白细胞 DNA 甲基化和微生物多样性对社区获得性肺炎 (ELDER-BIOME) 期间宿主防御机制的影响 (ELDER-BIOME)
白细胞 DNA 甲基化和微生物多样性对社区获得性肺炎期间宿主防御机制的影响
社区获得性肺炎 (CAP) 代表了一个主要的医疗保健问题,尽管有最先进的护理,但与严重肺炎相关的死亡率和发病率仍然很高。
虽然 DNA 甲基化改变在癌症中的作用已得到广泛研究,但对其对抗菌防御的影响的了解非常有限。 此外,最近的临床前研究表明,肠道和呼吸道微生物群有助于宿主防御细菌性肺炎。
本研究旨在探索一个全新的研究领域,将血液白细胞(单核细胞和嗜中性粒细胞)中 DNA 甲基化的程度与肠道和呼吸道微生物群的功能联系起来,以影响先天免疫反应和宿主对 CAP 的防御
研究概览
详细说明
理由:
社区获得性肺炎 (CAP) 代表了一个主要的医疗保健问题,尽管有最先进的护理,但与严重肺炎相关的死亡率和发病率仍然很高。
虽然 DNA 甲基化改变在癌症中的作用已得到广泛研究,但对其对抗菌防御的影响的了解非常有限。 此外,最近的临床前研究表明,肠道和呼吸道微生物群有助于宿主防御细菌性肺炎。
本研究旨在探索一个全新的研究领域,将血液白细胞(单核细胞和嗜中性粒细胞)中 DNA 甲基化的程度与肠道和呼吸道微生物群的功能联系起来,以影响对 CAP 的先天免疫反应和宿主防御。
主要目标:
- 深入了解血液白细胞(单核细胞和中性粒细胞)中 DNA 甲基化改变在先天免疫反应和 CAP 患者宿主防御中的作用。
- 确定 CAP 患者肠道和呼吸道微生物群的组成和功能。
次要目标:
1. 评估肠道菌群对 CAP 患者白细胞 DNA 甲基化的影响
学习规划:
阿姆斯特丹学术医学中心急诊科和内科病房 CAP 患者的观察性研究
研究人群:
231 名 CAP 患者和 115 名 18 岁以上的健康受试者。
方法:
从上述患者和健康志愿者中抽取最多90毫升的血液分析纯化的单核细胞和中性粒细胞的DNA甲基化模式,分析DNA甲基转移酶和十一十一易位(TET)活性、RNA基因表达以及一系列标准先天免疫功能测试。 此外,从入院样本中分离出的单核细胞和中性粒细胞将在体外用肺炎链球菌和肺炎克雷伯菌进行刺激。 此外,还将获得直肠和鼻咽拭子,以研究肠道和呼吸道微生物群组成和功能的作用。 患者材料将在纳入后和第 28 天获得,届时患者将在门诊就诊进行随访。
与参与、利益和群体相关性相关的负担和风险的性质和程度:
参加这项观察性研究不会使参与者和健康志愿者受益。 该研究将提供有关白细胞 DNA 甲基化以及肠道和呼吸道微生物群在 CAP 期间对宿主防御机制的影响的信息。 通过提供改变宿主反应的替代免疫调节治疗方案,获得的知识可能在未来使 CAP 患者受益。 参与 ELDER-BIOME 研究的患者的负担和风险很小。 研究人员将采集 90 毫升血液、4 个直肠拭子和 2 个鼻咽拭子,分为两个时间点(出现当天和出现后第 28 天)。 健康志愿者将在一个时间点接受 1 次抽血(70 毫升)和 2 次直肠和 2 次鼻咽拭子。
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习地点
-
-
Noord-Holland
-
Amsterdam、Noord-Holland、荷兰、1105 AZ
- 招聘中
- Academic Medical Center - University of Amsterdam
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接触:
- Tom van der Poll, MD, PhD
- 邮箱:t.vanderpoll@amc.uva.nl
-
副研究员:
- W. Joost Wiersinga, MD, PhD, MBA
-
副研究员:
- Brendon P Scicluna, PhD
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准:
- 临床怀疑新发急性呼吸道感染
- 就诊的主要原因是临床怀疑新发急性呼吸道感染;入院不是必需的
- 为诊断(非研究)目的进行的胸部 X 光或 CT 扫描显示明显的新的或进行性浸润、实变、空洞或胸腔积液
- 在过去 7 天内出现以下症状:
- 至少一种呼吸道症状(咳嗽、喉咙痛、流鼻涕或鼻塞、呼吸困难)
- 至少一种全身症状(发烧、头痛、肌肉酸痛、出汗或发冷或疲倦)。
排除标准:
- 患者缺乏提供知情同意的能力
- 患者未提供知情同意书
- 病人已从另一家医院转院
- 患者参加了抗感染或免疫调节疗法的介入性临床研究
- 患者在入院前已接受任何类型的口服或全身抗生素治疗超过 48 小时。
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
|---|---|
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肺炎患者
直肠拭子 (4x) 分为两个时间点(第 0 天和第 28 天) 鼻咽拭子 (2x) 分为两个时间点(第 0 天和第 28 天) 抽血 (90ml) 分为两个时间点(第 0 天和第 28 天) )
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基线访问 (2x) 和第 28 天 (2x) 的直肠拭子或单个时间点 (2x) 的直肠拭子(健康志愿者)
基线访问 (1x) 和第 28 天 (1x) 的鼻咽拭子或单个时间点 (2x) 的鼻咽拭子(健康志愿者)
