Het effect van leukocyten-DNA-methylering en micRoBIOME-diversiteit op afweermechanismen van de gastheer tijdens door de gemeenschap verworven pneumonie (ELDER-BIOME) (ELDER-BIOME)

Grondgedachte:

Buiten het ziekenhuis opgelopen pneumonie (CAP) vormt een groot probleem in de gezondheidszorg en de mortaliteit en morbiditeit in verband met ernstige pneumonie blijven aanzienlijk, ondanks de modernste zorg.

Hoewel de rol van veranderde DNA-methylatie bij kanker uitgebreid is bestudeerd, is de kennis over de impact ervan op de antibacteriële afweer zeer beperkt. Bovendien hebben recente preklinische studies aangetoond dat de darm- en respiratoire microbiota bijdragen aan de afweer van de gastheer tegen bacteriële longontsteking.

Deze studie heeft tot doel een volledig nieuw onderzoeksgebied te verkennen dat de mate van DNA-methylatie in bloedleukocyten (monocyten en neutrofielen) en de functie van darm- en respiratoire microbiota koppelt aan de invloed van aangeboren immuunresponsen op en afweer van de gastheer tegen CAP.

Primaire doelen:

1. Inzicht verwerven in de rol van veranderde DNA-methylatie in bloedleukocyten (monocyten en neutrofielen) in aangeboren immuunresponsen en afweer van de gastheer bij patiënten met CAP.
2. Om de samenstelling en functie van de darm- en respiratoire microbiota bij patiënten met CAP te bepalen.

Secundaire doelstelling:

1. Om de invloed van de darmmicrobiota op de methylering van leukocyten-DNA bij patiënten met CAP te beoordelen

Studie ontwerp:

Observationeel onderzoek onder patiënten met CAP op de Spoedeisende Hulp en afdeling Interne Geneeskunde van het Academisch Medisch Centrum Amsterdam

Studiepopulatie:

231 CAP-patiënten en 115 gezonde proefpersonen ouder dan 18 jaar.

methoden:

Van bovengenoemde patiënten en gezonde vrijwilligers zal maximaal 90 ml bloed worden afgenomen om DNA-methylatiepatronen van gezuiverde monocyten en neutrofielen te analyseren, die zullen worden geanalyseerd in verband met DNA-methyltransferase en tien elf translocatie (TET) -activiteit, RNA-genexpressie en een selectie van standaard aangeboren immuunfunctietests. Bovendien zullen geïsoleerde monocyten en neutrofielen uit opnamemonsters in vitro gestimuleerd worden met Streptococcus pneumoniae en Klebsiella pneumoniae. Daarnaast zullen rectale en nasofaryngeale uitstrijkjes worden afgenomen om de rol van de samenstelling en functie van de darm- en respiratoire microbiota te onderzoeken. Patiëntmateriaal wordt verkregen bij opname en op dag 28, wanneer patiënten op de polikliniek worden gezien voor follow-up.

Aard en omvang van de lasten en risico's verbonden aan participatie, voordeel en groepsgebondenheid:

Deelname aan deze observationele studie zal de deelnemers en gezonde vrijwilligers niet ten goede komen. De studie zal informatie verschaffen over de invloed van leukocyten-DNA-methylatie en de darm- en respiratoire microbiota op afweermechanismen van de gastheer tijdens CAP. De verkregen kennis kan in de toekomst potentieel ten goede komen aan CAP-patiënten door alternatieve immuunmodulerende behandelingsopties te bieden die de reactie van de gastheer wijzigen. De belasting en risico's voor patiënten die deelnemen aan de ELDER-BIOME-studie zijn minimaal. De onderzoekers nemen 90 ml bloed, 4 rectale uitstrijkjes en 2 nasofaryngeale uitstrijkjes verdeeld over twee tijdstippen (dag van presentatie en dag 28 na presentatie). Gezonde vrijwilligers zullen worden onderworpen aan een bloedafname (70 ml) en 2 rectale - en 2 nasofaryngeale uitstrijkjes op een bepaald tijdstip.