Effekten af ​​leukocyt-Dna-metylering og mikrobiomdiversitet på værtsforsvarsmekanismer under samfundserhvervet lungebetændelse (ELDER-BIOME) (ELDER-BIOME)

Begrundelse:

Fællesskabserhvervet lungebetændelse (CAP) repræsenterer et stort sundhedsproblem, og dødelighed og sygelighed forbundet med svær lungebetændelse er fortsat betydelig, på trods af den nyeste behandling.

Mens rollen af ​​ændret DNA-methylering i cancer er blevet undersøgt i vid udstrækning, er viden om dens indvirkning på antibakterielt forsvar meget begrænset. Derudover viste nyere prækliniske undersøgelser, at tarm- og luftvejsmikrobiotaen bidrager til værtens forsvar mod bakteriel lungebetændelse.

Denne undersøgelse har til formål at udforske et helt nyt forskningsområde, der forbinder omfanget af DNA-methylering i blodleukocytter (monocytter og neutrofiler) og funktionen af ​​tarm- og respiratorisk mikrobiota på indflydelsen af ​​medfødte immunresponser på og værtsforsvar mod CAP.

Primære mål:

1. At opnå indsigt i rollen af ​​ændret DNA-methylering i blodleukocytter (monocytter og neutrofiler) i medfødte immunresponser og værtsforsvar hos patienter med CAP.
2. At bestemme sammensætningen og funktionen af ​​tarm- og respiratorisk mikrobiota hos patienter med CAP.

Sekundært mål:

1. At vurdere indflydelsen af ​​tarmmikrobiota på leukocyt-DNA-methylering hos patienter med CAP

Studere design:

Observationsundersøgelse blandt patienter med CAP på akutafdelingen og internmedicinsk afdeling på Academic Medical Center Amsterdam

Undersøgelsespopulation:

231 CAP-patienter og 115 raske forsøgspersoner over 18 år.

Metoder:

Fra ovennævnte patienter og raske frivillige vil der maksimalt blive udtaget 90 ml blod til analyse af DNA-methyleringsmønstre af oprensede monocytter og neutrofiler, som vil blive analyseret i forbindelse med DNA-methyltransferase og 11-elleve translokations (TET) aktivitet, RNA-genekspression og et udvalg af standard medfødte immunfunktionstests. Desuden vil isolerede monocytter og neutrofiler fra indlæggelsesprøver blive stimuleret in vitro med Streptococcus pneumoniae og Klebsiella pneumoniae. Derudover vil der blive opnået endetarms- og nasopharyngeale podninger for at undersøge rollen af ​​tarm- og luftvejsmikrobiotaens sammensætning og funktion. Patientmateriale vil blive indhentet ved inklusion og på dag 28, hvor patienter vil blive tilset i ambulatoriet til opfølgning.

Arten og omfanget af byrden og risiciene forbundet med deltagelse, fordele og gruppetilhørsforhold:

Deltagelse i denne observationsundersøgelse vil ikke gavne deltagerne og raske frivillige. Undersøgelsen vil give information om indflydelsen af ​​leukocyt-DNA-methylering samt tarm- og respiratorisk mikrobiota på værtens forsvarsmekanismer under CAP. Den opnåede viden kan potentielt gavne CAP-patienter i fremtiden ved at tilbyde alternative immunmodulerende behandlingsmuligheder, der modificerer værtsresponsen. Byrden og risiciene for patienter, der deltager i ELDER-BIOME-undersøgelsen, er minimale. Efterforskerne vil tage 90 ml blod, 4 rektale podninger og 2 nasopharyngeale podninger fordelt på to tidspunkter (præsentationsdag og dag 28 efter præsentation). Raske frivillige vil blive udsat for én blodprøve (70 ml) og 2 rektale - og 2 nasopharyngeale podninger på et tidspunkt.