Effekten av leukocyt-Dna-metylering och mikrobiommångfald på värdförsvarsmekanismer under samhällsförvärvad lunginflammation (ELDER-BIOME) (ELDER-BIOME)

Logisk grund:

Samhällsförvärvad lunginflammation (CAP) representerar ett stort hälsoproblem och dödligheten och sjukligheten i samband med svår lunginflammation är fortfarande betydande, trots den senaste vården.

Även om rollen av förändrad DNA-metylering i cancer har studerats brett, är kunskapen om dess inverkan på det antibakteriella försvaret mycket begränsad. Dessutom har nya prekliniska studier visat att tarm- och andningsmikrobiotan bidrar till värdens försvar mot bakteriell lunginflammation.

Denna studie syftar till att utforska ett helt nytt forskningsområde som kopplar omfattningen av DNA-metylering i blodleukocyter (monocyter och neutrofiler) och funktionen hos tarm- och andningsmikrobiota på inverkan av medfödda immunsvar på och värdförsvar mot CAP.

Primära mål:

1. För att få insikt i rollen av förändrad DNA-metylering i blodleukocyter (monocyter och neutrofiler) i medfödda immunsvar och värdförsvar hos patienter med CAP.
2. Att bestämma sammansättningen och funktionen av tarm- och andningsmikrobiotan hos patienter med CAP.

Sekundärt mål:

1. Att bedöma inverkan av tarmmikrobiotan på leukocyt-DNA-metylering hos patienter med CAP

Studera design:

Observationsstudie bland patienter med CAP vid akutmottagningen och internmedicinska avdelningen vid Academic Medical Center Amsterdam

Studera befolkning:

231 CAP-patienter och 115 friska försökspersoner över 18 år.

Metoder:

Från ovan nämnda patienter och friska frivilliga kommer maximalt 90 ml blod att tas för att analysera DNA-metyleringsmönster av renade monocyter och neutrofiler, vilket kommer att analyseras i samband med DNA-metyltransferas och tio elva translokations (TET) aktivitet, RNA genuttryck. och ett urval av standardtester för medfödda immunfunktioner. Dessutom kommer isolerade monocyter och neutrofiler från intagningsprover att stimuleras in vitro med Streptococcus pneumoniae och Klebsiella pneumoniae. Dessutom kommer rektala och nasofaryngeala pinnprover att erhållas för att undersöka rollen av tarm- och andningsmikrobiotans sammansättning och funktion. Patientmaterial kommer att inhämtas vid inkludering och dag 28, då patienter kommer att ses på polikliniken för uppföljning.

Arten och omfattningen av bördan och riskerna som är förknippade med deltagande, nytta och gruppanknytning:

Att delta i denna observationsstudie kommer inte att gynna deltagarna och friska frivilliga. Studien kommer att ge information om inverkan av leukocyt-DNA-metylering samt tarm- och andningsmikrobiota på värdens försvarsmekanismer under CAP. Den kunskap som erhålls kan potentiellt gynna CAP-patienter i framtiden genom att tillhandahålla alternativa immunmodulerande behandlingsalternativ som modifierar värdsvaret. Belastningen och riskerna för patienter som deltar i ELDER-BIOME-studien är minimala. Utredarna kommer att ta 90 ml blod, 4 rektala pinnar och 2 nasofaryngeala pinnprover fördelade på två tidpunkter (presentationsdag och dag 28 efter presentation). Friska frivilliga kommer att utsättas för en blodprovtagning (70 ml) och 2 rektal- och 2 nasofaryngeala pinnprover vid en tidpunkt.