Wpływ metylacji DNA leukocytów i różnorodności mikroBIOMU na mechanizmy obronne gospodarza podczas pozaszpitalnego zapalenia płuc (ELDER-BIOME) (ELDER-BIOME)

Racjonalne uzasadnienie:

Pozaszpitalne zapalenie płuc (PZP) stanowi poważny problem opieki zdrowotnej, a śmiertelność i zachorowalność związana z ciężkim zapaleniem płuc pozostają znaczne, pomimo najnowocześniejszej opieki.

Chociaż rola zmienionej metylacji DNA w raku była szeroko badana, wiedza na temat jej wpływu na obronę przeciwbakteryjną jest bardzo ograniczona. Ponadto ostatnie badania przedkliniczne wykazały, że mikroflora jelitowa i oddechowa przyczynia się do obrony gospodarza przed bakteryjnym zapaleniem płuc.

Niniejsze badanie ma na celu zbadanie zupełnie nowego obszaru badawczego, łączącego stopień metylacji DNA w leukocytach krwi (monocytach i neutrofilach) oraz funkcję mikroflory jelitowej i oddechowej na wpływ wrodzonych odpowiedzi immunologicznych i obrony gospodarza przed PZP.

Główne cele:

1. Uzyskanie wiedzy na temat roli zmienionej metylacji DNA w leukocytach krwi (monocytach i neutrofilach) we wrodzonych odpowiedziach immunologicznych i obronie gospodarza u pacjentów z PZP.
2. Określenie składu i funkcji mikroflory jelitowej i oddechowej u pacjentów z PZP.

Cel drugorzędny:

1. Ocena wpływu mikroflory jelitowej na metylację DNA leukocytów u chorych na PZP

Projekt badania:

Badanie obserwacyjne wśród pacjentów z PZP na Oddziale Ratunkowym i Oddziale Chorób Wewnętrznych Akademickiego Centrum Medycznego w Amsterdamie

Badana populacja:

231 pacjentów z PZP i 115 zdrowych osób powyżej 18 roku życia.

Metody:

Od wyżej wymienionych pacjentów i zdrowych ochotników zostanie pobrane maksymalnie 90 ml krwi w celu analizy wzorców metylacji DNA oczyszczonych monocytów i neutrofili, które zostaną przeanalizowane w powiązaniu z aktywnością metylotransferazy DNA i translokacji dziesięć jedenaście (TET), ekspresją genów RNA oraz wybór standardowych testów odporności wrodzonej. Ponadto izolowane monocyty i neutrofile z próbek przyjętych będą stymulowane in vitro przez Streptococcus pneumoniae i Klebsiella pneumoniae. Ponadto zostaną pobrane wymazy z odbytu i jamy nosowo-gardłowej w celu zbadania roli składu i funkcji mikroflory jelitowej i oddechowej. Materiał od pacjentów zostanie uzyskany po włączeniu iw 28. dniu, kiedy pacjenci będą przyjmowani w poradni w celu obserwacji.

Charakter i zakres obciążenia i ryzyka związanego z uczestnictwem, korzyściami i powiązaniem z grupą:

Uczestnictwo w tym badaniu obserwacyjnym nie przyniesie korzyści uczestnikom i zdrowym ochotnikom. Badanie dostarczy informacji na temat wpływu metylacji DNA leukocytów oraz mikroflory jelitowej i oddechowej na mechanizmy obronne gospodarza podczas PZP. Uzyskana wiedza może potencjalnie przynieść korzyści pacjentom z PZP w przyszłości, zapewniając alternatywne opcje leczenia immunomodulującego, które modyfikują odpowiedź gospodarza. Obciążenie i ryzyko dla pacjentów biorących udział w badaniu ELDER-BIOME jest minimalne. Badacze pobiorą 90 ml krwi, 4 wymazy z odbytu i 2 wymazy z nosogardzieli podzielone na dwa punkty czasowe (dzień prezentacji i 28 dzień po prezentacji). Zdrowi ochotnicy zostaną poddani jednemu pobraniu krwi (70 ml) oraz 2 wymazom z odbytu i 2 nosogardzieli w jednym punkcie czasowym.