在基线访视时抽血 (45ml) 和在第 28 天 (45ml)(肺炎患者)或单次抽血(70ml)(健康志愿者)
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健康受试者
直肠拭子 (2x) 鼻咽拭子 (2x) 抽血 (70ml)
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基线访问 (2x) 和第 28 天 (2x) 的直肠拭子或单个时间点 (2x) 的直肠拭子(健康志愿者)
基线访问 (1x) 和第 28 天 (1x) 的鼻咽拭子或单个时间点 (2x) 的鼻咽拭子(健康志愿者)
在基线访视时抽血 (45ml) 和在第 28 天 (45ml)(肺炎患者)或单次抽血(70ml)(健康志愿者)
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
大体时间 |
|---|---|
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白细胞 DNA 甲基化的改变
大体时间:第 0 天
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第 0 天
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次要结果测量
结果测量 |
大体时间 |
|---|---|
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肠道和鼻咽微生物群的组成和功能
大体时间:第 0 天
|
第 0 天
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白细胞 DNA 甲基化的改变
大体时间:第28天
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第28天
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肠道和鼻咽微生物群的组成和功能
大体时间:第28天
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第28天
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合作者和调查者
出版物和有用的链接
一般刊物
- Brands X, van Engelen TSR, de Vries FMC, Haak BW, Klarenbeek AM, Kanglie MMNP, van den Berk IAH, Schuurman AR, Peters-Sengers H, Otto NA, Faber DR, Lutter R, Scicluna BP, Stoker J, Prins JM, Joost Wiersinga W, van der Poll T. Association of Hyperferritinemia With Distinct Host Response Aberrations in Patients With Community-Acquired Pneumonia. J Infect Dis. 2022 Jun 1;225(11):2023-2032. doi: 10.1093/infdis/jiac013.
- Brands X, Haak BW, Klarenbeek AM, Butler J, Uhel F, Qin W, Otto NA, Jakobs ME, Faber DR, Lutter R, Wiersinga WJ, van der Poll T, Scicluna BP. An epigenetic and transcriptomic signature of immune tolerance in human monocytes through multi-omics integration. Genome Med. 2021 Aug 16;13(1):131. doi: 10.1186/s13073-021-00948-1.
- Brands X, de Vries FMC, Uhel F, Haak BW, Peters-Sengers H, Schuurman AR, van Engelen TSR, Lutter R, Cremer OL, Bonten MJ, Schultz MJ, Scicluna BP, van der Poll T; MARS Consortium. Plasma Ferritin as Marker of Macrophage Activation-Like Syndrome in Critically Ill Patients With Community-Acquired Pneumonia. Crit Care Med. 2021 Nov 1;49(11):1901-1911. doi: 10.1097/CCM.0000000000005072.
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (预期的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (估计)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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