医疗状况。
  3. 对 β 内酰胺过敏史
  4. 阿莫西林治疗的禁忌症
  5. 孕妇或哺乳期妇女。
  6. 已知或疑似免疫缺陷的受试者。
  7. 龋齿活跃受试者定义为具有涉及多于3颗牙齿的活跃龋齿的受试者。
  8. 被诊断患有慢性牙周炎的受试者。
  9. 受试者经常使用抗菌漱口水或计划在拔牙后使用。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

  • 观测模型:队列
  • 时间观点:预期

队列和干预

团体/队列
干预/治疗
阿莫西林
不执行随机化。 由进行拔牙的临床医生(根据病例复杂性和术中判断)开具抗生素处方的患者被招募到该组中。主要研究者不参与是否开抗生素处方的决定。
萃取
其他名称:
  • 阿罗辛
第三磨牙拔除
没有阿莫西林
拔牙后未接受抗生素治疗的患者被招募到该组中。
第三磨牙拔除

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
通过 HUmanN 1.0 在每个时间点输出的抗性基因对抗生素抗性基因进行量化。在每个时间点通过 Blatem 和 erm 基因的 QPCR 值进行验证。
大体时间:基线、一周、一个月、六个月

耐药基因组分析 宏基因组 DNA 序列中总耐药基因(耐药基因组)(相对)浓度的变化分析如下: 抗生素耐药基因将从抗生素耐药基因数据库 (20) 下载。 下载的数据集(ardbAnno1.0), 包含 7828 个条目,将首先成为非冗余的,来自 USEARCH v7.0.1090 (20) 的 UBLAST 将用于将读取映射到 (ARDB) 蛋白质(E 值阈值 10,后过滤以包括具有最大值的命中E 值 1E-10(含)。

结果将用 HUMAN (21) 进行处理,以将权重分配给蛋白质。 然后通过除以过滤的(非人类)读数总数对这些权重进行归一化,并根据耐药性组中的抗生素耐药性类型进行汇总。 接下来,将计算基线权重大于 1E-8 的所有阻力类型的倍数变化。

基线、一周、一个月、六个月

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Michael G Botelho, BDS MSc PhD、The University of Hong Kong

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始

2015年6月1日

初级完成 (预期的)

2018年3月1日

研究完成 (预期的)

2018年3月1日

研究注册日期

首次提交

2016年7月6日

首先提交符合 QC 标准的

2016年7月8日

首次发布 (估计)

2016年7月12日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2017年10月27日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2017年10月25日

最后验证

2016年7月1日

更多信息

与本研究相关的术语

其他研究编号

  • Version 1.1 (22.4.15)

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)?

是的

IPD 计划说明

未识别的患者数据将在研究完成后 6 个月内公布。

此信息直接从 clinicaltrials.gov 网站检索,没有任何更改。如果您有任何更改、删除或更新研究详细信息的请求,请联系 register@clinicaltrials.gov. clinicaltrials.gov 上实施更改,我们的网站上也会自动更新.

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