L'effet de la méthylation de l'ADN des leucocytes et de la diversité des microbiomes sur les mécanismes de défense de l'hôte pendant la pneumonie acquise dans la communauté (ELDER-BIOME) (ELDER-BIOME)

Raisonnement:

La pneumonie communautaire (PAC) représente un problème de santé majeur et la mortalité et la morbidité associées aux pneumonies sévères restent considérables, malgré les soins de pointe.

Alors que le rôle de la méthylation altérée de l'ADN dans le cancer a été largement étudié, la connaissance de son impact sur la défense antibactérienne est très limitée. De plus, des études précliniques récentes ont montré que le microbiote intestinal et respiratoire contribue à la défense de l'hôte contre la pneumonie bactérienne.

Cette étude vise à explorer un domaine de recherche complètement nouveau reliant l'étendue de la méthylation de l'ADN dans les leucocytes sanguins (monocytes et neutrophiles) et la fonction du microbiote intestinal et respiratoire sur l'influence des réponses immunitaires innées et de la défense de l'hôte contre la PAC.

Objectifs principaux:

1. Obtenir un aperçu du rôle de la méthylation altérée de l'ADN dans les leucocytes sanguins (monocytes et neutrophiles) dans les réponses immunitaires innées et la défense de l'hôte chez les patients atteints de PAC.
2. Déterminer la composition et la fonction du microbiote intestinal et respiratoire chez les patients atteints de PAC.

Objectif secondaire :

1. Évaluer l'influence du microbiote intestinal sur la méthylation de l'ADN leucocytaire chez les patients atteints de PAC

Étudier le design:

Étude observationnelle auprès de patients atteints de CAP au service des urgences et au service de médecine interne du centre médical universitaire d'Amsterdam

Population étudiée :

231 patients CAP et 115 sujets sains de plus de 18 ans.

Méthodes :

Parmi les patients et les volontaires sains mentionnés ci-dessus, un maximum de 90 ml de sang sera prélevé pour analyser les schémas de méthylation de l'ADN des monocytes et des neutrophiles purifiés, qui seront analysés en relation avec l'ADN méthyltransférase et l'activité de translocation dix-onze (TET), l'expression du gène de l'ARN et une sélection de tests standard de la fonction immunitaire innée. De plus, les monocytes et les neutrophiles isolés des échantillons d'admission seront stimulés in vitro avec Streptococcus pneumoniae et Klebsiella pneumoniae. De plus, des prélèvements rectaux et nasopharyngés seront obtenus pour étudier le rôle de la composition et de la fonction du microbiote intestinal et respiratoire. Le matériel du patient sera obtenu lors de l'inclusion et au jour 28, lorsque les patients seront vus à la clinique externe pour un suivi.

Nature et ampleur du fardeau et des risques associés à la participation, aux avantages et à l'appartenance au groupe :

Participer à cette étude observationnelle ne profitera pas aux participants et aux volontaires sains. L'étude fournira des informations sur l'influence de la méthylation de l'ADN leucocytaire ainsi que du microbiote intestinal et respiratoire sur les mécanismes de défense de l'hôte pendant la PAC. Les connaissances acquises peuvent potentiellement bénéficier aux patients atteints de CAP à l'avenir en fournissant des options alternatives de traitement immunomodulateur qui modifient la réponse de l'hôte. Le fardeau et les risques pour les patients participant à l'étude ELDER-BIOME sont minimes. Les enquêteurs prélèveront 90 ml de sang, 4 écouvillons rectaux et 2 écouvillons nasopharyngés répartis sur deux points dans le temps (le jour de la présentation et le jour 28 après la présentation). Les volontaires sains seront soumis à une prise de sang (70 ml) et à 2 prélèvements rectaux et 2 nasopharyngés à un moment donné.