Leukosyyttien DNA:n metylaation ja mikrobiomien monimuotoisuuden vaikutus isännän puolustusmekanismeihin yhteisössä hankitun keuhkokuumeen (ELDER-BIOME) aikana (ELDER-BIOME)

Perustelut:

Yhteisön aiheuttama keuhkokuume (CAP) on merkittävä terveydenhuollon ongelma, ja vakavaan keuhkokuumeeseen liittyvä kuolleisuus ja sairastuvuus ovat edelleen huomattavia huippuluokan hoidosta huolimatta.

Vaikka muuttuneen DNA-metylaation roolia syövässä on tutkittu laajalti, tieto sen vaikutuksesta antibakteeriseen puolustukseen on erittäin rajallinen. Lisäksi viimeaikaiset prekliiniset tutkimukset osoittivat, että suoliston ja hengitysteiden mikrobiota edistää isännän puolustusta bakteeriperäistä keuhkokuumetta vastaan.

Tämän tutkimuksen tavoitteena on tutkia täysin uutta tutkimusaluetta, joka yhdistää DNA:n metylaation laajuuden veren leukosyyteissä (monosyytit ja neutrofiilit) sekä suoliston ja hengitysteiden mikrobiotan toiminnan vaikutukseen synnynnäisten immuunivasteiden vaikutukseen CAP:tä vastaan ​​ja isännän puolustautumiskykyyn.

Ensisijaiset tavoitteet:

1. Saadakseen käsityksen muuttuneen DNA-metylaation roolista veren leukosyyteissä (monosyytit ja neutrofiilit) synnynnäisissä immuunivasteissa ja isännän puolustuksessa potilailla, joilla on CAP.
2. Suoliston ja hengitysteiden mikrobiotan koostumuksen ja toiminnan määrittäminen CAP-potilailla.

Toissijainen tavoite:

1. Arvioida suoliston mikrobiotan vaikutusta leukosyyttien DNA:n metylaatioon potilailla, joilla on CAP

Opintojen suunnittelu:

Havaintotutkimus CAP-potilailla Amsterdamin akateemisen lääketieteellisen keskuksen päivystysosastolla ja sisätautiosastolla

Tutkimuspopulaatio:

231 CAP-potilasta ja 115 tervettä yli 18-vuotiasta henkilöä.

Menetelmät:

Yllä mainituista potilaista ja terveistä vapaaehtoisista otetaan enintään 90 ml verta puhdistettujen monosyyttien ja neutrofiilien DNA-metylaatiokuvioiden analysoimiseksi, jotka analysoidaan DNA-metyylitransferaasin ja kymmenen yhdentoista translokaation (TET) aktiivisuuden, RNA-geenin ilmentymisen yhteydessä. ja valikoima tavanomaisia ​​synnynnäisiä immuunitoimintatestejä. Lisäksi sisäänottonäytteistä eristettyjä monosyyttejä ja neutrofiilejä stimuloidaan in vitro Streptococcus pneumoniaella ja Klebsiella pneumoniaella. Lisäksi otetaan peräsuolen ja nenänielun pyyhkäisynäytteitä suoliston ja hengitysteiden mikrobiston koostumuksen ja toiminnan tutkimiseksi. Potilasmateriaali hankitaan mukaanoton yhteydessä ja päivänä 28, jolloin potilaat nähdään poliklinikalla seurantaa varten.

Osallistumiseen, hyötyyn ja ryhmäsuhteeseen liittyvien rasitteiden ja riskien luonne ja laajuus:

Tähän havainnointitutkimukseen osallistuminen ei hyödytä osallistujia ja terveitä vapaaehtoisia. Tutkimus antaa tietoa leukosyyttien DNA:n metylaation sekä suoliston ja hengitysteiden mikrobiotan vaikutuksesta isännän puolustusmekanismeihin CAP:n aikana. Saatu tieto voi mahdollisesti hyödyttää CAP-potilaita tulevaisuudessa tarjoamalla vaihtoehtoisia immuunijärjestelmää moduloivia hoitovaihtoehtoja, jotka muokkaavat isännän vastetta. ELDER-BIOME-tutkimukseen osallistuvien potilaiden taakka ja riskit ovat minimaaliset. Tutkijat ottavat 90 ml verta, 4 peräsuolen pyyhkäisyä ja 2 nenänielun vanupuikkoa jaettuna kahdelle aikapisteelle (esityspäivä ja 28. päivä esityksen jälkeen). Terveiltä vapaaehtoisilta otetaan yksi verinäyte (70 ml) ja 2 peräsuolen ja 2 nenänielun vanupuikkoa kerralla.